| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,449,228 | C→T | *274* (TAG→TAA) | yfcO ← | DUF2544 family putative outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,449,228 | 0 | C | T | 100.0% | 76.0 / NA | 25 | *274* (TAG→TAA) | yfcO | DUF2544 family putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (13/12); total (13/12) | |||||||||||
GCGTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTC > NC_000913/2449104‑2449362 | gcgTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTTGTGTATCTAAGGGTTAc < 1:671730/128‑1 (MQ=255)gcgTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTAc > 2:671730/1‑128 (MQ=255) cgTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACAACTCATTCAGt < 1:390439/139‑1 (MQ=255) gtTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACaa > 1:1059958/1‑119 (MQ=255) gtTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACaa < 2:1059958/119‑1 (MQ=255) gattgaAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAAcc > 2:481038/1‑139 (MQ=255) attgaAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGaa < 1:562192/136‑1 (MQ=255) attgaAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGaa > 2:562192/1‑136 (MQ=255) aGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATActg < 1:481038/139‑1 (MQ=255) cccTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGt > 2:278847/1‑139 (MQ=255) aggagTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCa > 2:661271/1‑124 (MQ=255) aggagTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCa < 1:661271/124‑1 (MQ=255) gcgTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGAcc > 2:687597/1‑139 (MQ=255) aTGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTAc > 2:882305/1‑43 (MQ=255) aTGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTAc < 1:882305/43‑1 (MQ=255) ggggCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAGCCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATActgc < 2:221019/92‑1 (MQ=255) ggggCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAGCCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATActgc > 1:221019/1‑92 (MQ=255) gAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGt < 1:712607/126‑1 (MQ=255) gAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGt > 2:712607/1‑126 (MQ=255) aaTGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTgg > 2:475192/1‑75 (MQ=255) aaTGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTgg < 1:475192/75‑1 (MQ=255) tCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATActg > 2:1035248/1‑66 (MQ=255) tCTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATActg < 1:1035248/66‑1 (MQ=255) cTAAGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGAc > 1:313649/1‑139 (MQ=255) aGGGTTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTc < 2:68781/139‑1 (MQ=255) | GCGTTGTTGGTGTTGATTGAAGTCGAAGAGTGGCTGCCGCCGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTC > NC_000913/2449104‑2449362 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |