| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 169,645 | A→G | Y721C (TAC→TGC) | fhuA → | ferrichrome outer membrane transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 169,645 | 0 | A | G | 100.0% | 390.7 / NA | 108 | Y721C (TAC→TGC) | fhuA | ferrichrome outer membrane transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (54/54); total (54/54) | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
ATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTG > NC_000913/169516‑169775 | aTCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAg > 2:564628/1‑139 (MQ=255)aTCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAg < 1:1324045/139‑1 (MQ=255) tCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAgc < 2:1716455/139‑1 (MQ=255) tCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAgc > 1:133267/1‑139 (MQ=255) cTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCtt < 2:133267/139‑1 (MQ=255) tAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCttt > 1:1780242/1‑139 (MQ=255) aaCTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTAAGTTATGATCTGGCGCGACTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCGTTa < 1:1208063/139‑1 (MQ=255) ttAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTa > 2:629793/1‑139 (MQ=255) aGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgc < 1:629793/139‑1 (MQ=255) aGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgc < 1:947994/139‑1 (MQ=255) ggAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgc < 2:1448072/135‑1 (MQ=255) ggAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgc > 1:1448072/1‑135 (MQ=255) ataCGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTgggg < 1:1640326/139‑1 (MQ=255) ggTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCa < 2:1760353/139‑1 (MQ=255) gTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAg < 2:1820298/139‑1 (MQ=255) gTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAgc < 1:182725/102‑1 (MQ=255) gTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAgc > 2:182725/1‑102 (MQ=255) gTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTa < 2:663343/109‑1 (MQ=255) gTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTa > 1:663343/1‑109 (MQ=255) gTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAAc > 2:551684/1‑139 (MQ=255) gTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAAc > 1:1608/1‑139 (MQ=255) gTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAAc > 2:313160/1‑139 (MQ=255) gTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAAc > 2:1881982/1‑139 (MQ=255) tGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAgctgct > 1:1337822/1‑105 (MQ=255) tGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAgctgct < 2:1337822/105‑1 (MQ=255) tGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACg < 1:313160/139‑1 (MQ=255) tGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACg > 1:681771/1‑139 (MQ=255) gTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgc < 1:1034295/112‑1 (MQ=255) gTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTc > 2:1739444/1‑139 (MQ=255) gTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTc > 2:727922/1‑139 (MQ=255) aGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGtt < 1:727922/139‑1 (MQ=255) tATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTgcaaccg > 2:570950/1‑139 (MQ=255) tATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTgcaaccg > 2:600796/1‑139 (MQ=255) tGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTgcaaccgca < 2:1608/139‑1 (MQ=255) tGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCtt < 1:600796/139‑1 (MQ=255) ggCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTa > 1:364353/1‑83 (MQ=255) ggCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTa < 2:364353/83‑1 (MQ=255) ggCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTc > 2:1627978/1‑139 (MQ=255) ggCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTc < 2:222020/139‑1 (MQ=255) gcgcGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAac > 1:38630/1‑84 (MQ=255) gcgcGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAac < 2:38630/84‑1 (MQ=255) gcgcGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTcc > 1:725317/1‑139 (MQ=255) gcgcGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTcc > 2:1160611/1‑139 (MQ=255) gcgcGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTcc > 2:1341283/1‑139 (MQ=255) cgcgAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTgggg < 2:1318685/103‑1 (MQ=255) cgcgAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTgggg > 1:1318685/1‑103 (MQ=255) cgcgAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAA‑CTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAg < 1:1186344/107‑1 (MQ=255) cgcgAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAA‑CTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAg > 2:1186344/1‑107 (MQ=255) cgcgAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTACATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCg > 1:892329/1‑139 (MQ=255) gAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGttt < 2:725317/139‑1 (MQ=255) gTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCt < 1:1627978/139‑1 (MQ=255) gCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCGGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGttt < 1:997312/133‑1 (MQ=255) cATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAAttt > 1:815970/1‑139 (MQ=255) cATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTACATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAAttt < 2:892329/139‑1 (MQ=255) ggctCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCtttt < 1:570950/139‑1 (MQ=255) ctCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGACCGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTgg > 1:1297492/1‑139 (MQ=255) tCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTggg < 1:551684/139‑1 (MQ=255) aaCGTGGCGCTGCA‑GTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCAc > 1:643669/1‑139 (MQ=255) aCGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCAc > 1:386992/1‑139 (MQ=255) tGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGa < 1:1341283/139‑1 (MQ=255) gcgcTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTgc < 1:1590775/95‑1 (MQ=255) gcgcTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTgc > 2:1590775/1‑95 (MQ=255) gcgcTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGAtt > 2:630534/1‑139 (MQ=255) tGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTa > 1:1869479/1‑48 (MQ=255) tGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTa < 2:1869479/48‑1 (MQ=255) gCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGt < 1:591889/139‑1 (MQ=255) cATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGt > 1:1324697/1‑78 (MQ=255) cATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGt < 2:1324697/78‑1 (MQ=255) tGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGcc < 2:386992/139‑1 (MQ=255) tAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTa < 2:1269402/41‑1 (MQ=255) tAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTa > 1:1269402/1‑41 (MQ=255) acCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCa > 1:1589404/1‑62 (MQ=255) acCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCa < 2:1589404/62‑1 (MQ=255) acCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTcac < 2:1297492/139‑1 (MQ=255) acCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTcac > 1:1765895/1‑139 (MQ=255) tGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGcc > 1:1863601/1‑128 (MQ=255) gatCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAAGACTTATGGCTGCTTCt > 1:81575/3‑50 (MQ=255) gTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgc < 1:85912/43‑1 (MQ=255) gTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgc > 1:1194079/1‑43 (MQ=255) gTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgc > 2:85912/1‑43 (MQ=255) gTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgc < 2:1194079/43‑1 (MQ=255) gTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCt < 2:81575/50‑1 (MQ=255) gTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCtt < 1:446391/87‑1 (MQ=255) gTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCtt > 2:446391/1‑87 (MQ=255) gTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGcc < 2:1353485/127‑1 (MQ=255) ttCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTaa > 1:1161014/1‑96 (MQ=255) ttCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTaa < 2:1161014/96‑1 (MQ=255) ttCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAAttt > 2:71989/1‑99 (MQ=255) ttCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAAttt < 1:71989/99‑1 (MQ=255) ttCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTggg > 2:481377/1‑109 (MQ=255) ttCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTggg < 1:481377/109‑1 (MQ=255) gATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGc < 2:1780242/139‑1 (MQ=255) tCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTg < 2:1765895/139‑1 (MQ=255) tCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTg < 2:815970/139‑1 (MQ=255) gTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGcc > 1:1625348/1‑119 (MQ=255) gTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGcc < 2:1625348/119‑1 (MQ=255) gAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGt < 2:712302/59‑1 (MQ=255) gAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGt > 1:712302/1‑59 (MQ=255) aaTGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAAttt > 2:347940/1‑89 (MQ=255) aaTGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAAttt < 1:347940/89‑1 (MQ=255) | ATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTG > NC_000913/169516‑169775 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |