Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,510,886 | G→A | *419* (TAG→TAA) | yfeO → | putative ion channel protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,510,886 | 0 | G | A | 100.0% | 316.2 / NA | 96 | *419* (TAG→TAA) | yfeO | putative ion channel protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (45/51); total (45/51) |
GTTGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATAACAATGTTCAGGTCACTGTTT > NC_000913/2510758‑2511018 | gTTGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGc < 1:537149/139‑1 (MQ=255) ttGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGct < 2:397502/139‑1 (MQ=255) ttGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGct < 1:610591/139‑1 (MQ=255) ttGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGct < 1:1315934/139‑1 (MQ=255) cccAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCt > 2:393356/1‑139 (MQ=255) ccAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCtt < 1:1748606/139‑1 (MQ=255) aaTACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTa < 2:655703/139‑1 (MQ=255) aaTACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTa < 1:1858528/139‑1 (MQ=255) aaTACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTa < 1:1665126/139‑1 (MQ=255) cacaTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTa < 1:1430819/134‑1 (MQ=255) cacaTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTa > 2:1430819/1‑134 (MQ=255) cacaTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGAtt > 2:1021561/1‑139 (MQ=255) acaTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGAttt < 2:1538314/139‑1 (MQ=255) acaTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGAttt < 1:1021561/139‑1 (MQ=255) caTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTa > 2:742575/1‑139 (MQ=255) tGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCAAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAaga > 1:1139869/1‑139 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2:1152415/1‑139 (MQ=255) cTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGctc > 2:707837/1‑96 (MQ=255) cTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGctc < 1:707837/96‑1 (MQ=255) cTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAc < 2:1351151/139‑1 (MQ=255) cTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAc > 2:1512668/1‑139 (MQ=255) cTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAc > 2:182435/1‑139 (MQ=255) cTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAc > 1:1613785/1‑139 (MQ=255) 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tattaGCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTcc > 2:76717/1‑127 (MQ=255) gCAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTaa > 2:1509005/1‑139 (MQ=255) cAGGTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGACGATACGGGGCATTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAAc > 1:1197981/1‑139 (MQ=255) gTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGct < 2:1252350/70‑1 (MQ=255) gTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGct > 1:1252350/1‑70 (MQ=255) gTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGAttt > 2:389223/1‑84 (MQ=255) gTAAGCCGATGATGATGG‑TCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGAttt < 1:389223/84‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |