| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 545,679 | (TCA)4→3 | coding (683‑685/1050 nt) | allD ← | ureidoglycolate dehydrogenase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 545669 | 545671 | 3 | 67 [0] | [0] 67 | allD | ureidoglycolate dehydrogenase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 545672 = | 0 (0.000) | 58 (1.080) | 41/186 | 0.2 | 100% | coding (692/1050 nt) | allD | ureidoglycolate dehydrogenase |
| ? | NC_000913 | = 545668 | 0 (0.000) | coding (696/1050 nt) | allD | ureidoglycolate dehydrogenase | |||||
GGGAAAAGTGCTCGACGCCCGCTCGCGTAATATGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/545818‑545672‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgatgatgatTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCAATTACATATAGTTATTAATCCGAACTTTTTCTCCTCCAG < NC_000913/545668‑545537 GGGAAAAGTGCTCGACGCCCGCTCGCGTAATATGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTG > 1:156751/1‑139 AAGTGCTCGACGCCCGCTCGCGTAATATGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGAT > 1:295621/1‑139 CTCGACGCCCGCTCGCGTAATATGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTG > 2:451061/1‑139 TATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGC > 1:942603/1‑139 TATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCC‑AAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCT > 1:738705/1‑139 ATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTT > 1:1113962/1‑139 ACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCG < 2:346402/139‑1 CTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGG > 1:307987/1‑139 GCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGC > 1:694819/1‑111 GCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGC < 2:694819/111‑1 CGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACA > 1:1527810/1‑139 TCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGT < 1:1069412/139‑1 TCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGT > 2:162805/1‑139 TCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGT > 2:243004/1‑139 CGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTT < 2:1527810/139‑1 TAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCC‑AAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTT < 2:738705/139‑1 AAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCG < 2:1026112/139‑1 AAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCG < 1:451061/139‑1 ACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGAT > 1:1224358/1‑139 GTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAG > 2:1182851/1‑91 GTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAG < 1:1182851/91‑1 GTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGAC > 2:129966/1‑81 GTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGAC < 1:129966/81‑1 GTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATCGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTATTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATG > 2:999405/1‑139 ACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATT < 2:1224358/139‑1 AACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTA < 2:942603/139‑1 ACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTAC > 1:1009768/1‑139 ACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTAC > 1:1211150/1‑139 ATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGC < 2:295621/139‑1 ATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGC < 1:162805/139‑1 ATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTATCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGC < 2:1046428/139‑1 TCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCA > 2:446277/1‑139 TCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTGCGATGTATGACGATTTACACGCA < 2:1470365/139‑1 TTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGAC < 1:699249/123‑1 TTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGAC > 2:699249/1‑123 TGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGG < 2:1526347/139‑1 GCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGC < 2:307987/139‑1 CTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCA < 2:1113962/139‑1 TCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCAA < 2:1211150/139‑1 CTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGA > 1:241453/1‑87 CTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGA < 2:241453/87‑1 TGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCAATT < 1:951253/139‑1 GCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGA < 2:1400624/85‑1 GCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGA > 1:1400624/1‑85 GCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAG > 2:1274154/1‑56 GCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAG < 1:1274154/56‑1 CCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACA > 2:836433/1‑82 CCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACA < 1:836433/82‑1 CGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACC > 1:390437/1‑69 CGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACC < 2:390437/69‑1 CGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGT < 1:1229576/42‑1 CGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGT > 2:1229576/1‑42 CCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGG > 2:861735/1‑122 CCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGG < 1:861735/122‑1 GGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCA > 2:1427559/1‑121 GGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCA < 1:1427559/121‑1 TATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCca < 2:922792/111‑3 TATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGCATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCAA > 1:922792/1‑111 TATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGA < 1:529013/60‑1 TATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGA > 2:529013/1‑60 TGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGA > 1:261737/1‑53 TGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGA < 2:261737/53‑1 GATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGC > 2:734826/1‑84 GATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGC < 1:734826/84‑1 ATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACG < 1:134827/82‑1 ATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACG > 2:134827/1‑82 TGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCAATTACATATAGTTATTAATCCGAACTTTTTCTCCTCCAG < 1:446277/139‑1 GATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGT > 2:1115641/1‑55 GATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGT < 1:1115641/55‑1 GGGAAAAGTGCTCGACGCCCGCTCGCGTAATATGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/545818‑545672‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgatgatgatTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCAATTACATATAGTTATTAATCCGAACTTTTTCTCCTCCAG < NC_000913/545668‑545537 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |