| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,729,692 | G→A | A202A (GCG→GCA) | lhr → | putative ATP‑dependent helicase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,729,692 | 0 | G | A | 100.0% | 80.5 / NA | 26 | A202A (GCG→GCA) | lhr | putative ATP‑dependent helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (12/14); total (12/14) | |||||||||||
TGCTGACCTCCCGCGCGCGCGAAACGCTACGCGGCGTCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCGCTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTCAGCCAGCGATGTGGCAGCATTTCTTGGTGGCGATCGCCCGGTTACGGTAGTCAACCCGCCCGCAATGCGCCATCCGCAGATACG > NC_000913/1729568‑1729826 | tGCTGACCTCCCGCGCGCGCGAAACGCTACGCGGCGTCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTc > 2:664694/1‑139 (MQ=255) gCTACGCGGCGTCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGcc < 2:880370/139‑1 (MQ=255) aCGCGGCGTCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACt < 1:165950/139‑1 (MQ=255) cgTCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTgcgc > 1:86381/1‑139 (MQ=255) aaaCGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTcagc < 2:38234/139‑1 (MQ=255) tgatgaAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTCAGCCAGCGATGTGgca < 2:86381/139‑1 (MQ=255) gatgaAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTcagcc < 1:359965/126‑1 (MQ=255) gatgaAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTcagcc > 2:359965/1‑126 (MQ=255) gTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCca < 1:455878/74‑1 (MQ=255) gTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCca > 2:455878/1‑74 (MQ=255) gTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTCAGCCAGCGATGTGGCAGCATTTc > 2:97793/1‑139 (MQ=255) gTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTCAGCCAGCGATGTGGCAGCATTTc > 1:397394/1‑139 (MQ=255) cACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTCAGCCAGCGATGTGGCAGCATTTCTtg > 2:292463/1‑139 (MQ=255) aCGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTCAGCCAGCGATGTGGCAGCATTTCTtgg < 1:218065/139‑1 (MQ=255) gCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTCAGCCAGCGATGTGGCAGCATTTCTTGGTGGCGATc < 2:485452/139‑1 (MQ=255) gCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTCAGCCAGCGATGTGGCAGCATTTCTTGGTGGCGATCGccc < 2:686391/139‑1 (MQ=255) gcgcATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTc > 2:292671/1‑86 (MQ=255) gcgcATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTc < 1:292671/86‑1 (MQ=255) cATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTCCTGCCACTGTGCGCTCAGCCAGCGATGTGGCAGCATTTCTTGGTGGCGATCGCCCGGTTACGGTAGTCAAcc > 1:351609/1‑139 (MQ=255) tCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTg > 1:772784/1‑59 (MQ=255) tCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTg < 2:772784/59‑1 (MQ=255) aaGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTgc > 1:1180982/1‑68 (MQ=255) aaGTCTGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTgc < 2:1180982/68‑1 (MQ=255) tGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTCAGCCAGCGATGTGGCAGCATTTCTTGGTGGCGATCGCCCGGTTACGGTAGTCAACCCGCCCGCAATGCGCCa < 1:97793/139‑1 (MQ=255) tGGAGCGGCTCGATGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTCAGCCAGCGATGTGGCAGCATTTCTTGGTGGCGATCGCCCGGTTACGGTAGTCAACCCGCCCGCAATGCGCCa > 1:1185702/1‑139 (MQ=255) aTGCACTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTCCTGCCACTGTGCGCTCAGCCAGCGATGTGGCAGCATTTCTTGGTGGCGATCGCCCGGTTACGGTAGTCAACCCGCCCGCAATGCGCCATCCGCAGATACg < 2:351609/139‑1 (MQ=255) | TGCTGACCTCCCGCGCGCGCGAAACGCTACGCGGCGTCGAAACGGTAATTATTGATGAAGTCCACGCGGTAGCGGGCAGTAAACGTGGTGCGCATCTGGCGTTAAGTCTGGAGCGGCTCGATGCGCTGCTCCACACCTCAGCACAGCGAATTGGCCTTTCTGCCACTGTGCGCTCAGCCAGCGATGTGGCAGCATTTCTTGGTGGCGATCGCCCGGTTACGGTAGTCAACCCGCCCGCAATGCGCCATCCGCAGATACG > NC_000913/1729568‑1729826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |