Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 3,767,179 | G→A | *281* (TAG→TAA) | yibA → | putative immunity protein for polymorphic toxin RhsA, HEAT‑domain protein, lethality reduction protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,767,179 | 0 | G | A | 100.0% | 280.2 / NA | 85 | *281* (TAG→TAA) | yibA | putative immunity protein for polymorphic toxin RhsA, HEAT‑domain protein, lethality reduction protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (44/41); total (44/41) |
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ttCATAACGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGgt > 1:1503079/1‑95 (MQ=255) ttCATAACGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGgt < 2:1503079/95‑1 (MQ=255) cATAACGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAggta < 1:1528861/103‑3 (MQ=255) cATAACGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAggta > 2:1528861/1‑101 (MQ=255) | TTTATGATGATATCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCT > NC_000913/3767046‑3767306 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |