Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 983,623 | G→A | *183* (TAG→TAA) | ycbK → | M15A protease‑related family periplasmic protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 983,623 | 0 | G | A | 100.0% | 286.3 / NA | 88 | *183* (TAG→TAA) | ycbK | M15A protease‑related family periplasmic protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (49/39); total (49/39) |
TGGATTTCCATATTGAAGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCT > NC_000913/983490‑983742 | tGGATTTCCATATTGAAGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAAtt > 1:233289/1‑139 (MQ=255) tCCATATTCAAGGTATCTCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGTTGGTTTAGGATATTATCCACGTATTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTaa < 2:793856/139‑1 (MQ=255) aaGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAgg > 2:87450/1‑139 (MQ=255) aGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAggg < 1:87450/139‑1 (MQ=255) 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1:1285822/139‑1 (MQ=255) tatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAgggg > 1:542868/1‑76 (MQ=255) tatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAgggg < 2:542868/76‑1 (MQ=255) tatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGaa < 2:287263/85‑1 (MQ=255) tatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGaa > 1:287263/1‑85 (MQ=255) tatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGgtg > 2:1011700/1‑139 (MQ=255) tatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGgtg > 1:584041/1‑139 (MQ=255) tatCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGgtg > 1:585773/1‑139 (MQ=255) 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atTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTAATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACt > 1:811797/1‑139 (MQ=255) gATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCAt < 1:1017833/84‑1 (MQ=255) gATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCAt > 2:1017833/1‑84 (MQ=255) cGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCa > 1:445972/1‑129 (MQ=255) cGGGCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCa < 2:445972/129‑1 (MQ=255) ggCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAgggg > 1:137132/1‑42 (MQ=255) ggCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAgggg < 2:137132/42‑1 (MQ=255) ggCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAgggg > 2:980253/1‑42 (MQ=255) ggCCAGCACGGCACTGGTAATAATTGCTTAACGAAACAgggg < 1:980253/42‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) | TGGATTTCCATATTGAAGGTATCGCGTTAAGCAATATTCGCAAAGCCGCGTTATCTATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGGCCAGCACGGCACTGGTAGTAATTGCTTAACGAAACAGGGGCAGTATGAACTATCGTATTATTCCGGTCACCGCATTCTCCCAGAACTGTTCATTAATCTGGTGTGAACAAACCCGTCTGGCCGCACTGGTCGATCCT > NC_000913/983490‑983742 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |