Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 610,746 | C→T | A583A (GCG→GCA) | fepA ← | ferrienterobactin outer membrane transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 610,746 | 0 | C | T | 100.0% | 252.2 / NA | 76 | A583A (GCG→GCA) | fepA | ferrienterobactin outer membrane transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (43/33); total (43/33) |
CGTATACTCCGGGATGATCGACAAACGGTCGCCCGTGGTTTTGTTTTCACTCTTCAGCATATAAGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACCGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTACGGAACCAGGTGACGCCCGCCAGCCACCCGTCGCGTTTG > NC_000913/610611‑610881 | cGTATACTCCGGGATGATCGACAAACGGTCGCCCGTGGTTTTGTTTTCACTCTTCAGCATATAAGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCt > 2:1698435/1‑139 (MQ=255) taCTCCGGGATGATCGACAAACGGTCGCCCGTGGTTTTGTTTTCACTCTTCAGCATATAAGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCg < 2:86423/139‑1 (MQ=255) gatCGACAAACGGTCGCCCGTGGTTTTGTTTTCACTCTTCAGCATATAAGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATcc < 2:476847/139‑1 (MQ=255) atCGACAAACGGTCGCCCGTGGTTTTGTTTTCACTCTTCAGCATATAAGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATccc > 1:1074125/1‑139 (MQ=255) tCGACAAACGGTCTCCCTTGGTTTTGTTTTCACTCTTCAGCATATAAGTGATGTTATTGGCCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCa < 1:303878/139‑1 (MQ=255) tCGACAAACGGTCGCCCGTGGTTTTGTTTTCACTCTTCAGCATATAAGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCa < 1:939595/139‑1 (MQ=255) tCGACAAACGGTCGCCCGTGGTTTTGTTTTCACTCTTCAGCATATAAGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCa > 2:1128263/1‑139 (MQ=255) tCGACAAACGGTCGCCCGTGGTTTTGTTTTCACTCTTCAGCATATAAGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGCTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCa > 2:1795434/1‑139 (MQ=255) cGACAAACGGTCGCCCGTGGTTTTGTTTTCACTCTTCAGCATATAAGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCAc < 2:717659/139‑1 (MQ=255) cccGTGGTTTTGTTTTCACTCTTCAGCATATAAGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACg > 1:396023/1‑117 (MQ=255) cccGTGGTTTTGTTTTCACTCTTCAGCATATAAGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACg < 2:396023/117‑1 (MQ=255) tctTCAGCATATAAGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGccc < 2:1074125/139‑1 (MQ=255) aaGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTAt < 1:1528024/90‑1 (MQ=255) aaGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTAt > 2:1528024/1‑90 (MQ=255) aaGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGc < 2:719854/125‑1 (MQ=255) aaGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGc > 1:719854/1‑125 (MQ=255) aaGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATa > 2:328990/1‑139 (MQ=255) aaGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATa > 1:15069/1‑139 (MQ=255) aaGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATa > 1:119093/1‑139 (MQ=255) aTGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATcc > 1:1648556/1‑87 (MQ=255) aTGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATcc > 2:65127/1‑87 (MQ=255) aTGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATcc < 2:1648556/87‑1 (MQ=255) aTGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATcc < 1:65127/87‑1 (MQ=255) aTGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGc < 1:1523616/128‑1 (MQ=255) aTGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGc > 2:1523616/1‑128 (MQ=255) aTGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCg > 2:276118/1‑139 (MQ=255) tGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATcc > 2:647969/1‑86 (MQ=255) tGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATcc < 1:647969/86‑1 (MQ=255) aTTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCa > 1:279983/1‑139 (MQ=255) ttGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCaa > 1:1577646/1‑139 (MQ=255) cacaTCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGccc < 1:592476/110‑1 (MQ=255) cacaTCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGccc > 2:592476/1‑110 (MQ=255) acaTCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCt > 2:1166921/1‑59 (MQ=255) acaTCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCt < 1:1166921/59‑1 (MQ=255) caTCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGtt < 2:1398471/69‑1 (MQ=255) caTCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGtt > 1:1398471/1‑69 (MQ=255) caTCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCAc < 1:993405/76‑1 (MQ=255) caTCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCAc > 2:993405/1‑76 (MQ=255) caTCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTg > 2:487000/1‑139 (MQ=255) tCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCg > 1:1854427/1‑139 (MQ=255) tCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCg < 2:1577646/139‑1 (MQ=255) ccGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGccc > 2:1062069/1‑103 (MQ=255) ccGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGccc < 1:1062069/103‑1 (MQ=255) cGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCa < 2:1174974/59‑1 (MQ=255) cGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCa > 1:1174974/1‑59 (MQ=255) cGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATaa > 1:516913/1‑139 (MQ=255) cGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATaa > 1:1192781/1‑139 (MQ=255) tttCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATc > 1:1737815/1‑139 (MQ=255) cGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGtt > 1:384098/1‑139 (MQ=255) cGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGtt > 1:1522670/1‑139 (MQ=255) gCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTa < 2:1737815/139‑1 (MQ=255) gCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTa < 1:1128263/139‑1 (MQ=255) cTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGt > 2:823862/1‑77 (MQ=255) cTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGt < 1:823862/77‑1 (MQ=255) cTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACa > 1:1108153/1‑99 (MQ=255) cTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACa < 2:1108153/99‑1 (MQ=255) cTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTAc > 1:733524/1‑139 (MQ=255) cTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGAGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTAc > 1:1345486/1‑139 (MQ=255) aCCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTACGGa > 2:660054/1‑139 (MQ=255) cGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTACGGAAc < 1:276118/139‑1 (MQ=255) aCGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCGCTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTACGGAACCAgg < 2:733524/139‑1 (MQ=255) ttAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCa > 2:151527/1‑49 (MQ=255) ttAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCa < 1:151527/49‑1 (MQ=255) ttAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTACGGAACCAGGTGAc > 1:1058398/1‑139 (MQ=255) aaCGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCa > 1:1415579/1‑47 (MQ=255) aaCGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCa < 2:1415579/47‑1 (MQ=255) aCGATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTACGGAACCAGGTGAcgcc < 2:1854427/139‑1 (MQ=255) gATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCa < 2:56181/44‑1 (MQ=255) gATCCTTCCAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCa > 1:56181/1‑44 (MQ=255) tggaaggACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTACGGAACCAGGTGACGCCCgccag > 1:152195/7‑139 (MQ=255) ccAGACCTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATTGTTACGGAACCAGGTGACGCCCgccagcca < 1:1698435/139‑1 (MQ=255) ccTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTACGGAACCAGGTGACGCCCGCCAGCCACCCGt < 1:487000/139‑1 (MQ=255) cTTCAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTACGGAACCAGGTGACGCCCGCCAGCCACCCGTc > 2:416202/1‑139 (MQ=255) cAACCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTACGGAACCAGGTGACGCCCGCCAGCCACCCGTcgcg > 2:677574/1‑139 (MQ=255) aaCCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTa < 2:327466/62‑1 (MQ=255) aaCCACTGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTa > 1:327466/1‑62 (MQ=255) cactGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTACGGAACCAGGTGACGCCCGCCAGCCACCCGTCGCGTTTg < 2:119093/139‑1 (MQ=255) | CGTATACTCCGGGATGATCGACAAACGGTCGCCCGTGGTTTTGTTTTCACTCTTCAGCATATAAGTGATGTTATTGGTCCACATCACCGTTTCGCTAACCGGTACGTTTAACGATCCTTCCAGACCTTCAACCACCGCTTTCGGCACGTTATCCCACTGATAGAGATCGGTGCCGACTGCGTTTTGCCCTACAGCCACATAGCCCGCTTCAATCTTATTGCGATAATCGTTACGGAACCAGGTGACGCCCGCCAGCCACCCGTCGCGTTTG > NC_000913/610611‑610881 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |