| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,247,620 | C→T | A279A (GCC→GCT) | malK → | maltose ABC transportor ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,247,620 | 0 | C | T | 100.0% | 77.2 / NA | 25 | A279A (GCC→GCT) | malK | maltose ABC transportor ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (12/13); total (12/13) | |||||||||||
GGTTCGCCAAAGATGAACTTCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCCAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCATATCCAGATCCCTTCCATTC > NC_000913/4247486‑4247753 | ggTTCGCCAAAGATGAACTTCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAata < 2:358412/139‑1 (MQ=255) tCGCCAAAGATGAACTTCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGt > 2:28679/1‑139 (MQ=255) aaaGATGAACTTCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTg < 1:1001897/139‑1 (MQ=255) gAACTTCCTGCCGGTAAAAGGGACTGCCACTGCAATCGAGCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGGCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTAtt < 2:206671/139‑1 (MQ=255) ttCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGcc < 2:496380/139‑1 (MQ=255) tCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGccc < 1:4300/139‑1 (MQ=255) cGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCgg > 1:268397/1‑116 (MQ=255) cGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCgg < 2:268397/116‑1 (MQ=255) gTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAgg > 1:524995/1‑139 (MQ=255) gTGGAGCTGCCGATACCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAgg > 2:400008/1‑139 (MQ=255) aGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGa > 1:923249/1‑139 (MQ=255) cGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTAc < 2:938953/96‑1 (MQ=255) cGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTAc > 1:938953/1‑96 (MQ=255) aTCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGa > 2:365868/1‑139 (MQ=255) gTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCt > 1:923383/1‑53 (MQ=255) gTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCt < 2:923383/53‑1 (MQ=255) gCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGa > 2:1791/1‑99 (MQ=255) gCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGa < 1:1791/99‑1 (MQ=255) cAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCa < 1:400008/139‑1 (MQ=255) aaaGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCa < 1:365868/139‑1 (MQ=255) cGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCATATcc < 2:923249/139‑1 (MQ=255) gTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCATATCCa > 2:422208/1‑139 (MQ=255) tGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTg < 1:779256/55‑1 (MQ=255) tGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTg > 2:779256/1‑55 (MQ=255) ggAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCATATCCAGATCCCTTCCATTc > 1:239682/1‑139 (MQ=255) | GGTTCGCCAAAGATGAACTTCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCCAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCATATCCAGATCCCTTCCATTC > NC_000913/4247486‑4247753 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |