Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 738,853 | G→A | *254* (TAG→TAA) | ybfD → | H repeat‑associated putative transposase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 738,853 | 0 | G | A | 100.0% | 252.0 / NA | 77 | *254* (TAG→TAA) | ybfD | H repeat‑associated putative transposase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (38/39); total (38/39) |
TGAAAGAATTAAATAATCCCAAGCATGACAGTTACGCAATTAGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAGAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCATTTCTCAACGTCTACACTTACTCCTGTAAAC > NC_000913/738726‑738985 | tGAAAGAATTAAATAATCCCAAGCATGACAGTTACGCAATTAGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCt < 1:775566/139‑1 (MQ=255) tGAAAGAATTAAATAATCCCAAGCATGACAGTTACGCAATTAGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCt < 1:1524568/139‑1 (MQ=255) gAAAGAATTAAATAATCCCAAGCATGACAGTTACGCAATTAGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTa < 1:182775/139‑1 (MQ=255) aaTTAAATAATCCCAAGCATGACAGTTACGCAATTAGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGtt < 1:108817/139‑1 (MQ=255) ataatCCCAAGCATGACAGTTACGCAATTAGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAggg > 2:158265/1‑122 (MQ=255) ataatCCCAAGCATGACAGTTACGCAATTAGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAggg < 1:158265/122‑1 (MQ=255) cccAAGCATGACAGTTACGCAATTAGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAATTACCt > 1:324505/1‑139 (MQ=255) aGCATGACAGTTACGCAATTAGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACg > 1:1400737/1‑139 (MQ=255) gACAGTTACGCAATTAGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTa < 1:868693/114‑1 (MQ=255) gACAGTTACGCAATTAGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTa > 2:868693/1‑114 (MQ=255) aTTAGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAg > 2:1219976/1‑139 (MQ=255) ttAGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAATTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGc < 2:324505/139‑1 (MQ=255) aGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCt > 2:13475/1‑98 (MQ=255) aGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCt < 1:13475/98‑1 (MQ=255) aGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAg > 2:97960/1‑139 (MQ=255) tGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGc < 1:1308575/139‑1 (MQ=255) gagTCACGGCAGAGAAGAAACCCGACTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGGGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGATACTATCTGACGTAAGTCGTTTCGGGGTGAAGtcgttcgt > 1:1091587/1‑139 (MQ=18) tCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGaaa > 2:1445580/1‑98 (MQ=255) tCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGaaa < 1:1445580/98‑1 (MQ=255) ggCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTg < 1:97960/139‑1 (MQ=255) aagaaACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCg > 2:557594/1‑109 (MQ=255) aagaaACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCg < 1:557594/109‑1 (MQ=255) aCCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTacaac > 2:451905/1‑139 (MQ=255) aCCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTacaac > 2:1130050/1‑139 (MQ=255) tCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGc > 1:950116/1‑98 (MQ=255) tCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGc < 2:950116/98‑1 (MQ=255) tCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGAt > 1:1102068/1‑139 (MQ=255) atatTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACt < 1:451905/139‑1 (MQ=255) tGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTcac > 1:1123448/1‑139 (MQ=255) tttGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAg > 1:58250/1‑93 (MQ=255) tttGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAg < 2:58250/93‑1 (MQ=255) ttGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCt > 1:188687/1‑71 (MQ=255) ttGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCt < 2:188687/71‑1 (MQ=255) ttGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGt < 1:986091/76‑1 (MQ=255) ttGCGATCTCCCTGATGAGCTTATCGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGt > 2:986091/1‑76 (MQ=255) tGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCg > 1:852990/1‑86 (MQ=255) tGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCg > 1:1201033/1‑86 (MQ=255) tGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCg < 2:852990/86‑1 (MQ=255) tGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCg < 2:1201033/86‑1 (MQ=255) tGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTcc < 1:1487584/112‑1 (MQ=255) tGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTcc > 2:1487584/1‑112 (MQ=255) tGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTaca < 1:1172377/119‑1 (MQ=255) tGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTaca > 2:1172377/1‑119 (MQ=255) tGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAat > 1:1532984/1‑139 (MQ=255) tGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAat > 2:801146/1‑139 (MQ=255) tGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAat > 1:769733/1‑139 (MQ=255) cccTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCATTtc > 1:497546/1‑139 (MQ=255) aGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCATTTCTCAACGTc < 1:801146/139‑1 (MQ=255) gCTTATTGATTTCACGTTTGAGTAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCATTTCTCAACGTCt < 2:948842/139‑1 (MQ=255) cTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTa > 2:112712/1‑36 (MQ=18) cTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTa < 1:112712/36‑1 (MQ=18) cTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGa > 2:105914/1‑44 (MQ=255) cTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGa < 1:105914/44‑1 (MQ=255) cTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGt > 1:649866/1‑92 (MQ=255) cTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGt < 2:649866/92‑1 (MQ=255) cTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCAt < 1:443149/126‑1 (MQ=255) cTTATTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCAt > 2:443149/1‑126 (MQ=255) aTTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCATTTCTCa < 2:177988/129‑1 (MQ=255) aTTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCATTTCTCa > 1:177988/1‑129 (MQ=255) aTTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCATTTCTCAACGTCTacac > 2:1008948/1‑139 (MQ=255) aTTGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCATTTCTCAACGTCTacac < 2:497546/139‑1 (MQ=255) ttGATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCATTTCTCAACGTCTACACt < 1:1008948/139‑1 (MQ=255) gATTTCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCATTTCTCAACGTCTACACTTa < 2:1400737/139‑1 (MQ=255) ttCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGt < 1:39100/83‑1 (MQ=255) ttCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGt > 2:39100/1‑83 (MQ=255) ttCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTaca > 2:904241/1‑92 (MQ=255) ttCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTaca < 1:904241/92‑1 (MQ=255) tCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTcc < 2:651818/84‑1 (MQ=255) tCACGTTTGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTcc > 1:651818/1‑84 (MQ=255) ttGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCATTTCTCAACGTCTACACTTACTCCTGTaaa < 2:769733/139‑1 (MQ=255) tGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCt > 1:1379255/1‑35 (MQ=255) tGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCt < 2:1379255/35‑1 (MQ=255) tGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAg > 1:299678/1‑56 (MQ=255) tGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAg < 2:299678/56‑1 (MQ=255) tGAATAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCATTTCTCAACGTCTACACTTACTCCTGTAAAc < 2:1532984/139‑1 (MQ=255) aaTAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGAtt > 1:1286068/1‑90 (MQ=255) aaTAAAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGAtt < 2:1286068/90‑1 (MQ=255) | TGAAAGAATTAAATAATCCCAAGCATGACAGTTACGCAATTAGTGAAAAGAGTCACGGCAGAGAAGAAACCCGTCTTCATATTGTTTGCGATGTCCCTGATGAGCTTATTGATTTCACGTTTGAATAGAAAGGGCAGCTATGGTTAGAAACTACCTGACGTCAGTCCTTGCGGGGAGCAGGCTTTCGTAAATTTGTCCTGCTACAACAGGATTAACTTCACAAATATCATTTCTCAACGTCTACACTTACTCCTGTAAAC > NC_000913/738726‑738985 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |