| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,760,667 | G→A | D41N (GAC→AAC) | yfjJ → | CP4‑57 prophage, uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,760,667 | 0 | G | A | 100.0% | 248.8 / NA | 77 | D41N (GAC→AAC) | yfjJ | CP4‑57 prophage, uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (39/38); total (39/38) | |||||||||||
TTGGCCAGGATACTATATGACATACGATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATGACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAAAAGCAAAGCTTAAACATGATAAGCATATTAAAACTCAACGGAAAGACT > NC_000913/2760531‑2760802 | ttGGCCAGGATACTATATGACATACGATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAAc > 1:321742/1‑139 (MQ=255)ttGGCCAGGATACTATATGACATACGATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAAc < 2:418246/139‑1 (MQ=255) gATACTATATGACATACGATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACA‑GTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGAt > 2:1133741/1‑139 (MQ=255) tACTATATGACATACGATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATa < 1:946828/139‑1 (MQ=255) gACATACGATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAat > 2:1483088/1‑139 (MQ=255) gACATACGATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAat > 2:446501/1‑139 (MQ=255) cATACGATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAatat > 2:908063/1‑139 (MQ=255) cATACGATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAatat > 1:825563/1‑139 (MQ=255) tACGATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATgg > 2:1249806/1‑139 (MQ=255) tACGATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATgg > 2:1308788/1‑139 (MQ=255) aCGATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGa > 2:328739/1‑139 (MQ=255) aCGATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGa > 2:1191344/1‑139 (MQ=255) aCGATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGa > 2:67005/1‑139 (MQ=255) gATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATAc > 2:724234/1‑125 (MQ=255) gATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATAc < 1:724234/125‑1 (MQ=255) tGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGa < 1:1343897/123‑1 (MQ=255) tGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGa > 2:1343897/1‑123 (MQ=255) tGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCa > 1:753793/1‑139 (MQ=255) cGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCACTTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCttt < 2:141960/139‑1 (MQ=255) cGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCttt < 1:864165/139‑1 (MQ=255) cGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCttt < 1:128246/139‑1 (MQ=255) tCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCttt > 1:734331/1‑135 (MQ=255) tCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCttt < 2:734331/135‑1 (MQ=255) aTGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAg > 2:307214/1‑139 (MQ=255) aTGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAg > 1:1261556/1‑139 (MQ=255) tATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGt < 1:131816/139‑1 (MQ=255) aTCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGtt < 2:80795/139‑1 (MQ=255) cccTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGa < 1:1307205/139‑1 (MQ=255) cTATATCGGGATAGAATCAAACA‑GTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGActc < 1:1133741/139‑1 (MQ=255) tataTCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGActc < 1:307214/139‑1 (MQ=255) tataTCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGActc < 2:1261556/139‑1 (MQ=255) atatCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGActct > 1:429596/1‑139 (MQ=255) atatCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGActct > 1:29850/1‑139 (MQ=255) cGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTg < 1:1249806/139‑1 (MQ=255) cGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTg < 1:1191344/139‑1 (MQ=255) ggATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAAccc < 1:1126856/121‑1 (MQ=255) ggATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAAccc > 2:1126856/1‑121 (MQ=255) ggATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGt < 1:853122/126‑1 (MQ=255) ggATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGt > 2:853122/1‑126 (MQ=255) ggATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCt > 2:130968/1‑139 (MQ=255) aGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTatat < 1:288844/139‑1 (MQ=255) aGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTatat < 2:71871/139‑1 (MQ=255) aGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTatat < 2:321742/139‑1 (MQ=255) aaTCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATAtct < 2:445870/139‑1 (MQ=255) gTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCa > 2:629783/1‑139 (MQ=255) ccTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACa > 1:1472482/1‑61 (MQ=255) ccTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACa < 2:1472482/61‑1 (MQ=255) ccTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATaa > 2:513543/1‑75 (MQ=255) ccTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATaa < 1:513543/75‑1 (MQ=255) ccTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCa > 1:1087203/1‑79 (MQ=255) ccTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAaaagca < 1:629783/139‑1 (MQ=255) ccTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAaaagca > 1:1088906/1‑139 (MQ=255) ccTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAaaagca < 1:908063/139‑1 (MQ=255) ccTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAaaagca > 1:381562/1‑139 (MQ=255) ccTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTATTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCa < 2:1087203/79‑1 (MQ=255) aaCGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGTCTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAaaagcaaagc < 2:1088906/139‑1 (MQ=255) aaCATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAAAAGCAAAGCTTaa > 2:716741/1‑139 (MQ=255) aaCATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAAAAGCAAAGCTTa > 2:621112/1‑138 (MQ=255) aaCATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAAAAGCAAAGCTTa < 1:621112/138‑1 (MQ=255) cATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCg < 1:1064313/107‑1 (MQ=255) cATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCg > 2:1064313/1‑107 (MQ=255) ttAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTg < 2:838703/90‑1 (MQ=255) ttAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTg > 1:838703/1‑90 (MQ=255) aCTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAAAAGCAAAGCTTAAACATGATaa > 2:462764/1‑139 (MQ=255) cAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAAAAGCAAAGCTTAAACATGATAAGCa < 1:1231950/139‑1 (MQ=255) cGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTAcc > 2:744263/1‑93 (MQ=255) cGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTAcc < 1:744263/93‑1 (MQ=255) cGTGTTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAAAAGCAAAGCTTAAACATGATAAGCATATTAAAACTc < 1:446501/139‑1 (MQ=255) tgtTGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAAAAGCAAAGCTTAAACATGATAAGCATATTAAAACTCaa > 2:460580/1‑139 (MQ=255) ttGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGc > 2:975770/1‑83 (MQ=255) ttGATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGc < 1:975770/83‑1 (MQ=255) gATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGActc > 1:1512419/1‑65 (MQ=255) gATCTGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGActc < 2:1512419/65‑1 (MQ=255) tGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATAtct > 2:1137144/1‑74 (MQ=255) tGCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATAtct < 1:1137144/74‑1 (MQ=255) gCATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAAAAGCAAAGCTTAAACATGATAAGCATATTAAAACTCAACGGAAAGAc > 2:1202587/1‑139 (MQ=255) cATAACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAAAAGCAAAGCTTAAACATGATAAGCATATTAAAACTCAACGGAAAGACt < 2:381562/139‑1 (MQ=255) | TTGGCCAGGATACTATATGACATACGATAGTGAATTCGGATCACATGTATCCCTATATCGGGATAGAATCAAACAGGTTATTGATGACTCCCTAAACGAACATCTTAACTCAATGATTCTACGTGTTGATCTGCATGACCCAATTGATACAGAAAATATGGATAACCCATTCTTTCAACCCAGGGTTGACTCTGGTGCTATATCTCGCTTTACCAGTGCGTTAAAAGCAAAGCTTAAACATGATAAGCATATTAAAACTCAACGGAAAGACT > NC_000913/2760531‑2760802 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |