Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,178,015 | G→A | intergenic (‑105/‑100) | nudF ← / → tolC | ADP‑ribose pyrophosphatase/transport channel |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,178,015 | 0 | G | A | 100.0% | 184.5 / NA | 57 | intergenic (‑105/‑100) | nudF/tolC | ADP‑ribose pyrophosphatase/transport channel |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (30/27); total (30/27) |
ATGTAACGGGCAGGTTGTCTGGCTTAAGCATTGTTAATGTCCTGGCACTAATAGTGAATTAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGGCACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCTTCACCACAAGGAATGCAAATGAAGAAATTGCTCCCCATTCTTATCGG > NC_000913/3177880‑3178143 | aTGTAACGGGCAGGTTGTCTGGCTTAAGCATTGTTAATGTCCTGGCACTAATAGTGAATTAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGacac > 1:1221161/1‑139 (MQ=255) tCTGGCTTAAGCATTGTTAATGTCCTGGCACTAATAGTGAATTAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTg < 1:1720945/139‑1 (MQ=255) cTTAAGCATTGTTAATGTCCTGGCACTAATAGTGAATTAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTa > 1:1755246/1‑139 (MQ=255) aGCATTGTTAATGTCCTGGCACTAATAGTGAATTAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCgg > 1:1543796/1‑139 (MQ=255) aGCATTGTTAATGTCCTGGCACTAATAGTGAATTAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCgg > 1:316939/1‑139 (MQ=255) gCATTGTTAATGTCCTGGCACTAATAGTGAATTAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGc < 2:564066/139‑1 (MQ=255) ttAATGTCCTGGCACTAATAGTGAATTAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGc > 1:973605/1‑139 (MQ=255) ggCACTAATAGTGAATTAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGc < 2:217636/139‑1 (MQ=255) ggCACTAATAGCGAATTAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTTGAATCCGc < 2:1221161/139‑1 (MQ=255) aaTTAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTg < 2:693784/100‑1 (MQ=255) aaTTAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTg > 1:693784/1‑100 (MQ=255) aaTTAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAg > 2:1467837/1‑139 (MQ=255) ttAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATc < 2:1705811/121‑1 (MQ=255) ttAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATc > 1:1705811/1‑121 (MQ=255) aaTGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGc < 1:1876324/105‑1 (MQ=255) aaTGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGc > 2:1876324/1‑105 (MQ=255) gAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATcgcg < 1:1467837/139‑1 (MQ=255) aTTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGc > 1:919756/1‑98 (MQ=255) aTTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGc < 2:919756/98‑1 (MQ=255) aTTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCt > 1:1846565/1‑139 (MQ=255) aTTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAAGCCGCAATAATTTTATAGTTTGATCGCGCt > 2:575158/1‑139 (MQ=255) gCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGc < 1:1663675/92‑1 (MQ=255) gCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGc > 2:1663675/1‑92 (MQ=255) cGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCa > 2:350859/1‑73 (MQ=255) cGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCa < 1:350859/73‑1 (MQ=255) tttGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCtt > 1:978023/1‑138 (MQ=255) tttGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCtt < 2:978023/138‑1 (MQ=255) tttGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCTTc > 1:1787312/1‑139 (MQ=255) gACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCTTcacc < 2:1543796/139‑1 (MQ=255) ccGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCg > 1:1038049/1‑70 (MQ=255) ccGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCg < 2:1038049/70‑1 (MQ=255) ccGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCTTCACCACAAg > 2:1084262/1‑139 (MQ=255) gCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCTTCACCACAAGGAATGCaa < 2:815341/139‑1 (MQ=255) gTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCTTCACCACAAGGAATGCAAATg > 1:251130/1‑139 (MQ=255) tCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCTTCACCACAAGGAATGCAAATga > 2:1604078/1‑139 (MQ=255) tgtTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCTTCACCACAAGGAATGCAAATGAAGaaa < 2:1846565/139‑1 (MQ=255) tAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAg < 1:853132/54‑1 (MQ=255) tAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAg > 2:853132/1‑54 (MQ=255) aaTTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGcc > 1:910268/1‑37 (MQ=255) aaTTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGcc < 2:910268/37‑1 (MQ=255) aaTTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCt > 1:427300/1‑57 (MQ=255) aaTTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCt < 2:427300/57‑1 (MQ=255) aaTTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGAt > 2:1614859/1‑91 (MQ=255) aaTTGAGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGAt < 1:1614859/91‑1 (MQ=255) aGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCaa > 1:44553/1‑69 (MQ=255) aGGCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCaa < 2:44553/69‑1 (MQ=255) gCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGc > 1:1009181/1‑65 (MQ=255) gCACATTAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGc < 2:1009181/65‑1 (MQ=255) ttAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATcgcg > 1:1122280/1‑83 (MQ=255) ttAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATcgcg < 2:1122280/83‑1 (MQ=255) ttAACGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGTTTCACCACAAGGAATTCAAATGAAGAAATTGCTCCCCATTCTTAt < 1:1084262/139‑1 (MQ=255) aCGCCCTATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCTTCACCACAAGGAATGCAAATGAAGAAATTGCTCCCCATTCTTATCgg > 2:1388531/1‑139 (MQ=255) tATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCt > 1:1548385/1‑36 (MQ=255) tATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCt < 2:1548385/36‑1 (MQ=255) tATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCt < 2:425133/86‑1 (MQ=255) tATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCt > 1:425133/1‑86 (MQ=255) tATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCTTcacc < 1:697020/91‑1 (MQ=255) tATGACACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCTTcacc > 2:697020/1‑91 (MQ=255) | ATGTAACGGGCAGGTTGTCTGGCTTAAGCATTGTTAATGTCCTGGCACTAATAGTGAATTAAATGTGAATTTCAGCGACGTTTGACTGCCGTTTGAGCAGTCATGTGTTAAATTGAGGCACATTAACGCCCTATGGCACGTAACGCCAACCTTTTGCGGTAGCGGCTTCTGCTAGAATCCGCAATAATTTTACAGTTTGATCGCGCTAAATACTGCTTCACCACAAGGAATGCAAATGAAGAAATTGCTCCCCATTCTTATCGG > NC_000913/3177880‑3178143 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |