| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,208,534 | Δ1 bp | coding (403/414 nt);coding (586/603 nt) | tfaP → tfaE ← |
e14 prophage, uncharacterized protein e14 prophage, putative tail fiber assembly protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,208,534 | 0 | C | . | 100.0% | 323.9 / NA | 84 | coding (403/414 nt) coding (586/603 nt) | tfaP tfaE | e14 prophage, uncharacterized protein e14 prophage, putative tail fiber assembly protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (44/40); total (44/40) | |||||||||||
GAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCA > NC_000913/1208415‑1208665 | gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:1712199/139‑1 (MQ=255)gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:1201942/139‑1 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGt > 2:95042/1‑139 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGt < 1:95042/139‑1 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGt > 1:724714/1‑139 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGt > 1:150759/1‑139 (MQ=255) aagaagATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTgg < 1:490122/139‑1 (MQ=255) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCt > 1:982367/1‑139 (MQ=255) aTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTg > 1:1430117/1‑139 (MQ=255) tGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGt < 2:150759/139‑1 (MQ=255) tGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGt > 2:1309933/1‑139 (MQ=255) aaaCAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTc > 2:1136564/1‑139 (MQ=255) aaaCAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTc > 2:864368/1‑139 (MQ=255) aCAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCAc < 2:1091320/139‑1 (MQ=255) tataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGgcg > 1:837891/1‑110 (MQ=255) tataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:837891/110‑1 (MQ=255) 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ccAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGt > 1:650278/1‑139 (MQ=255) cAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTc < 2:283042/139‑1 (MQ=255) cAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTc < 2:1464004/139‑1 (MQ=255) cAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTc < 2:750699/139‑1 (MQ=255) cAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTc < 1:1309933/139‑1 (MQ=255) gATATTGAATGGCTGACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCg < 1:359460/139‑1 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1:52295/139‑1 (MQ=255) cGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCa > 1:188508/1‑139 (MQ=255) | GAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCA > NC_000913/1208415‑1208665 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |