Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,373,635 | G→C | Y200* (TAC→TAG) | yjeJ ← | uncharacterized protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,373,635 | 0 | G | C | 100.0% | 187.3 / NA | 52 | Y200* (TAC→TAG) | yjeJ | uncharacterized protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (23/29); total (23/29) |
CGCGAGTTTTTTCAGTCGTGGGCTGAAATCAAGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGGTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGATTGCCATTGTCCTGGCAGTCAACGTCGTATAACGGCAGGAAATCTAACAGTG > NC_000913/4373500‑4373759 | cgcgAGTTTTTTCAGTCGTGGGCTGAAATCAAGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTaa < 2:1179659/139‑1 (MQ=255) gcgAGTTTTTTCAGTCGTGGGCTGAAATCAAGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTaaa > 2:642273/1‑139 (MQ=255) cgAGTTTTTTCAGTCGTGGGCTGAAATCAAGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAg > 1:29867/1‑139 (MQ=255) aGTCTTTTCAGTCGTGGGCTGAAATTAAGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCACTAAATTGTTCTTTGTCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCa < 2:787669/139‑1 (MQ=255) ttttCAGTCGTGGGCTGAAATCAAGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGc < 1:478423/139‑1 (MQ=255) tttCAGTCGTGGGCTGAAATCAAGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGcc > 1:32020/1‑139 (MQ=255) aGTCGTGGGCTGAAATCAAGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGAt < 1:998815/139‑1 (MQ=255) aGTCGTGGGCTGAAATCAAGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGAt < 2:29867/139‑1 (MQ=255) gggCTGAAATCAAGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGt < 1:1060588/139‑1 (MQ=255) ggCTGAAATCAAGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAg > 1:1210836/1‑121 (MQ=255) ggCTGAAATCAAGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAg < 2:1210836/121‑1 (MQ=255) gCTGAAATCAAGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCg < 1:642273/139‑1 (MQ=255) aGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTAt < 2:33735/139‑1 (MQ=255) aGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTAt > 1:162876/1‑139 (MQ=255) gCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATg > 1:319016/1‑139 (MQ=255) ggCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGc > 1:103100/1‑109 (MQ=255) ggCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGc < 2:103100/109‑1 (MQ=255) agCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCa > 1:761831/2‑139 (MQ=255) aGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTcc > 2:1070015/1‑139 (MQ=255) ttCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGaa < 2:319016/139‑1 (MQ=255) aTTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAgg < 2:761831/139‑1 (MQ=255) ttCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGgtg < 2:1082732/139‑1 (MQ=255) ttCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGgtg < 2:162876/139‑1 (MQ=255) aCCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCa < 2:787023/80‑1 (MQ=255) aCCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCa > 1:787023/1‑80 (MQ=255) cGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGaa < 1:73652/121‑1 (MQ=255) cGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGaa > 2:73652/1‑121 (MQ=255) cGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGa > 2:1029076/1‑139 (MQ=255) gTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTc < 2:693774/128‑1 (MQ=255) gTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTc > 1:693774/1‑128 (MQ=255) ttCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGATTGCCa < 1:497837/139‑1 (MQ=255) cgcgTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGaa < 2:447164/111‑1 (MQ=255) cgcgTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGaa > 1:447164/1‑111 (MQ=255) cgcgTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGATTGCCATTGt > 2:300475/1‑139 (MQ=255) tttCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGATTGCCATTGTCCTgg < 2:713936/139‑1 (MQ=255) gcgcCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGtt < 2:956474/91‑1 (MQ=255) gcgcCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGtt > 1:956474/1‑91 (MQ=255) cgccgcTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGATTGCCATTGTCCTGGCAGTCAAcg > 2:981355/1‑137 (MQ=255) cgccgcTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGATTGCCATTGTCCTGGCAGTCAAcg < 1:981355/137‑1 (MQ=255) cTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAg > 2:482640/1‑66 (MQ=255) cTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAg < 1:482640/66‑1 (MQ=255) cTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGa < 1:311180/108‑1 (MQ=255) cTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGa > 2:311180/1‑108 (MQ=255) tGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGATTGCCATTGTCCTGGCAGTCAACGTCGTATAACGGCa < 1:1070015/139‑1 (MQ=255) tCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGATTGCCATTGTCCTGGCAGTCAACGTCGTATAACGGCAGGAAATCTAACAGTg > 2:711695/1‑139 (MQ=255) tCATCTTTAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGATTGCCATTGTCCTGGCAGTCAACGTCGTATAACGGCAGGAAATCTAACAGTg < 2:211955/139‑1 (MQ=255) tAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGATTGCCAt < 2:897738/87‑1 (MQ=255) tAAAGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGATTGCCAt > 1:897738/1‑87 (MQ=255) aaaGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAAt < 1:302690/62‑1 (MQ=255) aaaGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAAt > 2:302690/1‑62 (MQ=255) aaaGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGATTGCCATTGTCCTGGCAGTCaa > 1:975536/1‑101 (MQ=255) aaaGCGCTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGATTGCCATTGTCCTGGCAGTCaa < 2:975536/101‑1 (MQ=255) | CGCGAGTTTTTTCAGTCGTGGGCTGAAATCAAGCATTCGGCGAGTGATCGCTTCTATTTCTTTACCCGGCGTTGCTTCACGCGTTTTCACCACTGCGCCGCTAAATTGTTCTTTGCCACTTTCATCTTTAAAGCGGTAAAGCACCGCCAGATAATGGTCGAACAAGTTATGTTTCCATTCCGGTTGGGAATAGGTGTCATATTCCAGATTGCCATTGTCCTGGCAGTCAACGTCGTATAACGGCAGGAAATCTAACAGTG > NC_000913/4373500‑4373759 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |