| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 372,966 | A→G | T16A (ACC→GCC) | mhpF → | acetaldehyde‑CoA dehydrogenase II, NAD‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 372,966 | 0 | A | G | 100.0% | 141.1 / NA | 40 | T16A (ACC→GCC) | mhpF | acetaldehyde‑CoA dehydrogenase II, NAD‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (18/22); total (18/22) | |||||||||||
CGGGCGATCGTTTTGAAGCCCATATTGAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGA > NC_000913/372836‑373098 | cGGGCGATCGTTTTGAAGCCCATATTGAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCtg < 2:81678/139‑1 (MQ=255) gggCGATCGTTTTGAAGCCCATATTGAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCtga > 1:459960/1‑139 (MQ=255) tGAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTc < 1:1233044/139‑1 (MQ=255) gAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCa < 2:459960/139‑1 (MQ=255) tAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTc < 1:1083225/131‑1 (MQ=255) tAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTc > 2:1083225/1‑131 (MQ=255) gcGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGAt > 2:14249/1‑139 (MQ=255) aCATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGt < 1:836695/139‑1 (MQ=255) ttttCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTgg < 2:1218535/139‑1 (MQ=255) cAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCAtt < 1:14249/139‑1 (MQ=255) cAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCAtt < 1:405187/139‑1 (MQ=255) ccccAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAg > 2:385112/1‑139 (MQ=255) aaGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTc > 1:259844/1‑139 (MQ=255) aaGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTc > 2:743041/1‑139 (MQ=255) aGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGt < 2:587185/80‑1 (MQ=255) aGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGt > 1:587185/1‑80 (MQ=255) cTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGgc > 2:238450/1‑139 (MQ=255) tCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGgcgcg < 1:743041/139‑1 (MQ=255) gAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGcc < 1:238450/139‑1 (MQ=255) tAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGt > 2:1139966/1‑99 (MQ=255) tAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGt < 1:1139966/99‑1 (MQ=255) gCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGt > 1:131561/1‑139 (MQ=255) aaGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATggg > 1:338840/1‑139 (MQ=255) gTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCg > 2:1286561/1‑139 (MQ=255) gCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTg < 1:716434/81‑1 (MQ=255) gCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTg > 2:716434/1‑81 (MQ=255) ttATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGccac < 1:1286561/139‑1 (MQ=255) ttATCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGccac < 1:33404/139‑1 (MQ=255) tCGGTTCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCcaccac < 2:338840/139‑1 (MQ=255) tCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGAt > 1:591104/1‑62 (MQ=255) tCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGAt < 2:591104/62‑1 (MQ=255) tCTGGCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATg > 2:27214/1‑139 (MQ=255) ggCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAg > 1:815954/1‑139 (MQ=255) gCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAgg < 1:385112/139‑1 (MQ=255) gCAACATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAgg < 2:131561/139‑1 (MQ=255) cATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGt < 2:476639/91‑1 (MQ=255) cATTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGt > 1:476639/1‑91 (MQ=255) aTTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAg < 1:1211494/104‑1 (MQ=255) aTTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGa < 1:379169/139‑1 (MQ=255) aTTGGTGCCGATCTGATGATTAAAATTTTGCATCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAg > 2:1211494/1‑104 (MQ=255) | CGGGCGATCGTTTTGAAGCCCATATTGAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGA > NC_000913/372836‑373098 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |