Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,921,515 | C→T | T179T (ACG→ACA) | atpB ← | F0 sector of membrane‑bound ATP synthase, subunit a |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,921,515 | 0 | C | T | 100.0% | 256.1 / NA | 78 | T179T (ACG→ACA) | atpB | F0 sector of membrane‑bound ATP synthase, subunit a |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (43/35); total (43/35) |
AGCTCACCGGCATACATGTTACCGAACAGTCGCAAACCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGCGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGTTACGTTCACGTCCGCAGACGGAACCACACGCAGTGCAGGCAG > NC_000913/3921393‑3921646 | aGCTCACCGGCATACATGTTACCGAACAGTCGCAAACCGTGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGa > 1:124033/1‑139 (MQ=255) aGCTCACCGGCATACATGTTACCGAACAGTCGCAAACCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGa > 1:1378189/1‑139 (MQ=255) cTCACCGGCATACATGTTACCGAACAGTCGCAAACCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAg < 1:417934/139‑1 (MQ=255) cTCACCGGCATACATGTTACCGAACAGTCGCAAACCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAg > 2:864313/1‑139 (MQ=255) ggCATACATGTTACCGAACAGTCGCAAACCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGccgccg < 2:1324490/139‑1 (MQ=255) ggCATACATGTTACCGAACAGTCGCAAACCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGccgccg < 1:526016/139‑1 (MQ=255) aCCGAACAGTCGCAAACCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCAtt > 1:382306/1‑139 (MQ=255) aaCAGTCGCAAACCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCGAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGa < 1:130940/139‑1 (MQ=255) aaCAGTCGCAAACCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGAt > 1:95882/1‑125 (MQ=255) aaCAGTCGCAAACCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGAt < 2:95882/125‑1 (MQ=255) aaCAGTCGCAAACCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGa > 2:335407/1‑139 (MQ=255) aCAGTCGCAAACCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGa < 2:605712/138‑1 (MQ=255) aCAGTCGCAAACCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGa > 1:605712/1‑138 (MQ=255) tCGCAAACCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTg > 1:848156/1‑139 (MQ=255) aaCCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGaa < 1:905956/139‑1 (MQ=255) aaCCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGaa > 2:265133/1‑139 (MQ=255) gAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGaa > 2:239150/1‑135 (MQ=255) gAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGaa < 1:239150/135‑1 (MQ=255) gAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGa < 2:1378189/139‑1 (MQ=255) aGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAg > 2:1576415/1‑102 (MQ=255) aGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAg < 1:1576415/102‑1 (MQ=255) aGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGaa > 2:469836/1‑139 (MQ=255) gTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAAt < 2:848156/139‑1 (MQ=255) gTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATg > 1:336978/1‑116 (MQ=255) gTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATg < 2:336978/116‑1 (MQ=255) tttGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAAt < 2:774283/139‑1 (MQ=255) agcagGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCa < 1:265133/139‑1 (MQ=255) cagGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTg < 1:966374/109‑1 (MQ=255) cagGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTg > 2:966374/1‑109 (MQ=255) cagGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCa > 1:402324/1‑137 (MQ=255) cagGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCa < 2:402324/137‑1 (MQ=255) tCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGa < 1:1018561/91‑1 (MQ=255) tCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGa > 2:1018561/1‑91 (MQ=255) tCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGa > 2:1010890/1‑91 (MQ=255) tCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGa < 1:1010890/91‑1 (MQ=255) tCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCg > 2:1774819/1‑139 (MQ=255) cAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATg > 1:1494794/1‑77 (MQ=255) cAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATg < 2:1494794/77‑1 (MQ=255) gATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGaa > 1:1802537/1‑96 (MQ=255) gATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGaa < 2:1802537/96‑1 (MQ=255) aaGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCa > 2:467294/1‑115 (MQ=255) aaGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCa < 1:467294/115‑1 (MQ=255) aGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGccgccg > 1:1558783/1‑65 (MQ=255) aGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGccgccg < 2:1558783/65‑1 (MQ=255) aCAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATg > 2:593468/1‑78 (MQ=255) aCAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATg < 1:593468/78‑1 (MQ=255) aCAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCa < 1:1384531/109‑1 (MQ=255) aCAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCa > 2:1384531/1‑109 (MQ=255) aCAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGTTACGTTCACGTCCg > 1:794498/1‑139 (MQ=255) ggAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGa < 1:220810/73‑1 (MQ=255) ggAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGa > 2:220810/1‑73 (MQ=255) gAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAg > 2:103533/1‑50 (MQ=255) gAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAg < 1:103533/50‑1 (MQ=255) aaTGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGAt < 2:1440522/57‑1 (MQ=255) aaTGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGAt > 1:1440522/1‑57 (MQ=255) aCGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGa > 2:645216/1‑87 (MQ=255) aCGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGa < 1:645216/87‑1 (MQ=255) aCGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGTTACGTTCACGTCCGCAGACGGAAc > 1:508717/1‑139 (MQ=255) gCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGTTACGTTCACGTCCGCAGACGGAACca > 1:1135097/1‑139 (MQ=255) gCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGTTACGTTCACGTCCGCAGACGGAACca > 2:182612/1‑139 (MQ=255) cccAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGtt > 1:724002/1‑113 (MQ=255) cccAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGtt < 2:724002/113‑1 (MQ=255) ccAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAg > 2:1574651/1‑40 (MQ=255) ccAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAg < 1:1574651/40‑1 (MQ=39) cAGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGTTACGTTCACGTCCGCAGACGGAACCacac > 2:243111/1‑139 (MQ=255) aGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGcc < 2:1407042/91‑1 (MQ=255) aGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGcc > 1:1407042/1‑91 (MQ=255) aGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGTTACGTTCACGTCCGCAGACGGAACCACACg < 1:469836/139‑1 (MQ=255) aGTGATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGTTACGTTCACGTCCGCAGACGGAACCACACg < 1:1153853/139‑1 (MQ=255) gATTGAACGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGTTACGTTCACGTCCGCAGACGGAACCACACACAg > 1:732315/1‑139 (MQ=255) aaCGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGcc < 1:915312/83‑1 (MQ=255) aaCGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGcc > 2:915312/1‑83 (MQ=255) aaCGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGTTACGTTCACGTCCGCAGACGGAACcac > 2:709229/1‑128 (MQ=255) aaCGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGTTACGTTCACGTCCGCAGACGGAACcac < 1:709229/128‑1 (MQ=255) aaCGGCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGTTACGTTCACGTCCGCAGACGGAACCACACGCAGTgcag > 1:409838/1‑139 (MQ=255) gCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGTTACGTTCACGTCCGCAGACGGAACCACACGCAGTgcaggcag > 1:531459/1‑139 (MQ=255) gCTGCAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCAGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGTTACGTTCACGTCCGCAGACGGAACCACACGCAGTgcaggcag > 2:827881/1‑139 (MQ=255) cAGTGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCa > 1:1294715/1‑77 (MQ=255) | AGCTCACCGGCATACATGTTACCGAACAGTCGCAAACCGAGTGAAACTGGTTTGGACAGCAGGCTTACCCCTTCAAGGATTAAGTTGACAGGAATGAACGCCCAGTGATTGAACGGCTGCAGCGTCAACTCTTTCGTGAAGCCGCCGATGCCTTTCATTTTGATGCTGTAGAACAGAATCAGGATAAATACGCCCAGTGCCATAGACAGCGTTACGTTCACGTCCGCAGACGGAACCACACGCAGTGCAGGCAG > NC_000913/3921393‑3921646 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |