Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | NC_000913 | 3,240,984 | (G)7→10 | coding (1041/1245 nt) | sstT → | sodium:serine/threonine symporter |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3240977 | 3 (0.040) | 82 (1.120) +GGG |
49/188 | 0.2 | 96.5% | coding (1034/1245 nt) | sstT | sodium:serine/threonine symporter |
? | NC_000913 | 3240978 = | 3 (0.040) | coding (1035/1245 nt) | sstT | sodium:serine/threonine symporter |
CGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTC > NC_000913/3240845‑3241109 | ggcgcagcaatcactattaccgtgttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcgggggggg > 2:625738‑M2/135‑139 (MQ=255) ggcgcagcaatcactattaccgtgttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcgggggggg > 1:1383820‑M2/135‑139 (MQ=255) gcgcagcaatcactattaccgtgttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggggggggg > 1:951011‑M2/134‑139 (MQ=255) agcaatcactattaccgtgttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcgggggggggtctc < 2:1073564‑M2/10‑5 (MQ=255) atcactattaccgtgttgacgctggctgcggttaatatgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTctgct < 1:1196726‑M2/15‑1 (MQ=255) tattaccgtgttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGa < 2:704904‑M2/20‑1 (MQ=255) attaccgtgttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGAt > 2:1067338‑M2/119‑139 (MQ=255) ccgtgttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 2:335009‑M2/25‑1 (MQ=255) ccgtgttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 2:1383820‑M2/25‑1 (MQ=255) ccgtgttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgcggttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 2:70219‑M2/25‑1 (MQ=255) tgttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTg > 1:1353166‑M2/112‑139 (MQ=255) gttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTgg < 2:1476843‑M2/29‑1 (MQ=255) gttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTgg < 2:1569656‑M2/29‑1 (MQ=255) ttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTctgctg > 2:198321‑M2/110‑125 (MQ=255) ttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 2:951011‑M2/30‑1 (MQ=255) ttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 1:367869‑M2/30‑1 (MQ=255) ttgacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcggggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTctgctg < 1:198321‑M2/16‑1 (MQ=255) gtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 1:625738/139‑1 (MQ=255) gacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt < 1:981541‑M2/32‑1 (MQ=255) gacgctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt > 2:1707644‑M2/108‑139 (MQ=255) gctggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTa > 2:1074737‑M2/105‑139 (MQ=255) tggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAat < 1:1318095‑M2/37‑1 (MQ=255) ggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcgggggggg < 2:1505058‑M2/5‑1 (MQ=255) ggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcgggggggg > 1:1505058‑M2/103‑107 (MQ=255) ggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggggg > 2:1489473‑M2/103‑104 (MQ=255) ggctgcggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggggg < 1:1489473‑M2/2‑1 (MQ=255) cggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcgggggggggtctc < 2:338563‑M2/10‑5 (MQ=255) cggttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcgggggggggtctc > 1:338563‑M2/98‑103 (MQ=255) gttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt > 1:412946‑M2/95‑126 (MQ=255) gttaatacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt < 2:412946‑M2/32‑1 (MQ=255) atacgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTAtt > 2:1862389‑M2/91‑139 (MQ=255) cgctgggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCg < 2:1839021‑M2/52‑1 (MQ=255) cgctgggtattccgggcgatctgcccagggcgctgctgttgggcgtgttggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcggggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCg < 1:211285‑M2/52‑1 (MQ=255) gggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgtctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTctgct < 1:572123‑M2/15‑1 (MQ=255) gggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgtctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTctgct > 2:572123‑M2/84‑98 (MQ=255) gggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACt < 2:1601004‑M2/27‑1 (MQ=255) gggtattccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACt > 1:1601004‑M2/84‑110 (MQ=255) ttccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa > 2:653006‑M2/79‑103 (MQ=255) ttccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 1:653006‑M2/25‑1 (MQ=255) ccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGc > 1:989730‑M2/77‑139 (MQ=255) ccggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGc < 1:1862389‑M2/63‑1 (MQ=255) cggtcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGcc > 2:1626559‑M2/76‑139 (MQ=255) tcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcgggggggggt < 1:661011‑M2/7‑2 (MQ=255) tcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcgggggggggt > 2:661011‑M2/74‑79 (MQ=255) tcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggggggg < 2:662366‑M2/4‑1 (MQ=255) tcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggggggg > 1:662366‑M2/74‑77 (MQ=255) tcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcgggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc > 1:729491‑M2/74‑103 (MQ=255) tcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcgggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 2:729491‑M2/30‑1 (MQ=255) tcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 2:409026‑M2/25‑1 (MQ=255) tcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa > 1:409026‑M2/73‑97 (MQ=255) tcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt < 2:991683‑M2/32‑1 (MQ=255) tcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt > 1:991683‑M2/73‑104 (MQ=255) tcgatctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATg > 2:1549541‑M2/73‑139 (MQ=255) tctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTAtt < 2:1310066‑M2/49‑1 (MQ=255) tctgcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTAtt > 1:1310066‑M2/69‑117 (MQ=255) gcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggggg < 1:330770‑M2/2‑1 (MQ=255) gcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggggg > 2:330770‑M2/67‑68 (MQ=255) gcccacggcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcttccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATCTCGCCATGCAggtgg < 1:1254842‑M2/74‑1 (MQ=255) gcgctgctgttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCAATGCAGGTGGTTGCCGt < 1:1074737‑M2/81‑1 (MQ=255) ttgagcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCCCTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGGACGATATCGCCCTGCCGGTGGTTGCCGGCGGCGTTat > 1:273150‑M2/50‑139 (MQ=255) agcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatcat < 2:398025‑M2/93‑1 (MQ=255) agcgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatcat < 1:1626559‑M2/93‑1 (MQ=255) cgtggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCg < 1:346112‑M2/95‑1 (MQ=255) tggtggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGa > 1:375035‑M2/43‑99 (MQ=255) tggtggcttctcggtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGa < 2:375035‑M2/57‑1 (MQ=255) tggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcgggg > 1:522937‑M2/41‑41 (MQ=255) tggcttctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcgggg < 2:522937‑M2/1‑1 (MQ=255) ctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa > 2:903501‑M2/34‑58 (MQ=255) ctctgtgtgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 1:903501‑M2/25‑1 (MQ=255) tgcctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCtt > 2:284550‑M2/27‑139 (MQ=255) tgCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg > 1:627569/1‑123 (MQ=255) tgCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 2:627569/123‑1 (MQ=255) cctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGATGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGc > 1:1183843‑M2/25‑139 (MQ=255) ctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 2:1367048‑M2/30‑1 (MQ=255) ctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc > 1:1367048‑M2/24‑53 (MQ=255) ctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGaa > 2:604177‑M2/24‑77 (MQ=255) ctgtggcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGaa < 1:604177‑M2/54‑1 (MQ=255) gcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCg < 1:156664‑M2/62‑1 (MQ=255) gcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCg > 2:156664‑M2/19‑80 (MQ=255) gcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAAcc > 1:893666‑M2/19‑139 (MQ=255) gcgcatccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAAcc > 2:1064470‑M2/19‑139 (MQ=255) tccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGt > 2:727331‑M2/14‑54 (MQ=255) tccggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGt < 1:727331‑M2/41‑1 (MQ=255) ggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGaa < 1:1549541‑M2/129‑1 (MQ=255) ggcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGaa < 1:685263‑M2/129‑1 (MQ=255) gcgtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAAc < 1:1067338‑M2/130‑1 (MQ=255) gtggcggGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAActc < 1:1707644‑M2/132‑1 (MQ=255) | CGGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTC > NC_000913/3240845‑3241109 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |