| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 788831 = | 0 (0.000) | 109 (1.500) | 58/208 | 0.1 | 99.1% | coding (7/1041 nt) coding (1149/1149 nt) |
galM galK |
aldose 1‑epimerase, type‑1 mutarotase, galactose mutarotase galactokinase |
| ? | NC_000913 | 3742633 = | 2 (0.030) | intergenic (‑101/‑100) | yiaJ/yiaK | transcriptional repressor for the yiaKLMNO‑lyxK‑sgbHUE operon/2,3‑diketo‑L‑gulonate reductase, NADH‑dependent | |||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAT > NC_000913/3742496‑3742771 | tctcGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAAC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCct < 2:391590‑M2/139‑3 (MQ=255) ttCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAAC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCctgttga < 1:56350‑M2/139‑8 (MQ=255) ttCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAAC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCctgttga < 2:1027905‑M2/139‑8 (MQ=255) ctctTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAAC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCctgttgaca < 1:1390461‑M2/139‑10 (MQ=255) cgtcgcgctgatcccggaagagctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgcagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc < 1:1316877‑M2/9‑1 (MQ=255) cgtcgcgctgatcccggaagagctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc < 2:294163‑M2/9‑1 (MQ=255) cgtcgcgctgatcccggaagagctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc < 2:785469‑M2/9‑1 (MQ=255) cgctgatcccggaagagctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGtt < 1:1011100‑M2/14‑1 (MQ=255) tttCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAAC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCctgttgacaattaatc > 1:1729312‑M2/1‑123 (MQ=255) tCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAAC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCctgttgacaattaatcat > 2:93472‑M2/1‑121 (MQ=255) tCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAAC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCctgttgacaattaatcat > 1:391590‑M2/1‑121 (MQ=255) ccATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAAC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCctgttgacaattaatcatcg > 1:392326‑M2/1‑119 (MQ=255) ccggaagagctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTg < 1:795235‑M2/22‑1 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAAC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCctgttgacaattaatcatcggca > 1:791777‑M2/1‑116 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAAC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCctgttgacaattaatcatcggca > 1:1704347‑M2/1‑116 (MQ=255) cACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAAC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCctgttgacaattaatcatcggcat > 1:1286896‑M2/1‑115 (MQ=255) cttTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAAC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCctgttgacaattaatcatcggcatagtat < 1:1498205‑M2/139‑30 (MQ=255) agctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGata > 2:356208‑M2/111‑139 (MQ=255) ctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc > 2:180235‑M2/109‑117 (MQ=255) ctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc < 1:180235‑M2/9‑1 (MQ=255) ctggtgcctgccgtacagcaagctgtcgctgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGatata > 1:569754‑M2/109‑139 (MQ=255) 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tgaacaatatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAAtt < 1:1441923‑M2/60‑1 (MQ=255) atatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGc > 1:1283670‑M2/74‑139 (MQ=255) tatgaagcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGcc > 2:450999‑M2/73‑81 (MQ=255) ccGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAAC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCctgttg < 1:152184‑M2/74‑7 (MQ=255) ccGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATAAC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCctg < 1:1612171‑M2/71‑4 (MQ=255) agcaaaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATc < 2:1477151‑M2/40‑1 (MQ=255) aaaacaggtattaaagagactttttacgtttgtaaaccatcacaaggagcaggacagtgctgaCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCg < 2:1572882‑M2/76‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |