Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,454,292 | C→A | G122G (GGC→GGA) | paaA → | ring 1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,454,292 | 0 | C | A | 100.0% | 239.5 / NA | 74 | G122G (GGC→GGA) | paaA | ring 1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (39/35); total (39/35) |
TATCTCTATAGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAG > NC_000913/1454158‑1454419 | tATCTCTATAGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCggatggc > 2:710135/1‑139 (MQ=255) tATCTCTATAGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCggatggc > 1:1295622/1‑139 (MQ=255) ataGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGa < 1:710135/139‑1 (MQ=255) taGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGCGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGAt > 1:1178446/1‑139 (MQ=255) gcgcCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGa < 1:1035641/136‑1 (MQ=255) gcgcCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGa > 2:1035641/1‑136 (MQ=255) gcgcCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATgg > 1:529658/1‑139 (MQ=255) gcgcCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATgg > 2:367728/1‑139 (MQ=255) gcgcCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACAGTGAGTTGTGCTGATAGCGGTGTTATCGGATGTCTGGTGGTTgg > 1:1195266/1‑139 (MQ=255) gcgcCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGAAGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGATGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATgg > 2:302015/1‑139 (MQ=255) ccgccgAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGgcgc > 1:1180286/1‑139 (MQ=255) ccgAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGa < 1:860247/130‑1 (MQ=255) ccgAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGa > 2:860247/1‑130 (MQ=255) cgAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCg < 2:1295622/139‑1 (MQ=255) aaaCACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGAt < 1:367728/139‑1 (MQ=255) aaCACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATc < 2:1271841/139‑1 (MQ=255) gggCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAAt < 1:302015/139‑1 (MQ=255) cTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCaa > 2:159506/1‑135 (MQ=255) cTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCaa < 1:159506/135‑1 (MQ=255) cgcCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTg > 2:735635/1‑139 (MQ=255) gaCATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGcc > 1:770797/1‑139 (MQ=255) cATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGc < 2:529658/139‑1 (MQ=255) cTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCg < 2:544071/135‑1 (MQ=255) cTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCg > 1:544071/1‑135 (MQ=255) aaaaaTGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTa > 1:524650/1‑124 (MQ=255) aaaaaTGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTa < 2:524650/124‑1 (MQ=255) aaaaaTGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTAt > 1:1228177/1‑139 (MQ=255) aaaaTGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATg < 1:413228/139‑1 (MQ=255) gCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCg < 2:1228177/139‑1 (MQ=255) tCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTa < 2:1180286/139‑1 (MQ=255) ttCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGaaa < 1:735635/139‑1 (MQ=255) ttCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGaaa > 2:1020389/1‑139 (MQ=255) tcctccATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCAc < 2:878837/104‑1 (MQ=255) tcctccATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCAc > 1:878837/1‑104 (MQ=255) cctccATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATc > 1:962157/1‑84 (MQ=255) cctccATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATc < 2:962157/84‑1 (MQ=255) cctccATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTa < 1:778437/95‑1 (MQ=255) cctccATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTa > 2:778437/1‑95 (MQ=255) cctccATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAAt > 1:88498/1‑139 (MQ=255) tccATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCt < 1:804743/139‑1 (MQ=255) cATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCg < 1:1070973/88‑1 (MQ=255) cATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCg > 2:1070973/1‑88 (MQ=255) cATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGc > 2:1287013/1‑117 (MQ=255) cATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGc < 1:1287013/117‑1 (MQ=255) cATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCa > 2:527613/1‑124 (MQ=255) cATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCa < 1:527613/124‑1 (MQ=255) cATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGc > 1:1040142/1‑139 (MQ=255) tCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGcc < 1:197586/93‑1 (MQ=255) tCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGcc > 2:197586/1‑93 (MQ=255) tAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGc < 2:483528/103‑1 (MQ=255) tAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGc > 1:483528/1‑103 (MQ=255) aTTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAagaaga < 2:770797/139‑1 (MQ=255) tCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGc < 2:1183061/97‑1 (MQ=255) tCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGc > 1:1183061/1‑97 (MQ=255) tCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGt > 2:404005/1‑139 (MQ=255) tCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGt > 1:1011291/1‑139 (MQ=255) aGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGAGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGc > 1:82311/1‑139 (MQ=255) gTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATg > 2:583975/1‑70 (MQ=255) gTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATg < 1:583975/70‑1 (MQ=255) ggCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGc > 2:512803/1‑96 (MQ=255) ggCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGc < 1:512803/96‑1 (MQ=255) ggCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAg > 2:671260/1‑139 (MQ=255) cTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCagag > 1:1331114/1‑93 (MQ=255) cTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCagag < 2:1331114/93‑1 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAAt < 2:503097/47‑1 (MQ=255) atatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAAt > 1:503097/1‑47 (MQ=255) tatCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGATGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGttt < 2:1011291/139‑1 (MQ=255) atCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAgg < 2:615954/49‑1 (MQ=255) atCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAgg > 1:615954/1‑49 (MQ=255) ggTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAaagaag > 1:1171025/1‑109 (MQ=255) ggTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAaagaag < 2:1171025/109‑1 (MQ=255) ggTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTCAAg > 1:921660/1‑139 (MQ=255) tATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGc > 1:275800/1‑97 (MQ=255) tATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGc < 2:275800/97‑1 (MQ=255) tCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGc > 1:1227250/1‑73 (MQ=255) tCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGc < 2:1227250/73‑1 (MQ=255) | TATCTCTATAGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAG > NC_000913/1454158‑1454419 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |