Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,099,237 | G→A | A126V (GCG→GTG) | ugd ← | UDP‑glucose 6‑dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,099,237 | 0 | G | A | 100.0% | 299.8 / NA | 92 | A126V (GCG→GTG) | ugd | UDP‑glucose 6‑dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (44/48); total (44/48) |
GTTCTGAACGCTCACCGATGACAATACGTGAAGGATGGAGATTATCGTAAAGGGCTTTACCCTCACGGAGAAATTCCGGGGAGAATATAATATTTTCAGTGCGATATTTCTTATGCATCGCTGCGGTAAAACCAACGGGAACCGTTGATTTGATGACCATAACCGCATAAGGATTTATCTCAACTACGTCTTTAATTACTGATTCTACACTGGATGTATTGAAATAATTAGTTTTAGGATCATAGTCGGTTGGA > NC_000913/2099118‑2099371 | gTTCTGAACGCTCACCGATGACAATACGTGAAGGATGGAGATTATCGTAAAGGGCTTTACCCTCACGGAGAAATTCCGGGGAGAATATAATATTTTCAGTGCGATATTTCTTATGCATCACTGCGGTAAAACCAACggg < 1:813588/139‑1 (MQ=255) tCTGAACGCTCACCGATGACAATACGTGAAGGATGGAGATTATCGTAAAGGGCTTTACCCTCACGGAGAAATTCCGGGGAGAATATAATATTTTCAGTGCGATATTTCTTATGCATCACTGCGGTAAAACCAACGGGaa < 1:709182/139‑1 (MQ=255) cACCGATGACAATACGTGAAGGATGGAGATTATCGTAAAGGGCTTTACCCTCACGGAGAAATTCCGGGGAGACTATAATATTTTCAGTGCGATATTTCTTATGCATCACTGCGGTAAAACCAACGGGAACCGttgattt > 2:638522/1‑139 (MQ=255) cACCGATGACAATACGTGAAGGATGGAGATTATCGTAAAGGGCTTTACCCTCACGGAGAAATTCCGGGGAGAATATAATATTTTCAGTGCGATATTTCTTATGCATCACTGCGGTAAAACCAACGGGAACCGttgattt > 2:1071673/1‑139 (MQ=255) 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< 1:379222/51‑1 (MQ=255) tCAGTGCGATATTTCTTATGCATCACTGCGGTAAAACCAACGGGAACCGTTGATTTGATGACCATAACCGCATAAGGAt < 1:614558/79‑1 (MQ=255) tCAGTGCGATATTTCTTATGCATCACTGCGGTAAAACCAACGGGAACCGTTGATTTGATGACCATAACCGCATAAGGAt > 2:614558/1‑79 (MQ=255) tCAGTGCGATATTTCTTATGCATCACTGCGGTAAAACCAACGGGAACCGTTGATTTGATGACCATAACCGCATAAGGATTTATCTCAACTACGTCTTTAATTACTGATTCTACACTGGATGTATTGAAATAATTAGttt > 2:75258/1‑139 (MQ=255) tCAGTGCGATATTTCTTATGCATCACTGCGGTAAAACCAACGGGAACCGTTGATTTGATGACCATAACCGCATAAGGATTTATCTCAACTACGTCTTTAATTACTGATTCTACACTGGATGTATTGAAATAATTAGttt > 1:1345836/1‑139 (MQ=255) tCAGTGCGATATTTCTTATGCATCACTGCGGTAAAACCAACGGGAACCGTTGATTTGATGACCATAACCGCATAAGGATTTATCTCAACTACGTCTTTAATTACTGATTCTACACTGGATGTATTGAAATAATTAGttt > 1:408479/1‑139 (MQ=255) tCAGTGCGATATTTCTTATGCATCACTGCGGTAAAACCAACGGGAACCGTTGATTTGATGACCATAACCGCATAAGGATTTATCTCAACTACGTCTTTAATTACTGATTCTACACTGGATGTATTGAAATAATTAGttt > 2:466470/1‑139 (MQ=255) 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GTTCTGAACGCTCACCGATGACAATACGTGAAGGATGGAGATTATCGTAAAGGGCTTTACCCTCACGGAGAAATTCCGGGGAGAATATAATATTTTCAGTGCGATATTTCTTATGCATCGCTGCGGTAAAACCAACGGGAACCGTTGATTTGATGACCATAACCGCATAAGGATTTATCTCAACTACGTCTTTAATTACTGATTCTACACTGGATGTATTGAAATAATTAGTTTTAGGATCATAGTCGGTTGGA > NC_000913/2099118‑2099371 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |