Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,385,869 | (A)7→6 | coding (10/972 nt) | yfbL → | putative M28A family peptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,385,863 | 0 | A | . | 100.0% | 130.6 / NA | 32 | coding (4/972 nt) | yfbL | putative M28A family peptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (18/14); total (18/14) |
TAAATAAACTCAGGCACCAGACATAAAATATACTCTTTGTATAATCCTGCTAATCTTAATAAAATACAATATCGAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATGAAAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCAATGCATTACCGTCAACGCCCCGACACGCAAGTCCTGAGCAATTAGAAAAAACAGTTCG > NC_000913/2385735‑2385996 | taaataaaCTCAGGCACCAGACATAAAATATACTCTTTGTATAATCCTGCTAATCTTAATAAAATACAATATCGAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATc < 1:88701/139‑1 (MQ=255) ctctTTGTATAATCCTGCTAATCTTAATAAAATACAATATCGAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACt > 1:991401/1‑139 (MQ=255) tGTATAATCCTGCTAATCTTAATAAAATACAATATCGAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTttatta > 1:1411746/1‑115 (MQ=255) tGTATAATCCTGCTAATCTTAATAAAATACAATATCGAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTttatta < 2:1411746/115‑1 (MQ=255) aTCCTGCTAATCTTAATAAAATACAATATCGAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGatta > 2:325221/1‑139 (MQ=255) tGCTAATCTTAATAAAATACAATATCGAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTg < 1:1290845/96‑1 (MQ=255) tGCTAATCTTAATAAAATACAATATCGAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTg > 2:1290845/1‑96 (MQ=255) ataaAATACAATATCGAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCt > 1:525534/1‑139 (MQ=255) tatCGAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTa < 1:63010/100‑1 (MQ=255) tatCGAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTa > 2:63010/1‑100 (MQ=255) gAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCtttt > 1:447975/1‑75 (MQ=255) gAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCtttt < 2:447975/75‑1 (MQ=255) aaaCCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCAATGCATTAcc > 1:820233/1‑139 (MQ=255) aCCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTAc > 1:697103/1‑114 (MQ=255) aCCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTAc < 2:697103/114‑1 (MQ=255) aCCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGt < 2:1020155/125‑1 (MQ=255) aCCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGt > 1:1020155/1‑125 (MQ=255) tAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTttat < 1:1413068/69‑1 (MQ=255) tAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTttat > 2:1413068/1‑69 (MQ=255) gATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCAATGCATTACCGTCAACGCCCCGACACGc < 2:525534/139‑1 (MQ=255) gATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCAATGCATTACCGTCAACGCCCCGACACGc > 2:1282979/1‑139 (MQ=255) tCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCAATGCATTACCGTCAACGCCCCGa > 1:787752/1‑131 (MQ=255) tCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCAATGCATTACCGTCAACGCCCCGa < 2:787752/131‑1 (MQ=255) aacaacGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCa > 2:20504/1‑106 (MQ=255) aacaacGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCa < 1:20504/106‑1 (MQ=255) cGCAACCCATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCAATGCATTACCGTCAACGCCCCGACACGCAAGTCCTGAg > 2:430843/1‑139 (MQ=255) cccATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCAATGCATTACCGTCAACGCCCCGACACGc > 2:331547/1‑124 (MQ=255) cccATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCAATGCATTACCGTCAACGCCCCGACACGc < 1:331547/124‑1 (MQ=255) cccATTAATAATTTGCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCAATGCATTACCGTCAACGCCCCGACACGCAAGTCCTGAGCAAtt > 2:527454/1‑139 (MQ=255) gCATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCAATGCATTACCGTCAACGCCCCGACACGCAAGTCCTGAGCAATTAGAAAAAACAGTTc > 2:806650/1‑139 (MQ=255) cATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCAATGCATTACCGTCAACGCCCCGACACGCAAGTCCTGAGCAATTAGAAAAAACAGTTCg < 1:325221/139‑1 (MQ=255) cATATG‑AAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCAATGCATTACCGTCAACGCCCCGACACGCAAGTCCTGAGCAATTAGAAAAAACAGTTCg < 2:991401/139‑1 (MQ=255) | TAAATAAACTCAGGCACCAGACATAAAATATACTCTTTGTATAATCCTGCTAATCTTAATAAAATACAATATCGAAACCCATAGCAAATAATGATTCAACAACGCAACCCATTAATAATTTGCATATGAAAAAAATAATCTTTGCTTTTATTATATTATTTGTGTTTTTACTCCCTATGATTATTTTTTACCAACCCTGGGTCAATGCATTACCGTCAACGCCCCGACACGCAAGTCCTGAGCAATTAGAAAAAACAGTTCG > NC_000913/2385735‑2385996 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |