Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,620,207 | G→A | *73* (TAG→TAA) | marB → | periplasmic mar operon regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,620,207 | 0 | G | A | 100.0% | 256.9 / NA | 80 | *73* (TAG→TAA) | marB | periplasmic mar operon regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (40/40); total (40/40) |
GTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCG > NC_000913/1620083‑1620342 | gtgCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGcccc > 1:1320653/1‑139 (MQ=255) tGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACAtct < 1:760318/139‑1 (MQ=255) tGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACAtct > 1:483825/1‑139 (MQ=255) tGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACAtct < 2:483825/139‑1 (MQ=255) cGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCgg < 2:1060829/139‑1 (MQ=255) gTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCggg < 2:695676/139‑1 (MQ=255) ggTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGc < 1:671978/139‑1 (MQ=255) gttCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGtt < 1:856532/114‑1 (MQ=255) gttCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGtt > 2:856532/1‑114 (MQ=255) tCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCttatta > 1:1004313/1‑139 (MQ=255) 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caccGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCtt < 1:1471370/139‑1 (MQ=255) accGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCttatt > 2:273501/1‑117 (MQ=255) accGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCttatt < 1:273501/117‑1 (MQ=255) cGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGtt > 1:1242493/1‑89 (MQ=255) cGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGtt < 2:1242493/89‑1 (MQ=255) tttGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCggg < 2:345720/106‑1 (MQ=255) tttGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCggg > 1:345720/1‑106 (MQ=255) tGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCa > 1:688481/1‑139 (MQ=255) aaaTCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCaa > 2:288131/1‑139 (MQ=255) caTGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGtt < 1:499885/73‑1 (MQ=255) caTGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGtt > 2:499885/1‑73 (MQ=255) aTGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTAc > 2:1456080/1‑114 (MQ=255) aTGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTAc < 1:1456080/114‑1 (MQ=255) ggTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACa < 1:92887/139‑1 (MQ=255) 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gCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGatat > 2:668527/1‑139 (MQ=255) gTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACa > 2:951691/1‑139 (MQ=255) gATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGc < 1:33839/139‑1 (MQ=255) aTAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGAtata > 1:1392604/1‑134 (MQ=255) aTAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGAtata < 2:1392604/134‑1 (MQ=255) aTAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGcc < 2:1004313/139‑1 (MQ=255) 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tCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATT‑ACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAgcac > 2:173504/1‑139 (MQ=255) cccTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa < 2:183180/101‑1 (MQ=255) cccTATTATAATCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa > 1:183180/1‑101 (MQ=255) tCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTaaa > 1:1574850/1‑131 (MQ=255) tCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTaaa < 2:1574850/131‑1 (MQ=255) tCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCa < 1:16892/138‑1 (MQ=255) tCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCa > 2:16892/1‑138 (MQ=255) tCAACACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAg > 1:1385365/1‑139 (MQ=255) aaCACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACAtctc > 2:1594047/1‑36 (MQ=255) aaCACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACAtctc < 1:1594047/36‑1 (MQ=255) aaCACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa < 1:1119988/88‑1 (MQ=255) aaCACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa > 2:1481872/1‑88 (MQ=255) aaCACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa > 2:1119988/1‑88 (MQ=255) aaCACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa < 1:1481872/88‑1 (MQ=255) aaCACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGAc > 1:1456885/1‑139 (MQ=255) aaCACGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGAc > 1:1195470/1‑139 (MQ=255) cacGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTcc > 2:1121771/1‑51 (MQ=255) cacGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTcc < 1:1121771/51‑1 (MQ=255) cacGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGc > 1:885380/1‑76 (MQ=255) cacGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGc < 2:885380/76‑1 (MQ=255) cacGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa > 1:1567802/1‑86 (MQ=255) cacGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATa < 2:1567802/86‑1 (MQ=255) cacGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACa < 2:933623/88‑1 (MQ=255) cacGCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGAccc > 1:36569/1‑139 (MQ=255) caagCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCCCCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACa > 1:933623/4‑88 (MQ=255) gCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGc > 1:61671/1‑73 (MQ=255) gCTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGc < 2:61671/73‑1 (MQ=255) cTATGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTa < 2:1141762/139‑1 (MQ=255) tGTAATTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATT‑ACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCg < 1:173504/139‑1 (MQ=255) | GTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCG > NC_000913/1620083‑1620342 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |