| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1323147 | 70 (0.960) | 41 (0.560) | 19/208 | 2.4 | 53.6% | intergenic (‑65/‑73) | trpL/yciV | trp operon leader peptide/PHP domain protein |
| ? | NC_000913 | = 3742633 | 1 (0.010) | intergenic (‑101/‑100) | yiaJ/yiaK | transcriptional repressor for the yiaKLMNO‑lyxK‑sgbHUE operon/2,3‑diketo‑L‑gulonate reductase, NADH‑dependent | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTG > NC_000913/1323009‑1323284 | cTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGTAAGTGCGCCACCAATCTTTCATTACGAAGATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACTTGAACTTGCGTACTGGTTACCTAGTTCGATGATTAATTATCAACAg > 1:1324218/1‑139 (MQ=255) ttACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCt < 2:690149/139‑1 (MQ=255) acTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGc > 2:878924/1‑139 (MQ=255) cTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGcc > 2:782049/1‑139 (MQ=255) tGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCt > 1:944787/1‑120 (MQ=255) tGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCt < 2:944787/120‑1 (MQ=255) tGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAGTATTTGCCa > 1:1259375/1‑139 (MQ=255) tGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCa > 2:222489/1‑139 (MQ=255) tGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCa > 1:471211/1‑139 (MQ=255) tGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCa < 2:71083/139‑1 (MQ=255) gCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAg < 2:471211/139‑1 (MQ=255) gCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAg > 1:250334/1‑139 (MQ=255) gCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAg < 2:250334/139‑1 (MQ=255) gCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAg > 2:673955/1‑139 (MQ=255) ccGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGaa > 2:146166/1‑139 (MQ=255) gTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGt < 1:673955/139‑1 (MQ=255) gcgcCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCg > 2:1246843/1‑139 (MQ=255) tttCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACa < 1:146166/139‑1 (MQ=255) tttCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACa < 1:782049/139‑1 (MQ=255) tttCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACa < 2:783365/139‑1 (MQ=255) tCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACAtt > 1:1094952/1‑139 (MQ=255) gTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATc < 1:964228/139‑1 (MQ=255) gTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATc < 1:222489/139‑1 (MQ=255) gAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGa > 2:1517424/1‑139 (MQ=255) gAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGa > 1:1082411/1‑139 (MQ=255) ttGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAg < 2:1704738/97‑1 (MQ=255) ttGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAg > 1:1704738/1‑97 (MQ=255) tCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTgcg > 1:638338/1‑139 (MQ=255) aCCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGac < 1:1246843/139‑1 (MQ=255) aCCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGac < 2:1259375/139‑1 (MQ=255) cccTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCgg > 1:579321/1‑96 (MQ=255) cccTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCgg < 2:579321/96‑1 (MQ=255) ttttACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGaa > 1:382158/1‑139 (MQ=255) cGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATg < 1:1517424/139‑1 (MQ=255) tGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCa > 2:651640/1‑139 (MQ=255) gAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAATATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAg > 1:278880/1‑139 (MQ=255) gAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAg < 2:638338/139‑1 (MQ=255) aaCTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCt > 1:288488/1‑46 (MQ=255) aaCTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGt > 1:944889/1‑139 (MQ=255) gCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAATATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGAttt < 2:278880/139‑1 (MQ=255) gTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTg < 2:1082411/139‑1 (MQ=255) atatactatgccgatgattaattGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaatggggaa > 2:891854‑M1/12‑31 (MQ=255) atactatgccgatgattaaTTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaatggggaaag < 1:1498205‑M1/130‑111 (MQ=255) atgccgatgATTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaatggggaaagaagtg > 1:1397213‑M1/5‑24 (MQ=255) atgccgatgATTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaatggggaaagaagtg > 1:1286896‑M1/5‑24 (MQ=255) tgccgatGATTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaatggggaaagaagtga > 1:1704347‑M1/4‑23 (MQ=255) tgccgatGATTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaatggggaaagaagtga > 1:791777‑M1/4‑23 (MQ=255) gTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAg > 2:59297/1‑100 (MQ=255) gTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAg < 1:59297/100‑1 (MQ=255) gTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCa > 1:360554/1‑139 (MQ=255) ttCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAg < 1:1076330/88‑1 (MQ=255) ttCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAg > 2:1076330/1‑88 (MQ=255) tCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGaa > 1:165342/1‑81 (MQ=255) tCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGaa < 2:165342/81‑1 (MQ=255) tCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGc > 1:1094007/1‑113 (MQ=255) cGATGATTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaatt < 1:608865‑M1/64‑45 (MQ=255) cGATGATTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaatt > 2:608865‑M1/1‑20 (MQ=255) cGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATAc > 1:550205/1‑139 (MQ=255) cGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATAc > 1:1754976/1‑139 (MQ=255) gatgatTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATAcc < 2:382158/139‑1 (MQ=255) atgatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaatggggaaagaagtgatggga > 1:391590‑M1/1‑18 (MQ=255) atgatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaatggggaaagaagtgatggga > 2:93472‑M1/1‑18 (MQ=255) atgatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaat < 1:530021‑M1/120‑103 (MQ=255) atgatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaat > 2:530021‑M1/1‑18 (MQ=255) atgatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaa > 2:305302‑M1/1‑18 (MQ=255) atgatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaa < 1:305302‑M1/118‑101 (MQ=255) atgatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcagga < 2:1474785‑M1/109‑92 (MQ=255) atgatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcagga > 1:1474785‑M1/1‑18 (MQ=255) atgatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaa > 1:1807845‑M1/1‑18 (MQ=255) atgatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaa < 2:1807845‑M1/80‑63 (MQ=255) atgatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaa < 1:750048‑M1/50‑33 (MQ=255) atgatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaag > 2:1652899‑M1/1‑18 (MQ=255) atgatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaag < 1:1652899‑M1/37‑20 (MQ=255) atgatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaa < 1:437167‑M1/36‑19 (MQ=255) atgatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaa > 2:437167‑M1/1‑18 (MQ=255) tgatTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGTGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGac < 2:840558/98‑1 (MQ=255) gatTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaatggggaaagaagtgatgggaaa > 1:1729312‑M1/1‑16 (MQ=255) atTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaa > 2:956084‑M1/1‑15 (MQ=255) atTAATTGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaa < 1:956084‑M1/115‑101 (MQ=255) atTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAg < 1:974943/139‑1 (MQ=255) aaTTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAAc > 1:1499719/1‑37 (MQ=255) aaTTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAAc < 2:1499719/37‑1 (MQ=255) tGTCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaatggggaaagaagtgatgggaaaaaaagag < 1:1390461‑M1/139‑131 (MQ=255) tCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaatggggaaagaagtgatgggaaaaaaagagaa < 2:1027905‑M1/139‑133 (MQ=255) tCAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaatggggaaagaagtgatgggaaaaaaagagaa < 1:56350‑M1/139‑133 (MQ=255) cAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacgg < 1:152184‑M1/74‑69 (MQ=255) cAACAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacgg > 2:152184‑M1/1‑6 (MQ=255) aaCAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaat < 2:34517‑M1/107‑103 (MQ=255) aaCAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaat > 1:34517‑M1/1‑5 (MQ=255) aaCAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacgg > 1:1242417‑M1/1‑5 (MQ=255) aaCAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacgg < 2:1242417‑M1/73‑69 (MQ=255) aaCAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGTCATACCACAGCTTCCGATgg > 1:924723/1‑139 (MQ=255) aaCAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATgg > 1:837089/1‑139 (MQ=255) cAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacgg < 1:1612171‑M1/71‑69 (MQ=255) cAGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacgg > 2:1612171‑M1/1‑3 (MQ=255) cAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGc > 1:449723/1‑81 (MQ=255) cAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGc < 2:449723/81‑1 (MQ=255) cAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACg < 1:500765/106‑1 (MQ=255) cAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACg > 2:500765/1‑106 (MQ=255) aGgattgatgaatttcaaaagacataaaaatcaattgttataaattatctgtcgagatcgtgaactacggcacactttgcgctaccatcaggacgcgacaaaatggggaaagaagtgatgggaaaaaaagagaacgaga < 2:391590‑M1/139‑138 (MQ=255) | CTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAATATTTGCCAGAACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTG > NC_000913/1323009‑1323284 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |