| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,006,491 | C→T | V180V (GTC→GTT) *370* (TAG→TAA) |
zapC → ycbX ← |
FtsZ stabilizer 6‑N‑hydroxylaminopurine detoxification oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,006,491 | 0 | C | T | 100.0% | 176.5 / NA | 55 | V180V (GTC→GTT) *370* (TAG→TAA) | zapC ycbX | FtsZ stabilizer 6‑N‑hydroxylaminopurine detoxification oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (28/27); total (28/27) | |||||||||||
CTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCAGCGGCGTGACTTCGCCTTCTAAAAGCTGAACACGGCAACTTCCACA > NC_000913/1006360‑1006619 | cTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACgcgc < 1:1514055/139‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGcc > 2:780825/1‑139 (MQ=255) ctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACGGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAg > 2:1482144/1‑139 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTg > 2:170814/1‑139 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 1:780825/139‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 2:627191/139‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:795916/139‑1 (MQ=255) ccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTc < 2:733688/139‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa > 1:1813183/1‑139 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 1:1282389/139‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 1:381951/139‑1 (MQ=255) cgcgATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 2:1655657/1‑134 (MQ=255) cgcgATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa < 1:1655657/134‑1 (MQ=255) cgcgATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGa > 1:15450/1‑138 (MQ=255) cgcgATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGa < 2:15450/138‑1 (MQ=255) tGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTg > 2:604194/1‑139 (MQ=255) gACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTg < 1:1183591/94‑1 (MQ=255) gACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTg > 2:1183591/1‑94 (MQ=255) aCGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGcc < 1:170814/139‑1 (MQ=255) cGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGccc > 1:832290/1‑139 (MQ=255) tAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTacac > 2:1801264/1‑101 (MQ=255) tAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTacac < 1:1801264/101‑1 (MQ=255) tGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACGGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGAtttttt < 1:1482144/139‑1 (MQ=255) aaCGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCa > 2:1883557/1‑139 (MQ=255) cAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGcc < 2:1399811/61‑1 (MQ=255) cAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGcc > 1:1399811/1‑61 (MQ=255) cAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTacac > 2:24044/1‑86 (MQ=255) cAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTacac < 1:24044/86‑1 (MQ=255) gAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCAGCGGCGTGACt < 2:1301571/139‑1 (MQ=255) aaCCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCAGCGGCGTGACTTc > 2:182755/1‑139 (MQ=255) cAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCGTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACtt < 2:1166201/53‑1 (MQ=255) cAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACtt > 1:1166201/1‑53 (MQ=255) cAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACtt < 2:1120601/53‑1 (MQ=255) cAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 2:1058832/1‑60 (MQ=255) cAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 1:1058832/60‑1 (MQ=255) cAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 2:150510/60‑1 (MQ=255) cAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:150510/1‑60 (MQ=255) cAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGa < 1:1773613/87‑1 (MQ=255) cAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGa > 2:1773613/1‑87 (MQ=255) cAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCAGCGGCGTGACTTCGCCtt > 2:374240/1‑139 (MQ=255) cAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCAGCGGCGTGACTTCGCCtt > 1:51560/1‑139 (MQ=255) cAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCAAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACtt > 1:1120601/1‑53 (MQ=255) aGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCAGCGGCGTGACTTCGCCTTc < 2:1813183/139‑1 (MQ=255) gACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa < 1:1668817/76‑1 (MQ=255) gACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa > 2:1668817/1‑76 (MQ=255) aCAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa > 1:620264/1‑65 (MQ=255) aCAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:620264/65‑1 (MQ=255) aCAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCAGCGGCGTGACTTCGCCTTCt > 2:1756702/1‑128 (MQ=255) aCAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCAGCGGCGTGACTTCGCCTTCt < 1:1756702/128‑1 (MQ=255) aGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCAGCGGCGTGACTTCGCCTTCTAAAAGCTGAacac > 1:88486/1‑139 (MQ=255) cTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCAGCGGCGTGACTTCGCCTTCTAAAAGCTGAACACgg > 2:602611/1‑139 (MQ=255) ttCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCAGCGGCGTGACTTCGCCTTCTAAAAGCTGAACACGGc < 1:604194/139‑1 (MQ=255) tCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCAGCGGCGTGACTTCGCCTTCTAAAAGCTGAACACGGCa < 1:602611/139‑1 (MQ=255) gAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCAGCGGCGTGACTTCGCCTTCTAAAAGCTGAACACGGCAACTTCcac > 1:693415/1‑139 (MQ=255) aaCAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCAGCGGCGTGACTTCGCCTTCTAAAAGCTGAACACGGCAACTTCcaca > 2:339565/1‑139 (MQ=255) | CTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCCATCATCGCCCATTGCTGATTTTTTCAGCGGCGTGACTTCGCCTTCTAAAAGCTGAACACGGCAACTTCCACA > NC_000913/1006360‑1006619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |