| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,176,858 | C→T | *141* (TAG→TAA) | yqiB ← | DUF1249 protein YqiB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,176,858 | 0 | C | T | 100.0% | 232.1 / NA | 72 | *141* (TAG→TAA) | yqiB | DUF1249 protein YqiB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (39/33); total (39/33) | |||||||||||
TTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCG > NC_000913/3176724‑3176980 | tttACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTtaat < 2:1406477/139‑1 (MQ=255) ttACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTCAGGTTTCACGACGTtaata < 1:789510/139‑1 (MQ=255) tAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGa > 1:153947/1‑139 (MQ=255) aaCAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGaa > 1:487913/1‑139 (MQ=255) ggCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGAGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGcc > 2:1256359/1‑139 (MQ=255) gCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGATTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCa > 1:905422/1‑139 (MQ=255) cGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGc > 2:1528354/1‑139 (MQ=255) tgCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCt > 2:145007/1‑139 (MQ=255) gCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTa < 1:145007/139‑1 (MQ=255) cAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTaa > 1:703899/1‑139 (MQ=255) aaaCAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCGAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTaaa < 1:1256359/139‑1 (MQ=255) aCAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCAtgtg > 1:60429/1‑132 (MQ=255) aCAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCAtgtg < 2:60429/132‑1 (MQ=255) aCAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACa < 2:487913/139‑1 (MQ=255) tgtCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCaa > 2:516058/1‑139 (MQ=255) gtCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc > 2:1362936/1‑117 (MQ=255) gtCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 1:1362936/117‑1 (MQ=255) gtCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAAc > 2:1851166/1‑139 (MQ=255) cGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCa > 2:1549732/1‑139 (MQ=255) gTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGt < 2:905422/139‑1 (MQ=255) aaaaTCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTaaaa < 1:1851166/139‑1 (MQ=255) aCTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCAtgtg < 2:1279147/100‑1 (MQ=255) 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aCCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCttt > 1:363261/1‑139 (MQ=255) gccagAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTtcgt < 2:1250508/139‑1 (MQ=255) ccagAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTaaaaa > 2:1528660/1‑115 (MQ=255) ccagAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTaaaaa < 1:1528660/115‑1 (MQ=255) ccagAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTtcgtc > 2:898437/1‑139 (MQ=255) agagGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTcgc > 2:632140/1‑139 (MQ=255) agGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGt > 1:989552/1‑139 (MQ=255) ggAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGtt < 1:1549732/139‑1 (MQ=255) gggTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTaaaaa > 2:1447302/1‑106 (MQ=255) gggTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTaaaaa < 1:1447302/106‑1 (MQ=255) aaCAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAAt < 2:1866939/53‑1 (MQ=255) aaCAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAAt > 1:1866939/1‑53 (MQ=255) aaCAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACt > 1:1549350/1‑139 (MQ=255) cAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACttt > 1:90826/1‑139 (MQ=255) gCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTtta < 2:363261/139‑1 (MQ=255) cTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTaaaa > 2:261854/1‑94 (MQ=255) cTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTaaaa < 1:261854/94‑1 (MQ=255) cTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttat > 2:1153916/1‑139 (MQ=255) cTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttat < 2:989552/139‑1 (MQ=255) tttCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTttatt < 1:1528354/139‑1 (MQ=255) tCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAg < 2:1563427/139‑1 (MQ=255) tCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAg < 2:703899/139‑1 (MQ=255) tCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAg < 2:90826/139‑1 (MQ=255) cAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGa < 2:1549350/139‑1 (MQ=255) gtgtCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTAGATGCTTTtcgt < 1:25760/107‑1 (MQ=255) 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2:67649/1‑139 (MQ=255) gtCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAAC‑TTTTATTAGGATAATCATAc > 1:652287/1‑139 (MQ=255) tCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc < 2:1231009/45‑1 (MQ=255) tCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATAc > 2:228718/1‑139 (MQ=255) tCCTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATAc > 2:757465/1‑139 (MQ=255) tCCTTAGATTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc > 1:1231009/1‑45 (MQ=255) cTTAGGTTTCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACcg < 1:1402836/139‑1 (MQ=255) tttCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTaaaa > 2:627160/1‑72 (MQ=255) tttCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTaaaa < 1:627160/72‑1 (MQ=255) tCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTAt < 2:1253084/51‑1 (MQ=255) tCACGACGTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTAt > 1:1253084/1‑51 (MQ=255) acgacgTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCAtgtg < 1:1034973/38‑1 (MQ=255) acgacgTTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCAtgtg > 2:1034973/1‑38 (MQ=255) | TTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGCAACTTTTTATTAGGATAATCATACCG > NC_000913/3176724‑3176980 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |