| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,544,384 | C→T | pseudogene (381/381 nt) | yddK ← | pseudogene, leucine‑rich protein, putative glycoportein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,544,384 | 0 | C | T | 100.0% | 280.9 / NA | 86 | pseudogene (381/381 nt) | yddK | pseudogene, leucine‑rich protein, putative glycoportein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (46/40); total (46/40) | |||||||||||
CTAACCTTCAAACGGGGTTAATCTTTGAACGTATGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTT > NC_000913/1544251‑1544506 | cTAACCTTCAAACGGGGTTAATCTTTGAACGTATGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTaaaa > 2:1400660/1‑139 (MQ=255) ttCAAACGTGGTTAATCTTTGAACGTATGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCa < 2:1602549/139‑1 (MQ=255) cAAACGGGGTTAATCTTTGAACGTATGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATg > 1:566701/1‑139 (MQ=255) cAAACGGGGTTAATCTTTGAACGTATGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATg > 1:768991/1‑139 (MQ=255) tGAACGTATGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGAt > 1:1354376/1‑139 (MQ=255) gAACGTATGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATc < 2:566701/139‑1 (MQ=255) aTGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCa > 1:1582372/1‑139 (MQ=255) aTGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCa > 1:1432434/1‑139 (MQ=255) tGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGAt > 2:273009/1‑131 (MQ=255) tGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGAt < 1:273009/131‑1 (MQ=255) tGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAg < 2:768991/139‑1 (MQ=255) aCCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGAt > 2:1114958/1‑119 (MQ=255) aCCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGAt < 1:1114958/119‑1 (MQ=255) aCCCTTCAGATCGTCAATCTAAAGGGTTACATATTAACTACATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTCGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCTTGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCgg > 2:980829/1‑139 (MQ=255) cccTTCAAGTCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGt < 1:980829/139‑1 (MQ=255) ttCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGt > 2:1312879/1‑136 (MQ=255) ttCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGt < 1:1312879/136‑1 (MQ=255) tCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCct > 2:134514/1‑139 (MQ=255) tCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCct < 1:1029504/139‑1 (MQ=255) tGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGATCTATCGGTTCCTCTCTTAtt > 1:1573015/1‑139 (MQ=255) gAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTg > 2:1344742/1‑139 (MQ=255) aaaGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGAt < 1:1344742/139‑1 (MQ=255) gTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGc < 2:886842/129‑1 (MQ=255) gTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGc > 1:886842/1‑129 (MQ=255) tACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGtaata < 2:1582372/139‑1 (MQ=255) tAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGAt > 1:255376/1‑85 (MQ=255) tAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGAt < 2:255376/85‑1 (MQ=255) aCTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGAt < 2:946030/83‑1 (MQ=255) aCTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGAt > 1:946030/1‑83 (MQ=255) aCTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCGGATTGTAATAATCGttatt > 1:410270/1‑139 (MQ=255) tataTTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTAc < 2:1270439/139‑1 (MQ=255) atatTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAg < 2:876443/88‑1 (MQ=255) atatTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAg > 1:876443/1‑88 (MQ=255) atatTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACa < 1:1400660/139‑1 (MQ=255) atatTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACa > 1:691362/1‑139 (MQ=255) tattatCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACag > 1:535009/1‑139 (MQ=255) attatCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACagt > 2:327617/1‑139 (MQ=255) attatCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACagt < 1:327617/139‑1 (MQ=255) tatCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACagtaa > 2:679102/1‑139 (MQ=255) tCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATg > 2:426843/1‑57 (MQ=255) tCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATg < 1:426843/57‑1 (MQ=255) tCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGtta > 2:1577465/1‑128 (MQ=255) tCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGtta < 1:1577465/128‑1 (MQ=255) caacaaGACCAGACATTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACagtaagta < 1:771919/139‑1 (MQ=255) acaaGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTc > 1:966002/1‑94 (MQ=255) acaaGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTc < 2:966002/94‑1 (MQ=255) gACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGttatt > 1:10113/1‑123 (MQ=255) gACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGttatt < 2:10113/123‑1 (MQ=255) ccAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTAt < 1:679102/139‑1 (MQ=255) cAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCct > 1:799008/1‑89 (MQ=255) cAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCct < 2:799008/89‑1 (MQ=255) cAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACagt < 2:448463/125‑1 (MQ=255) cAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACagt > 1:448463/1‑125 (MQ=255) cAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTAtt < 2:1432434/139‑1 (MQ=255) cAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTAtt < 2:691362/139‑1 (MQ=255) cAGACACGTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGTTCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATCACAGTAAGTATTGTTTAtt > 1:1053080/1‑139 (MQ=255) gACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCGGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTc > 1:1518251/1‑139 (MQ=255) acacTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTc > 2:1264828/1‑84 (MQ=255) acacTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTc < 1:1264828/84‑1 (MQ=255) ttATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAATTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTa > 1:37957/1‑139 (MQ=255) ttATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTcc < 1:405075/81‑1 (MQ=255) ttATAGAATTAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTcc > 2:405075/1‑81 (MQ=255) ttAGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATg > 1:133174/1‑139 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGa > 2:971469/1‑56 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGa < 1:971469/56‑1 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTAt > 2:752429/1‑64 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTAt < 1:752429/64‑1 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGa < 1:236269/86‑1 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGa > 2:236269/1‑86 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTaataat > 2:999636/1‑96 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTaataat < 1:999636/96‑1 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACagtaagta < 2:596570/113‑1 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACagtaagta > 1:596570/1‑113 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTc > 1:282008/1‑134 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTc < 2:282008/134‑1 (MQ=255) aGTGATGATTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGtt > 2:285763/1‑139 (MQ=255) atgatTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGa > 2:442584/1‑52 (MQ=255) atgatTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGa < 1:442584/52‑1 (MQ=255) gatTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACagt > 2:336935/1‑102 (MQ=255) gatTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACagt < 1:336935/102‑1 (MQ=255) atTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAg > 2:1514377/1‑48 (MQ=255) atTTATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAg < 1:1514377/48‑1 (MQ=255) tATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGtaata < 2:1289682/84‑1 (MQ=255) tATTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGtaata > 1:1289682/1‑84 (MQ=255) aTTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGa > 2:1078756/1‑75 (MQ=255) aTTCATTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGa < 1:1078756/75‑1 (MQ=255) | CTAACCTTCAAACGGGGTTAATCTTTGAACGTATGTCATGTTTCAACCCTTCAGATCGTGAATCTAAAGGGTTACATATTAACTATATTATCAACAAGACCAGACACTTATAGAATTAGTGATGATTTATTCACTAAAAAGGCCATGAACTGGAGGAAAACGATCTGTCCAGAAGGTCTATCGGTTCCTCTCTTATTGCCTGATTGTAATAATCGTTATTACAGTAAGTATTGTTTATTTCATCTAAGGTCATGTT > NC_000913/1544251‑1544506 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |