Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,736,157 | G→A | *393* (TAG→TAA) | xylR → | xylose divergent operon transcriptional activator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,736,157 | 0 | G | A | 100.0% | 363.4 / NA | 111 | *393* (TAG→TAA) | xylR | xylose divergent operon transcriptional activator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (56/55); total (56/55) |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CAACCACCTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑A‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCGTAGCTCAA > NC_000913/3736021‑3736287 | cAACCACCTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACg < 2:161483/139‑1 (MQ=255) aaCCACCTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACg‑a < 2:440384/139‑1 (MQ=255) ccaccTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACg‑aat > 2:599994/1‑137 (MQ=255) accTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACg‑aatga < 2:253371/139‑5 (MQ=255) ttGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑tgatga > 2:774161/1‑139 (MQ=255) ttGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑tgatga > 1:866095/1‑139 (MQ=255) aaTGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCg > 2:1168449/1‑139 (MQ=255) gagaTATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCg < 1:1168449/139‑1 (MQ=255) agaTATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGt < 1:599994/139‑1 (MQ=255) agaTATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGt > 2:181102/1‑139 (MQ=255) atCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTcaca > 2:370306/1‑139 (MQ=255) cGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACg‑a < 1:501769/113‑1 (MQ=255) cGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCg > 2:357781/1‑132 (MQ=255) cGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATc > 1:395256/1‑139 (MQ=255) cGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCAGCGTCACATc > 1:1072206/1‑139 (MQ=255) aTGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTc > 2:417571/1‑123 (MQ=255) aTGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTc < 1:417571/123‑1 (MQ=255) tgtgCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTaa > 2:479065/1‑139 (MQ=255) ttATCGATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCg < 1:118934/139‑1 (MQ=255) ttATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATAAGGTAACGCTGCg < 2:866095/139‑1 (MQ=255) tCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAACAGCATATGACACGACGCAACAAGAAACTCGCAATCTAAGTAGCGAGGCCATGTAGTAACG‑AGTGAAGACAAATGACAGTGTCAAATCCGGTAACGCTGCGTGGTTGt > 2:238499/1‑139 (MQ=255) gCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCg > 2:351216/1‑130 (MQ=255) gCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCg < 2:511509/130‑1 (MQ=255) gCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCg > 1:511509/1‑130 (MQ=255) gCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCg < 1:351216/130‑1 (MQ=255) cTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCg > 2:159789/1‑109 (MQ=255) cTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCg < 1:977874/109‑1 (MQ=255) cTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCg < 1:159789/109‑1 (MQ=255) cTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCgg > 1:127195/1‑139 (MQ=255) gCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGAt > 1:142493/1‑139 (MQ=255) atatTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATgcg < 2:127195/139‑1 (MQ=255) cTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGa < 1:515024/139‑1 (MQ=255) tACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGaa < 2:245734/139‑1 (MQ=255) aCTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAAc > 1:556434/1‑139 (MQ=255) ctGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGcc > 2:149992/1‑139 (MQ=255) ctGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGcc > 1:884202/1‑139 (MQ=255) tGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCt > 2:423018/1‑139 (MQ=255) tttttAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTa > 1:1258813/1‑139 (MQ=255) ttttAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTAt < 2:142493/139‑1 (MQ=255) aaGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTa < 1:512826/139‑1 (MQ=255) aGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTcaca > 2:259636/1‑85 (MQ=255) aGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTcaca < 1:259636/85‑1 (MQ=255) aGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCg < 2:1031089/100‑1 (MQ=255) aGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCg > 1:1031089/1‑100 (MQ=255) aGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTAc > 1:691688/1‑139 (MQ=255) atGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGcc < 1:774161/139‑1 (MQ=255) atGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGcc < 2:556434/139‑1 (MQ=255) acgacgCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTaa < 1:601899/83‑1 (MQ=255) acgacgCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTaa > 2:601899/1‑83 (MQ=255) gacgCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGc < 1:205663/113‑1 (MQ=255) gacgCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGc > 2:205663/1‑113 (MQ=255) gacgCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATg > 1:576025/1‑139 (MQ=255) acgCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGa > 1:334740/1‑139 (MQ=255) ccAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATaa < 2:1258813/139‑1 (MQ=255) cAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACg‑aatga > 1:1244430/1‑44 (MQ=255) cAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACg‑aatga < 2:1244430/48‑5 (MQ=255) cAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGt > 2:192590/1‑64 (MQ=255) aaaGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACg‑aa < 2:133424/43‑2 (MQ=255) aaaGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACg‑aa > 1:133424/1‑42 (MQ=255) aaaGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGaa > 2:908146/1‑103 (MQ=255) aaaGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGaa < 1:908146/103‑1 (MQ=255) aaaGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAAc > 2:242193/1‑139 (MQ=255) agagTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGc < 1:242193/139‑1 (MQ=255) agagTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGc < 2:576025/139‑1 (MQ=255) gTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCAcc > 1:920731/1‑139 (MQ=255) tATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTc > 1:289193/1‑51 (MQ=255) tATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACAt < 1:212719/61‑1 (MQ=255) tATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACAt > 2:212719/1‑61 (MQ=255) tCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACcaac > 2:1134366/1‑139 (MQ=255) gcgATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACcaacaa < 2:334740/139‑1 (MQ=255) gcgATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACcaacaa < 2:920731/139‑1 (MQ=255) tGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAc < 2:373836/102‑1 (MQ=255) tGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAc > 1:373836/1‑102 (MQ=255) tAAATAGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACcaacaa > 2:787408/1‑133 (MQ=255) aGCGAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCt < 1:1134366/139‑1 (MQ=255) gAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCg > 1:88063/1‑57 (MQ=255) gAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCg < 2:88063/57‑1 (MQ=255) gAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTg < 2:925408/59‑1 (MQ=255) gAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTg > 1:925408/1‑59 (MQ=255) gAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACcaacaa > 2:1190834/1‑125 (MQ=255) gAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACcaacaa < 1:1190834/125‑1 (MQ=255) gAGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCGt > 1:1095374/1‑139 (MQ=255) aGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTaa < 1:514028/49‑1 (MQ=255) aGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTaa > 2:514028/1‑49 (MQ=255) aGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACcaacaa > 2:190234/1‑124 (MQ=255) aGGTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACcaacaa < 1:190234/124‑1 (MQ=255) ggTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCg < 1:655691/35‑1 (MQ=255) ggTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCg > 2:655691/1‑35 (MQ=255) ggTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTg < 2:278901/75‑1 (MQ=255) ggTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTg > 1:278901/1‑75 (MQ=255) ggTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCGTAg > 1:497154/1‑139 (MQ=255) ggTCATGTTATAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAAAGCTTCAGGCTCGTAg > 1:868565/1‑139 (MQ=39) gTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGc > 1:1198408/1‑79 (MQ=39) gTCATGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGc < 2:1198408/79‑1 (MQ=39) aTGTTGTAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCGTAGCTCa > 2:603545/1‑139 (MQ=255) tgttgtAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTg > 1:1275449/1‑70 (MQ=255) tgttgtAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCGTAGCTCaa < 1:827598/139‑1 (MQ=255) tgttgtAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCGTAGCTCaa < 1:742852/139‑1 (MQ=255) tgttgtAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCGTAGCTCaa > 2:827598/1‑139 (MQ=255) tgttgtAACGAA‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCGTAGCTCaa < 1:149992/139‑1 (MQ=255) | CAACCACCTTGTCGATCAATGAGATATCGCAAATGTGCGGTTATCCATCGCTGCAATATTTCTACTCTGTTTTTAAAAAAGCATATGACACGACGCCAAAAGAGTATCGCGATGTAAATAGCGAGGTCATGTTGTAGCG‑A‑TGATGAGAATTGTCGGCGTCACATCAGGTAACGCTGCGTGGTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACCCGCCAGGCATGATAAAACGCACCAACAACGCTTCAGGCTCGTAGCTCAA > NC_000913/3736021‑3736287 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |