| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,024,887 | C→T | S179S (AGC→AGT) | xanQ → | xanthine permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,024,887 | 0 | C | T | 98.8% | 252.1 / ‑4.9 | 81 | S179S (AGC→AGT) | xanQ | xanthine permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (44/36); total (44/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
CTTCATTTATCTTGCCCTATTTACGTCGGGTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGCGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGCATGGGAGGGATCGCCATTGGGCTATGTGTCGGCTATATCGCA > NC_000913/3024754‑3025022 | cTTCATTTATCTTGCCCTATTTACGTCGGGTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTAc > 1:773034/1‑139 (MQ=255) gCCCTATTTACGTCGGGTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTAc > 2:273871/1‑139 (MQ=255) gCCCTATTTACGTCGGGTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGACATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTAc > 1:1114601/1‑139 (MQ=255) tttACGTCGGGTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACAt < 2:773034/139‑1 (MQ=255) gTCGGGTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCaa < 1:62870/124‑1 (MQ=255) gTCGGGTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCaa > 2:62870/1‑124 (MQ=255) gTCGGGTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACg > 1:1127071/1‑129 (MQ=255) gTCGGGTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACg < 2:1127071/129‑1 (MQ=255) gTCGGGTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCgg > 2:998275/1‑139 (MQ=255) ggTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGtt > 2:749578/1‑139 (MQ=255) ggTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGtt > 2:494310/1‑139 (MQ=255) gTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAAtt > 1:1240675/1‑121 (MQ=255) gTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAAtt < 2:1240675/121‑1 (MQ=255) gTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTg > 1:1237873/1‑139 (MQ=255) gTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTg > 2:1072854/1‑139 (MQ=255) cGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTAtt < 1:1025317/139‑1 (MQ=255) cTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGaa < 2:1074869/116‑1 (MQ=255) cTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGaa > 1:1074869/1‑116 (MQ=255) cTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCgg < 2:945012/124‑1 (MQ=255) cTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCgg > 1:945012/1‑124 (MQ=255) cTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGTGTTGGTTTATTGGt < 1:998275/139‑1 (MQ=255) cTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGt < 1:1072854/139‑1 (MQ=255) aCCGTCAGCGGTATTGTGGTACTCATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGttt > 2:1341314/1‑139 (MQ=255) aTTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGa > 1:562636/1‑139 (MQ=255) aTTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGa < 2:352177/139‑1 (MQ=255) ttGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGAt < 1:749578/139‑1 (MQ=255) gTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTAtt > 1:594005/1‑116 (MQ=255) gTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTAtt < 2:594005/116‑1 (MQ=255) gTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAAtt < 1:430751/126‑1 (MQ=255) gTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAAtt > 2:430751/1‑126 (MQ=255) tACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCtt > 1:834082/1‑139 (MQ=255) cTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTAc < 2:383340/77‑1 (MQ=255) cTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTAc > 1:383340/1‑77 (MQ=255) cTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTa > 1:1315382/1‑139 (MQ=255) cTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTa > 2:1186080/1‑139 (MQ=255) gatgatCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTa < 2:1264403/109‑1 (MQ=255) gatgatCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTa > 1:1264403/1‑109 (MQ=255) gatgatCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGAt > 2:148842/1‑129 (MQ=255) gatgatCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGAt < 2:172435/129‑1 (MQ=255) gatgatCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGAt > 1:172435/1‑129 (MQ=255) gatgatCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGAt < 1:148842/129‑1 (MQ=255) gatgatCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAAc > 2:510646/1‑139 (MQ=255) gatgatCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAAc > 2:674618/1‑139 (MQ=255) atgatCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAAct > 2:753275/1‑139 (MQ=255) gatCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAActgc > 1:790237/1‑139 (MQ=255) tCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGa < 2:409909/85‑1 (MQ=255) tCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGa > 1:409909/1‑85 (MQ=255) ttAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCa < 1:1186080/139‑1 (MQ=255) gATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTg > 1:1175130/1‑139 (MQ=255) aTTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTAt > 1:615744/1‑91 (MQ=255) aTTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTAt < 2:615744/91‑1 (MQ=255) aTTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGAt > 1:273294/1‑110 (MQ=255) aTTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGAt < 2:273294/110‑1 (MQ=255) aTTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAActg > 1:685178/1‑122 (MQ=255) aTTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAActg < 2:685178/122‑1 (MQ=255) aTTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGc > 1:1200729/1‑139 (MQ=255) aTTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGc > 1:349327/1‑139 (MQ=255) aaGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACg < 2:1315382/139‑1 (MQ=255) aaGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACg < 2:1237873/139‑1 (MQ=255) aaGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGCGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACg < 1:622299/139‑1 (MQ=255) aaGTCGACATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACg < 2:1114601/139‑1 (MQ=255) gTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGCa < 2:834082/139‑1 (MQ=255) gTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGCa < 1:674618/139‑1 (MQ=255) ggCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGCATgg < 1:1341314/139‑1 (MQ=255) gCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATtg < 1:459114/93‑1 (MQ=255) gCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATtg > 2:459114/1‑93 (MQ=255) gCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTg < 1:916863/128‑1 (MQ=255) gCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATATCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTg > 2:916863/1‑128 (MQ=255) ttttGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGCAAGGGAGGGATCGcc < 2:790237/139‑1 (MQ=255) ggtggAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGt < 2:1215281/71‑1 (MQ=255) ggtggAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGt > 1:1215281/1‑71 (MQ=255) tggAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGCATGGGAGGGATCGCCATTggg > 2:896049/1‑139 (MQ=255) cggaggaTTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGCTGGTTTATTGGTTTTACTTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGCATGGGAGGGATCGCCATTggg > 2:890956/2‑139 (MQ=255) gaggaTTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTaa < 2:1240586/72‑1 (MQ=255) gaggaTTTGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTaa > 1:1240586/1‑72 (MQ=255) tGCAGCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGCATGGGAGGGATCGCCATTGGGCTATGTGTc < 1:273871/139‑1 (MQ=255) gCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTAtt > 2:999037/1‑53 (MQ=255) gCCAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTAtt < 1:999037/53‑1 (MQ=255) ccAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGCATgg < 2:612670/108‑1 (MQ=255) ccAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGCATgg > 1:612670/1‑108 (MQ=255) cAAAAGCAGTGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGATTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGAATGGGAGGGATCGCCATTGGGCTATGTGTCGGCtat > 2:503965/1‑139 (MQ=255) gcagtGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGCATGGGAGGGATCGCCATTGGGCTATGTGTCGGCTATATCGc < 2:562636/139‑1 (MQ=255) cagtGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTACTTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGCATGGGAGGGATCGCCATTGGGCTATGTGTCGGCTATATCGCa < 1:890956/139‑1 (MQ=255) cagtGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGCATGGGAGGGATCGCCATTGGGCTATGTGTCGGCTATATCGCa < 1:503965/139‑1 (MQ=255) | CTTCATTTATCTTGCCCTATTTACGTCGGGTTATTACGCCTACCGTCAGCGGTATTGTGGTACTGATGATCGGCTTAAGCCTGATTAAAGTCGGCATTATCGATTTTGGTGGAGGATTTGCAGCCAAAAGCAGCGGTACGTTCGGCAATTACGAACATCTCGGCGTTGGTTTATTGGTTTTAATTGTGGTGATCGGCTTTAACTGCTGTCGCAGTCCGTTGCTACGCATGGGAGGGATCGCCATTGGGCTATGTGTCGGCTATATCGCA > NC_000913/3024754‑3025022 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |