| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,833,009 | (G)5→4 | coding (582/807 nt) | xthA → | exonuclease III |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,833,005 | 0 | G | . | 100.0% | 205.0 / NA | 50 | coding (578/807 nt) | xthA | exonuclease III |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (28/22); total (28/22) | |||||||||||
GGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTG > NC_000913/1832874‑1833138 | gggCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTggggttgg > 2:173104/1‑135 (MQ=255) atatGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGAt > 1:706531/1‑139 (MQ=255) aGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGAt > 2:117401/1‑128 (MQ=255) aGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGAt < 1:117401/128‑1 (MQ=255) cccTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTggggttgg < 2:298007/121‑5 (MQ=255) cccTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTggggttgg > 1:298007/1‑117 (MQ=255) cccTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTggggt > 1:428364/1‑117 (MQ=255) cccTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTggggt < 2:428364/118‑2 (MQ=255) cccTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATg > 1:621552/1‑139 (MQ=255) cccTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATg > 2:256471/1‑139 (MQ=255) cTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCg > 2:600489/1‑139 (MQ=255) cTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCg < 1:59889/139‑1 (MQ=255) aCAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGaa > 1:1365827/1‑139 (MQ=255) aCAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGaa > 2:1123195/1‑139 (MQ=255) aCAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGaa > 1:466899/1‑139 (MQ=255) cAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAAt < 1:500662/139‑1 (MQ=255) ttGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCt > 2:1384436/1‑107 (MQ=255) ttGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCt < 1:1384436/107‑1 (MQ=255) ttGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGt < 2:1365827/139‑1 (MQ=255) tGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGtt > 2:348383/1‑139 (MQ=255) cGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTgggg < 1:260701/90‑1 (MQ=255) cGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTgggg > 2:260701/1‑90 (MQ=255) gaagaaAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTtctc < 2:328201/139‑1 (MQ=255) agaaAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCAt < 1:256471/139‑1 (MQ=255) agaaAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCAt < 1:348383/139‑1 (MQ=255) tAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTgggg < 1:354932/78‑1 (MQ=255) tAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTgggg > 2:354932/1‑78 (MQ=255) aGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTAc < 2:621552/139‑1 (MQ=255) gcgcTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTAcc > 2:336042/1‑139 (MQ=255) ggctgCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCa > 2:1061665/1‑139 (MQ=255) gctgCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCaa < 1:173104/139‑1 (MQ=255) tACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAAt < 1:844977/90‑1 (MQ=255) tACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAAt > 2:844977/1‑90 (MQ=255) tGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATaa > 2:1133432/1‑139 (MQ=255) tctTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCTAAGCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGGTTTGACGATAAcc > 2:988070/1‑138 (MQ=255) tctTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAAcc < 1:988070/138‑1 (MQ=255) tctTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCg > 1:1355110/1‑139 (MQ=255) ctTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGt > 1:397141/1‑139 (MQ=255) tGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACACGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAAcagc > 2:1348911/1‑81 (MQ=255) tGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACACGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAAcagc < 1:1348911/81‑1 (MQ=255) ccGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTgcg > 2:1151157/1‑139 (MQ=255) ggAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCa < 1:1123195/139‑1 (MQ=255) gcgcGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGtttt < 2:1153461/111‑1 (MQ=255) gcgcGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGtttt > 1:1153461/1‑111 (MQ=255) cgcgAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAAcag > 2:1045323/1‑69 (MQ=255) cgcgAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAAcag < 1:1045323/69‑1 (MQ=255) aaTGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACctgctg < 2:397141/139‑1 (MQ=255) atggatggACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCtgctgc > 2:1199937/1‑139 (MQ=255) atggatggACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCtgctgc > 1:509003/1‑139 (MQ=255) tggatggaCAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTgctgct < 2:706531/139‑1 (MQ=255) aGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAAcag > 1:637353/1‑54 (MQ=255) aGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAAcag < 2:637353/54‑1 (MQ=255) ggCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCaa > 1:1347083/1‑139 (MQ=255) gCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAAc > 1:1482047/1‑139 (MQ=255) gCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAAc > 1:1390408/1‑139 (MQ=255) cTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAAt > 1:1590635/1‑41 (MQ=38) cTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAAt < 2:1590635/41‑1 (MQ=38) gatgaGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGc < 2:1355110/139‑1 (MQ=255) tgaGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTg < 1:336042/139‑1 (MQ=255) | GGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTG > NC_000913/1832874‑1833138 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |