| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 586,280 | T→C | N210S (AAC→AGC) | envY ← | porin thermoregulatory transcriptional activator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 586,280 | 0 | T | C | 100.0% | 382.6 / NA | 106 | N210S (AAC→AGC) | envY | porin thermoregulatory transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (51/55); total (51/55) | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCA > NC_000913/586146‑586415 | ttCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATc > 1:1682832/1‑139 (MQ=255) tCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATcc < 1:443704/139‑1 (MQ=255) caccacATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCa < 2:26929/139‑1 (MQ=255) caccacATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCa < 1:627467/139‑1 (MQ=255) cacaTCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCa < 2:686316/139‑1 (MQ=255) caTCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTa > 2:1346014/1‑130 (MQ=255) caTCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTa < 1:1346014/130‑1 (MQ=255) tttGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCAATCAATAACATCTg > 1:1502674/1‑139 (MQ=255) tGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGGTAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGGGTGATATTTTTGCTTGCCAGCAATAACATCTGTa < 1:1803060/139‑1 (MQ=255) tGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCa > 1:501301/1‑124 (MQ=255) tGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCa < 2:501301/124‑1 (MQ=255) cGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACgg > 2:323539/1‑139 (MQ=255) cTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCg > 2:603053/1‑139 (MQ=255) tGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGt > 2:1028885/1‑139 (MQ=255) gTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTa < 2:550352/139‑1 (MQ=255) gaTAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATcc < 2:400922/107‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tgtCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGGCGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTa < 2:1414176/91‑1 (MQ=255) tgtCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTTCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTa > 1:1414176/1‑91 (MQ=255) tgtCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATc < 1:576028/93‑1 (MQ=255) tgtCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATc > 2:576028/1‑93 (MQ=255) tgtCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATaa < 1:766738/102‑1 (MQ=255) tgtCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATaa > 2:766738/1‑102 (MQ=255) tCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTa > 2:149553/1‑108 (MQ=255) tCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTa > 2:1329015/1‑108 (MQ=255) tCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTa < 1:1329015/108‑1 (MQ=255) tCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTa < 1:149553/108‑1 (MQ=255) tCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAAt < 1:323539/139‑1 (MQ=255) cAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGaca < 1:1821896/126‑1 (MQ=255) cAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGaca > 2:1821896/1‑126 (MQ=255) ccGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGa > 1:1352965/1‑120 (MQ=255) 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tAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTa < 1:858863/100‑1 (MQ=255) tAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTa > 2:858863/1‑100 (MQ=255) aCGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCt > 1:1625368/1‑139 (MQ=255) gCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAAt < 1:131647/84‑1 (MQ=255) gCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAAt > 2:131647/1‑84 (MQ=255) gaTAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATCTTTTTGCTATCCCTCAATAACATCTGTATGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAAt > 2:1003489/1‑111 (MQ=255) gaTAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAAt < 1:1003489/111‑1 (MQ=255) cgacgTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACAct < 2:477575/92‑1 (MQ=255) gacgTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTAt < 1:247290/52‑1 (MQ=255) gacgTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTAt > 2:247290/1‑52 (MQ=255) tgctgcTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGc > 1:330498/1‑108 (MQ=255) tgctgcTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGc < 2:330498/108‑1 (MQ=255) gctgctATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAAt < 2:1297018/96‑1 (MQ=255) gctgctATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGc > 2:1442347/1‑139 (MQ=255) gctgctATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGCAATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAAt > 1:1297018/1‑96 (MQ=255) 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atTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTgggg > 2:81286/1‑112 (MQ=255) atTTTTGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTgggg < 1:81286/112‑1 (MQ=255) tttttGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTc > 1:1193475/1‑139 (MQ=255) ttttGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCg < 1:603053/139‑1 (MQ=255) ttGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCa < 1:415841/139‑1 (MQ=255) ttGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCa < 2:77506/139‑1 (MQ=255) ttGCTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCa > 2:213163/1‑139 (MQ=255) | TTCACCACATCACTTTTTGTCGCTGTTTGGCGAGATAATTCAACGGTGTCAGGCCGTAAAACGCCTTAAAAACAGAGATAAAGTACGACGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCA > NC_000913/586146‑586415 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |