Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,984,193 | G→A | *412* (TAG→TAA) | aslB → | putative AslA‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,984,193 | 0 | G | A | 100.0% | 259.7 / NA | 80 | *412* (TAG→TAA) | aslB | putative AslA‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (37/43); total (37/43) |
TTGTGTGCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCGTCAGCATCGCATCCGGCAAAGG > NC_000913/3984065‑3984328 | ttGTGTGCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATcggcgg < 1:300218/139‑1 (MQ=255) gtgCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGgccgc > 1:635383/1‑139 (MQ=255) tgCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTGTGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGgccgcc > 2:961050/1‑139 (MQ=255) ggTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCgg > 2:1351451/1‑139 (MQ=255) 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tatCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc < 1:1542186/139‑1 (MQ=255) tatCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCCGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc < 1:1042767/139‑1 (MQ=255) tatCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCCGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc > 2:1042767/1‑139 (MQ=255) tCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCATGGTCGCCCGGCCAGCGACATTAGGCATGCGCATTTGCGGGTGGTGAGTAAGTAAAAAGCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 1:1589889/139‑1 (MQ=39) tCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTg < 1:203323/102‑1 (MQ=255) tCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTg > 2:203323/1‑102 (MQ=255) 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tGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGAt > 1:1179579/1‑139 (MQ=255) aTTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGgcc < 2:285181/80‑1 (MQ=255) aTTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGgcc > 1:285181/1‑80 (MQ=255) gCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAAtt < 1:1351451/139‑1 (MQ=255) gcACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGTTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGtt > 2:1098020/1‑80 (MQ=255) gcACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGTTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGtt < 1:1098020/80‑1 (MQ=255) cGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAAAAATCGGCGGCCGCC‑GCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGc < 1:856613/139‑1 (MQ=255) 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agtaAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 2:1361820/59‑1 (MQ=255) agtaAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg > 1:1361820/1‑59 (MQ=255) gtaAAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCGTCAGCATCGCATCCGGCAAAgg > 1:138571/1‑139 (MQ=255) | TTGTGTGCCGGGTATCAGCGTTATTTCCGCCATCTACCGCCATATCTTAAAGCAATGGCTGATTTGCTGGCGCACGGTCGCCCGGCCAGCGACATTATGCATGCGCATTTGCTGGTGGTGAGTAAGTAGAAATCGGCGGCCGCCTGCGGTTGATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACATGATCGTGCAAATTCAATAAATTGCAGCGTTCTGTAGGCTGGATAAGATGCGTCAGCATCGCATCCGGCAAAGG > NC_000913/3984065‑3984328 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |