| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,247,620 | C→T | A279A (GCC→GCT) | malK → | maltose ABC transportor ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,247,620 | 0 | C | T | 100.0% | 169.6 / NA | 53 | A279A (GCC→GCT) | malK | maltose ABC transportor ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (26/27); total (26/27) | |||||||||||
CGGTTCGCCAAAGATGAACTTCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCCAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCATATCCAGATCCCTTCCATTCGT > NC_000913/4247485‑4247755 | cGGTTCGCCAAAGATGAACTTCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGTCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAat < 2:917727/139‑1 (MQ=255) ttCGCCAAAGATGAACTTCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATg > 1:260616/1‑139 (MQ=255) tCGCCAAAGATGAACTTCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATg > 1:467473/1‑138 (MQ=255) tCGCCAAAGATGAACTTCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATg < 2:467473/138‑1 (MQ=255) tCGCCAAAGATGAACTTCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATAGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGt > 1:1072364/1‑139 (MQ=255) cGCCAAAGATGAACTTCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTc < 1:404467/139‑1 (MQ=255) gCCAAAGATGAACTTCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCg < 1:1255642/139‑1 (MQ=255) cTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCgg > 2:205298/1‑139 (MQ=255) tGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGa > 1:178043/1‑139 (MQ=255) gCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGaa > 1:465638/1‑139 (MQ=255) tAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCg < 2:517852/131‑1 (MQ=255) tAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCg > 1:517852/1‑131 (MQ=255) aGTGACCGCCACCGCAATCGAGCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTg < 2:56109/139‑1 (MQ=255) gACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCg > 2:467021/1‑139 (MQ=255) cGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGt > 2:1094398/1‑139 (MQ=255) ccACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGa < 1:863410/139‑1 (MQ=255) aCCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGata > 2:705809/1‑139 (MQ=255) aCCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGata < 1:961712/139‑1 (MQ=255) tCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTc > 2:590415/1‑139 (MQ=255) tCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTc < 1:1094398/139‑1 (MQ=255) tGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCt < 2:1235224/139‑1 (MQ=255) gTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGccc < 2:1064022/95‑1 (MQ=255) gTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGccc > 1:1064022/1‑95 (MQ=255) gTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAgg > 2:526312/1‑139 (MQ=255) gTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAgg > 2:1041606/1‑139 (MQ=255) gAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGa > 2:346719/1‑95 (MQ=255) gAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGa < 1:346719/95‑1 (MQ=255) gAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTg < 2:1072364/139‑1 (MQ=255) aGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGTAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGccc < 2:1201620/91‑1 (MQ=255) aGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGccc > 1:1201620/1‑91 (MQ=255) aGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGa > 2:590289/1‑139 (MQ=255) gCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGcc > 1:358531/1‑89 (MQ=255) gCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGcc < 2:358531/89‑1 (MQ=255) cAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCg < 1:526312/139‑1 (MQ=255) aaGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCgg < 1:467021/139‑1 (MQ=255) cTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGaaa < 2:465638/139‑1 (MQ=255) gCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACt > 2:195444/1‑139 (MQ=255) ccAGTTGAAAGGCGTGATGTCCCGGTTGGAGTTAATATGTCTCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGATTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTc < 2:1224474/139‑1 (MQ=255) ccAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTc < 1:1041606/139‑1 (MQ=255) cAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCt < 2:214209/94‑1 (MQ=255) cAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCt > 1:214209/1‑94 (MQ=255) ttGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGGCGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAAt < 2:260616/139‑1 (MQ=255) gAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATcc < 1:590289/139‑1 (MQ=255) tGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCATATCCa > 1:370524/1‑138 (MQ=255) tGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCATATCCa < 2:370524/138‑1 (MQ=255) tGATGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCATATCCAg < 1:205298/139‑1 (MQ=255) tGTCCAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCATATCCAGATc > 1:1158523/1‑139 (MQ=255) cAGGTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCATATCCAGATCCCtt > 1:1061911/1‑139 (MQ=255) gTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTg < 2:1199067/45‑1 (MQ=255) gTTGGAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTg > 1:1199067/1‑45 (MQ=255) ggAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTc < 2:267638/112‑1 (MQ=255) ggAGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTc > 1:267638/1‑112 (MQ=255) aGCTAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCATATCCAGATCCCTTCCATTCGt > 1:1268508/1‑139 (MQ=255) | CGGTTCGCCAAAGATGAACTTCCTGCCGGTAAAAGTGACCGCCACCGCAATCGATCAAGTGCAGGTGGAGCTGCCGATGCCAAATCGTCAGCAAGTCTGGCTGCCAGTTGAAAGCCGTGATGTCCAGGTTGGAGCCAATATGTCGCTGGGTATTCGCCCGGAACATCTACTGCCGAGTGATATCGCTGACGTCATCCTTGAGGGTGAAGTTCAGGTCGTCGAGCAACTCGGCAACGAAACTCAAATCCATATCCAGATCCCTTCCATTCGT > NC_000913/4247485‑4247755 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |