Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,511,332 | T→C | T31A (ACA→GCA) | yhfY ← | PRD domain protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,511,332 | 0 | T | C | 100.0% | 264.9 / NA | 74 | T31A (ACA→GCA) | yhfY | PRD domain protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (37/37); total (37/37) |
GCGCCAGTTCTGCCAGCAACTCGTTATCCAGCGGCTCTATTTCTTCACCACGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGTTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTC > NC_000913/3511200‑3511466 | gcgcCAGTTCTGCCAGCAACTCGTTATCCAGCGGCTCTATTTCTTCACCACGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAg > 1:278627/1‑139 (MQ=255) cgcCAGTTCTGCCAGCAACTCGTTATCCAGCGGCTCTATTTCTTCACCACGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGt > 1:185453/1‑139 (MQ=255) gTTCTGCCAGCAACTCGTTATCCAGCGGCTCTATTTCTTCACCACGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGtt > 2:216632/1‑139 (MQ=255) gTTCTGCCAGCAACTCGTTATCCAGCGGCTCTATTTCTTCACCACGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGtt > 2:458135/1‑139 (MQ=255) cTGCCAGCAACTCGTTATCCAGCGGCTCTATTTCTTCACCACGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTgac < 2:33786/139‑1 (MQ=255) cAGCTACTCGTTATCCAGCGGCTCTATTTCTTCACCACGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGAcc < 2:803951/139‑1 (MQ=255) cAGCAACTCGTTATCCAGCGGCTCTATTTCTTCACCACGGCGAATGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGAcc < 1:792927/139‑1 (MQ=255) cGGCTCTATTTCTTCACCACGTCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAg > 1:530295/1‑139 (MQ=255) cGGCTCTATTTCTTCACCACGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAg < 1:581496/139‑1 (MQ=255) ctctATTTCTTCACCACGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATg < 1:1092579/139‑1 (MQ=255) ctctATTTCTTCACCACGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATg < 1:458135/139‑1 (MQ=255) ctATTTCTTCACCACGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTc > 2:944764/1‑139 (MQ=255) caccacGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAAt < 2:185453/139‑1 (MQ=255) cacGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTg < 1:1009576/98‑1 (MQ=255) cacGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTg > 2:1009576/1‑98 (MQ=255) acGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGAcc > 1:602840/1‑103 (MQ=255) acGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGAcc < 2:602840/103‑1 (MQ=255) cGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACgc > 2:625922/1‑139 (MQ=255) aCTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGcatca > 2:420833/1‑104 (MQ=255) aCTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGcatca < 1:420833/104‑1 (MQ=255) gcgcATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCg > 2:550359/1‑139 (MQ=255) cACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAg < 2:281379/133‑1 (MQ=255) cACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAg > 1:281379/1‑133 (MQ=255) tCGCCATATGCGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAg > 2:564694/1‑139 (MQ=255) cGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGt < 2:36172/139‑1 (MQ=255) gCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTgacgac < 2:72174/77‑1 (MQ=255) gCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTgacgac > 1:72174/1‑77 (MQ=255) gCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCt < 2:935602/103‑1 (MQ=255) gCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCt > 1:935602/1‑103 (MQ=255) gCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTc > 1:240178/1‑139 (MQ=255) cATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTc < 2:1027627/99‑1 (MQ=255) cATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTc > 1:1027627/1‑99 (MQ=255) cATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTg < 1:1184015/139‑1 (MQ=255) atatGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTgg > 1:903158/1‑139 (MQ=255) tatGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGt < 2:278627/139‑1 (MQ=255) tgtgTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGttt < 1:944764/139‑1 (MQ=255) aTCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTa > 1:156756/1‑55 (MQ=255) aTCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTa < 2:156756/55‑1 (MQ=255) aTCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAg > 2:927761/1‑116 (MQ=255) aTCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAg < 1:927761/116‑1 (MQ=255) aTCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCatat > 2:663923/1‑139 (MQ=255) aTCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGACAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGGATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCaa > 2:757629/1‑114 (MQ=255) aTCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGACAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCaa < 1:757629/114‑1 (MQ=255) cGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCa > 1:1083627/1‑139 (MQ=255) ccATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGc > 1:546083/1‑72 (MQ=255) ccATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGc < 2:546083/72‑1 (MQ=255) ccATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGt > 2:304844/1‑127 (MQ=255) ccATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGa > 1:692664/1‑139 (MQ=255) ccATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTGTCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGt < 1:304844/127‑1 (MQ=255) cATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGAt < 1:835052/139‑1 (MQ=255) aTCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAg < 2:148898/78‑1 (MQ=255) aTCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAg > 1:148898/1‑78 (MQ=255) gTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCt < 1:89703/139‑1 (MQ=255) tGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCATTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCg < 1:1106838/96‑1 (MQ=255) tGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCg > 2:1106838/1‑96 (MQ=255) aCTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTtaata > 1:204895/1‑139 (MQ=255) cTGCGCACCGGCAGATTGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTtaataa < 1:564694/139‑1 (MQ=255) cTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGAcc < 1:853437/45‑1 (MQ=255) cTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGAcc > 2:853437/1‑45 (MQ=255) tGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTcc > 2:1214505/1‑68 (MQ=255) tGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTcc < 1:1214505/68‑1 (MQ=255) tGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGtt < 1:1174432/100‑1 (MQ=255) tGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGtt > 2:1174432/1‑100 (MQ=255) tGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAAc > 1:538043/1‑139 (MQ=255) tGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAAc > 1:654854/1‑139 (MQ=255) gcgcACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTc < 2:694215/66‑1 (MQ=255) gcgcACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTc > 1:694215/1‑66 (MQ=255) cgcACCGGCAGATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCGTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTc < 1:625922/139‑1 (MQ=255) gATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTc < 1:673274/55‑1 (MQ=255) gATGGCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTc > 2:673274/1‑55 (MQ=255) ggCACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTccc < 2:538043/139‑1 (MQ=255) cACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACgcctgcct < 1:1200413/70‑1 (MQ=255) cACTCTGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACgcctgcct > 2:1200413/1‑70 (MQ=255) tctGCTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCcactc < 2:432901/139‑1 (MQ=255) | GCGCCAGTTCTGCCAGCAACTCGTTATCCAGCGGCTCTATTTCTTCACCACGGCGACTGCGCATCAGTGCACTCGCCATATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGTTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTC > NC_000913/3511200‑3511466 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |