Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 545,679 | (TCA)4→3 | coding (683‑685/1050 nt) | allD ← | ureidoglycolate dehydrogenase |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 545669 | 545671 | 3 | 60 [0] | [0] 60 | allD | ureidoglycolate dehydrogenase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 545672 = | 0 (0.000) | 51 (0.890) | 31/188 | 0.7 | 100% | coding (692/1050 nt) | allD | ureidoglycolate dehydrogenase |
? | NC_000913 | = 545668 | 0 (0.000) | coding (696/1050 nt) | allD | ureidoglycolate dehydrogenase |
GGGAAAAGTGCTCGACGCCCGCTCGCGTAATATGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/545818‑545672 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgatgatgatTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCAATTACATATAGTTATTAATCCGAACTTTTTCTCCTCCA < NC_000913/545668‑545538 GGGAAAAGTGCTCGACGCCCGCTCGCGTAATATGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTG > 1:1405603/1‑139 AAGTGCTCGACGCCCGCTCGCGTAATATGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGAT > 2:223572/1‑139 AAGTGCTCGACGCCCGCTCGCGTAATATGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGAT > 1:148465/1‑139 CTCGACGCCCGCTCGCGTAATATGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTG > 2:1050881/1‑139 CTCGACGCCCGCTCGCGTAATATGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTG > 1:276164/1‑139 TCGCGTAATATGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTATATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAG < 1:1050881/139‑1 CGTAATATGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCG < 2:276164/139‑1 TAATATGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTTACGTCCTCTCGGGCGTC < 2:981302/139‑1 TGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACT > 1:1533571/1‑139 TCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCG > 2:868001/1‑139 TCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTT > 2:827160/1‑139 TCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTT > 1:1212423/1‑139 CCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTAC > 1:409262/1‑139 CCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGAGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTAC > 1:332552/1‑139 GGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCG > 1:1111354/1‑139 GATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGT > 1:755274/1‑139 ATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTT < 1:1397440/139‑1 CTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGG > 1:1474067/1‑139 GGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGA < 2:755274/139‑1 TCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGT > 1:1164113/1‑139 TCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGT > 1:1181723/1‑139 AAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTT < 2:1405603/139‑1 AAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTT < 2:1533571/139‑1 AAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTT < 2:1181723/139‑1 GTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATG < 2:409262/139‑1 ACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGAC < 2:1212423/139‑1 GATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACG < 2:148465/139‑1 GATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACG < 1:868001/139‑1 ATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGC > 1:1255123/1‑139 ATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGC > 2:429617/1‑139 ATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGC > 2:1183756/1‑139 ATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGT > 1:668056/1‑70 ATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGT < 2:668056/70‑1 TCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCA > 1:634994/1‑139 TACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTT > 2:1276767/1‑139 ATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGAC < 2:390422/113‑1 ATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGAC > 1:390422/1‑113 ATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGA < 2:190501/92‑1 ATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGA > 1:190501/1‑92 TGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGG < 1:1183756/139‑1 TGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGG < 2:634994/139‑1 TGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGG < 2:1474067/139‑1 TGCTCTGCTCCCCGCCGCCGAGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGG < 2:332552/139‑1 CTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCA < 2:1164113/139‑1 CTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCA < 2:1111354/139‑1 CTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCA < 1:429617/139‑1 TGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCA > 1:913866/1‑136 TGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCA < 2:913866/136‑1 GCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCAATTA > 2:374918/1‑139 CCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCAATTACATA > 2:502969/1‑139 CCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCAATTACATA < 1:223572/139‑1 CCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCAATTACATA > 1:358967/1‑139 CCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCAATTACATATAGTTAT < 1:827160/139‑1 AAAGGGTATGGCCTGATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCAATTACATATAGTTATTAATCCGA < 2:1255123/139‑1 GATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCA > 1:1214581/1‑85 GATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCA < 2:1214581/85‑1 ATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCAATTACATATAGTTATTAATCCGAACTTTTTCTCCTCCA > 2:1133665/1‑139 ATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGG < 2:726846/99‑1 ATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGG > 1:726846/1‑99 ATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGG < 1:1202138/97‑1 ATGATGATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGG > 2:1202138/1‑97 ATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACG > 2:172201/1‑76 ATTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACG < 1:172201/76‑1 GGGAAAAGTGCTCGACGCCCGCTCGCGTAATATGTCTATCCCGGATACCTGGGCGGTCGATAAAAACGGTGTACCAACAACCGATCCGTTCGCGGTACATGCTCTGCTCCCCGCCGCCGGGCCAAAAGGGTATGGCCTGATGATGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/545818‑545672 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgatgatgatTGACGTCCTCTCAGGCGTCTTACTCGGCTTACCGTTCGGGCGACAGGTTAGTTCGATGTATGACGATTTACACGCAGGGCGTAATTTGGGGCAATTACATATAGTTATTAATCCGAACTTTTTCTCCTCCA < NC_000913/545668‑545538 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |