| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,077,469 | G→A | L7L (TTG→TTA) | yiiD → | GNAT family putative N‑acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,077,469 | 0 | G | A | 96.4% | 169.5 / ‑4.1 | 56 | L7L (TTG→TTA) | yiiD | GNAT family putative N‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base A (25/29); total (26/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTT > NC_000913/4077334‑4077596 | aCTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCa > 1:20954/1‑139 (MQ=255) tATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACg < 2:20954/139‑1 (MQ=255) tATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACg < 2:1229030/139‑1 (MQ=255) aTTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACgg > 1:924075/1‑139 (MQ=255) ttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGa < 2:924075/139‑1 (MQ=255) tcgtcgAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGaa > 1:517013/1‑139 (MQ=255) tcgtcgAACGCTACCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGaa > 1:1338587/1‑139 (MQ=255) tcgAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACa > 1:1018777/1‑139 (MQ=255) cGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAagaga < 2:517013/139‑1 (MQ=255) tGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAagagagag < 1:24221/139‑1 (MQ=255) cGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTAt < 1:37987/139‑1 (MQ=255) cAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 1:1144547/139‑1 (MQ=255) cAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 2:1338587/139‑1 (MQ=255) cAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 2:865817/139‑1 (MQ=255) aGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGAGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCa < 2:1054784/115‑1 (MQ=255) aGCAAGACATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATAATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCa > 1:1054784/1‑115 (MQ=255) gCAAAAGATTAACACGCAAGCAGGACGCTCCGCCGCGGGTAGGCAGATATCGTTGGTCAATGATGGCCGCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCAGGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTa < 1:428299/139‑1 (MQ=255) agaTGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTAt < 2:882661/139‑1 (MQ=255) aaCACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCt < 2:1018777/139‑1 (MQ=255) cGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCgg < 2:1157342/139‑1 (MQ=255) gACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGTCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACg > 1:1220015/1‑93 (MQ=255) gACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGTCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACg < 2:1220015/93‑1 (MQ=255) gACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAagaga < 1:33745/105‑1 (MQ=255) gACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAagaga > 2:33745/1‑105 (MQ=255) aCGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACaaa < 2:484611/139‑1 (MQ=255) gCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaaga > 1:596157/1‑139 (MQ=255) ggATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAAt < 1:490770/139‑1 (MQ=255) cAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACg > 1:1543302/1‑73 (MQ=255) cAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACg < 2:1543302/73‑1 (MQ=255) tCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTa > 2:1156433/1‑121 (MQ=255) tCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACt < 2:28581/131‑1 (MQ=255) tCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACt > 1:28581/1‑131 (MQ=255) tCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGttt > 1:760346/1‑139 (MQ=255) tCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCATCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTa < 1:1156433/121‑1 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCg < 1:1133194/132‑1 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCg > 2:1133194/1‑132 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGaa > 2:1343587/1‑139 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGaa > 2:137909/1‑139 (MQ=255) ccccGTGAGATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGaaa > 2:1049602/1‑139 (MQ=255) ccccGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTAt > 1:1354960/1‑78 (MQ=255) ccccGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTAt < 2:1354960/78‑1 (MQ=255) ccccGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGaaa < 1:137909/139‑1 (MQ=255) tGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCt < 2:1524091/128‑1 (MQ=255) tGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCt < 2:1014740/128‑1 (MQ=255) tGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCt > 1:1524091/1‑128 (MQ=255) tGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCt > 1:1014740/1‑128 (MQ=255) aGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACGAACagaag > 1:67757/1‑83 (MQ=255) aGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACGAACagaag < 2:67757/83‑1 (MQ=255) tGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCt > 2:455167/1‑47 (MQ=255) tGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCt < 1:455167/47‑1 (MQ=255) gCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTa < 2:285450/116‑1 (MQ=255) gCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTa > 1:285450/1‑116 (MQ=255) gCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGt > 1:605065/1‑139 (MQ=255) cTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGtt > 2:1226155/1‑139 (MQ=255) aGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTaga < 2:406172/75‑1 (MQ=255) aGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTaga > 1:406172/1‑75 (MQ=255) | ACTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTT > NC_000913/4077334‑4077596 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |