| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,331,634 | C→T | A378V (GCG→GTG) | proP → | proline/glycine betaine transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,331,634 | 0 | C | T | 100.0% | 221.0 / NA | 69 | A378V (GCG→GTG) | proP | proline/glycine betaine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (38/31); total (38/31) | |||||||||||
TTGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTAT > NC_000913/4331499‑4331767 | ttGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGAt > 2:566035/1‑139 (MQ=255)ttGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGAt > 2:1123343/1‑139 (MQ=255) cTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTcc < 2:1274163/139‑1 (MQ=255) tttGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGa < 1:1123343/139‑1 (MQ=255) tttGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGa > 2:1183274/1‑139 (MQ=255) tttGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGa > 2:602705/1‑139 (MQ=255) gtgtTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGatgc < 2:314822/139‑4 (MQ=255) gtgtTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATCCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGc < 1:758329/139‑1 (MQ=255) gtTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCat < 1:602705/139‑1 (MQ=255) ggCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTcc < 2:1270262/128‑1 (MQ=255) ggCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTcc > 1:1270262/1‑128 (MQ=255) gCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATcc > 2:415420/1‑139 (MQ=255) tCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTa < 2:169490/139‑1 (MQ=255) tATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTg > 2:727950/1‑139 (MQ=255) tATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTg > 2:1326720/1‑139 (MQ=255) aTTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTgg > 1:286301/1‑139 (MQ=255) gATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTATCTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcggcg < 1:566035/139‑1 (MQ=255) tAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcgg < 2:1287248/128‑1 (MQ=255) tAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcgg > 1:1287248/1‑128 (MQ=255) aCGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAatat > 2:1197105/1‑139 (MQ=255) tCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTc < 2:286301/139‑1 (MQ=255) tCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTc > 1:856359/1‑139 (MQ=255) cATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCg < 2:856359/139‑1 (MQ=255) cATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCg > 1:1282747/1‑139 (MQ=255) ggTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCat < 1:533543/80‑1 (MQ=255) ggTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCat > 2:533543/1‑80 (MQ=255) tGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTggc > 1:585747/1‑139 (MQ=255) ggCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCa < 1:1288679/94‑1 (MQ=255) ggCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCa > 2:1288679/1‑94 (MQ=255) ggCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCt > 2:1544911/1‑135 (MQ=255) ggCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCt < 1:1544911/135‑1 (MQ=255) tGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCctg > 1:472852/1‑139 (MQ=255) cTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGaa > 2:936567/1‑139 (MQ=255) gCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAg > 2:1499566/1‑139 (MQ=255) cTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACg > 2:380258/1‑109 (MQ=255) cTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACg < 1:380258/109‑1 (MQ=255) cTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGc > 2:216726/1‑139 (MQ=255) cTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGc > 2:1366219/1‑139 (MQ=255) cTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGc > 1:1437711/1‑139 (MQ=255) cTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGc > 2:539416/1‑139 (MQ=255) cTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGc > 1:836728/1‑139 (MQ=255) tACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCg < 2:1269245/139‑1 (MQ=255) cGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGc < 2:122447/42‑1 (MQ=255) cGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGc > 1:122447/1‑42 (MQ=255) gCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATAttt > 2:829899/1‑78 (MQ=255) gCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATAttt < 1:829899/78‑1 (MQ=255) cGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAAt < 1:415420/139‑1 (MQ=255) cGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAAt < 2:472852/139‑1 (MQ=255) gTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATc > 2:1518800/1‑139 (MQ=255) gTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATc > 2:1576350/1‑139 (MQ=255) gTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATc > 2:1605985/1‑139 (MQ=255) ttATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCat < 1:267906/38‑1 (MQ=255) ttATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCat > 2:267906/1‑38 (MQ=255) ttCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGatgatg > 2:96752/1‑139 (MQ=255) tCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgc < 1:1326720/139‑1 (MQ=255) cTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcc < 1:96752/139‑1 (MQ=255) cTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcc < 1:727950/139‑1 (MQ=255) ccTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcctgc < 1:1197105/139‑1 (MQ=255) tGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCt < 1:887166/91‑1 (MQ=255) tGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCt > 2:887166/1‑91 (MQ=255) tGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTa > 2:1259332/1‑139 (MQ=255) tGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTa < 1:1398763/139‑1 (MQ=255) gCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcggcg > 2:258974/1‑46 (MQ=255) gCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcggcg < 1:258974/46‑1 (MQ=255) gCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcgg > 2:1491479/1‑44 (MQ=255) gCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcgg < 1:1491479/44‑1 (MQ=255) gCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGCCGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCa > 1:262503/1‑117 (MQ=255) gCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCa < 2:262503/117‑1 (MQ=255) gCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTAGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGCTGCCTGGCTAt < 1:936567/139‑1 (MQ=255) | TTGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTAT > NC_000913/4331499‑4331767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |