| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 14,742 | T→C | L192P (CTG→CCG) | dnaJ → | chaperone Hsp40, DnaK co‑chaperone |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 14,742 | 0 | T | C | 100.0% | 78.5 / NA | 24 | L192P (CTG→CCG) | dnaJ | chaperone Hsp40, DnaK co‑chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (14/10); total (14/10) | |||||||||||
CGGTGCAAAACCAGGTACACAGCCGCAGACTTGTCCGACCTGTCATGGTTCTGGTCAGGTGCAGATGCGCCAGGGATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCTGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCGGCAGGGGTGGACACTGGAGACCGCATCCGTCTTGCGGGCGAAGGTGAAGCGGGCG > NC_000913/14617‑14873 | cGGTGCAAAACCAGGTACACAGCCGCAGACTTGTCCGACCTGTCATGGTTCTGGTCAGGTGCAGATGCGCCAGGGATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCg > 1:406483/1‑139 (MQ=255) tACACAGCCGCAGACTTGTCCGACCTGTCATGGTTCTGGTCAGGTGCAGATGCGCCAGGGATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATgtcat < 2:910840/139‑1 (MQ=255) aGCCGCAGACTTGTCCGACCTGTCATGGTTCTGGTCAGGTGCAGATGCGCCAGGGATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGc < 1:1072737/122‑1 (MQ=255) aGCCGCAGACTTGTCCGACCTGTCATGGTTCTGGTCAGGTGCAGATGCGCCAGGGATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGc > 2:1072737/1‑122 (MQ=255) ggTCAGGTGCAGATGCGCCAGGGATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCg < 1:55990/87‑1 (MQ=255) ggTCAGGTGCAGATGCGCCAGGGATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCg > 2:55990/1‑87 (MQ=255) aTGCGCCAGGGATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCgg < 1:981833/139‑1 (MQ=255) gcCAGGGATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGTAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCGGCAgg > 2:74033/1‑139 (MQ=255) ccAGGGATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCGGCAggg > 2:24803/1‑139 (MQ=255) ggATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACg > 1:626686/1‑111 (MQ=255) ggATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACg < 2:626686/111‑1 (MQ=255) cttcGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCGGCAGGGGTGGACACt > 1:889006/1‑139 (MQ=255) tGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCGGCAGGGGTGGACACTGGAGAc < 1:360576/139‑1 (MQ=255) cTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGAt < 1:691763/40‑1 (MQ=255) cTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCGGCAGGGGTGGACACTGGAGACCGCATCCGTCtt > 2:558806/1‑139 (MQ=255) cTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCGGCAGGGGTGGACACTGGAGACCGCATCCGTCtt > 2:893166/1‑139 (MQ=255) cTGACCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGAt > 2:691763/1‑40 (MQ=255) tCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCGGCAGGGGTGGACACTGGAGACCGCATCCGTCTTGCg > 1:721080/1‑139 (MQ=255) cacaCTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCGGCAGGGGTGGACACTGGAGACCGCATCCGTCTTGCggg < 1:1061646/139‑1 (MQ=255) cacTGTCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCGGCAGGGGTGGACACTGGAGACCGCATCCGTCTTGCGGGCg < 2:721080/139‑1 (MQ=255) tCAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCGGCAGGGGTGGACACTGGAGACCGCATCCGTCTTGCGGGCGAAGGt > 1:156440/1‑139 (MQ=255) cAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATgtcatggt > 1:912945/1‑48 (MQ=255) cAGGGCCGCGGTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATgtcatggt < 2:912945/48‑1 (MQ=255) ggTACGCCGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCGGCAGGGGTGGACACTGGAGACCGCATCCGTCTTGCGGGCGAAGGTGAAGCGGGCg > 2:969595/1‑139 (MQ=255) | CGGTGCAAAACCAGGTACACAGCCGCAGACTTGTCCGACCTGTCATGGTTCTGGTCAGGTGCAGATGCGCCAGGGATTCTTCGCTGTACAGCAGACCTGTCCACACTGTCAGGGCCGCGGTACGCTGATCAAAGATCCGTGCAACAAATGTCATGGTCATGGTCGTGTTGAGCGCAGCAAAACGCTGTCCGTTAAAATCCCGGCAGGGGTGGACACTGGAGACCGCATCCGTCTTGCGGGCGAAGGTGAAGCGGGCG > NC_000913/14617‑14873 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |