| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,706,174 | G→A | P511L (CCG→CTG) | dppA ← | dipeptide/heme ABC transporter periplasmic binding protein, dipeptide chemotaxis receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,706,174 | 0 | G | A | 100.0% | 319.5 / NA | 98 | P511L (CCG→CTG) | dppA | dipeptide/heme ABC transporter periplasmic binding protein, dipeptide chemotaxis receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (52/46); total (52/46) | |||||||||||
CGGAGCGCATCAGGCATTTTTGCCTTTGCCATCAGTCTTGTATGGCTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCGGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGATCGTGCATCACCACCTGCGCTTGTTTGTACAGTTCAACGCGTTTATTGTGGTCGTCGGTAGCACGCGCCGGTTGAATCAGATCTTCAAA > NC_000913/3706046‑3706307 | cGGAGCGCATCAGGCATTTTTGCCTTTGCCATCAGTCTTGTATGGCTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAacac > 1:1216817/1‑139 (MQ=255)cGGAGCGCATCAGGCATTTTTGCCTTTGCCATCAGTCTTGTATGGCTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAacac > 2:474455/1‑139 (MQ=255) cgcATCAGGCATTTTTGCCTTTGCCATCAGTCTTGTATGGCTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTgg > 2:1003896/1‑139 (MQ=255) cgcATCAGGCATTTTTGACTTTGCCATCAGCCGTGTATGGCTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGATGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATCGCCTTTAACTTCTTTACGTACTAGTTCAAACACGGTgg > 2:372176/1‑139 (MQ=255) aTCAGGCATTTTTGCCTTTGCCATCAGTCTTGTATGGCTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGt < 1:474455/139‑1 (MQ=255) cAGGCATTTTTGCCTTTGCCATCAGTCTTGTATGGCTTTTAATTGTTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGG‑TCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGt > 1:1295201/1‑120 (MQ=255) cAGGCATTTTTGCCTTTGCCATCAGTCTTGTATGGCTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGG‑TCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGt < 2:1295201/120‑1 (MQ=255) tgcctttgccATCAGTCTTGTATGGCTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCa < 2:1216817/139‑1 (MQ=255) tttgccATCAGTCTTGTATGGCTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGc < 2:810715/139‑1 (MQ=255) tttgccATCAGTCTTGTATGGCTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGc < 1:899133/139‑1 (MQ=255) tgccATCAGTCTTGTATGGCTCTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCg < 1:1019788/139‑1 (MQ=255) gccATCAGTCTTGTATGGCTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGc < 2:109204/136‑1 (MQ=255) gccATCAGTCTTGTATGGCTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGc > 1:109204/1‑136 (MQ=255) tGTATGGCTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGATCGt < 2:1467713/139‑1 (MQ=255) tGTATGGCTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGATCGt < 1:1003896/139‑1 (MQ=255) ggCTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGATCGTGCATc > 1:257261/1‑139 (MQ=255) cTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGa > 2:969056/1‑104 (MQ=255) cTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGa < 1:969056/104‑1 (MQ=255) cTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGc < 2:1397221/118‑1 (MQ=255) cTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGc > 1:1397221/1‑118 (MQ=255) cTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGa > 1:1698953/1‑128 (MQ=255) cTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGa < 2:1698953/128‑1 (MQ=255) cTTTTAATTATTCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGATCGt > 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1:916592/1‑139 (MQ=255) tattCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGATCGTGCATCACCACCTgcg < 1:1653670/139‑1 (MQ=255) tattCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGATCGTGCATCACCACCTgcg < 2:1482790/139‑1 (MQ=255) tattCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGATCGTGCATCACCACCTgcg < 2:565031/139‑1 (MQ=255) tattCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGATCGTGCATCACCACCTgcg < 2:916592/139‑1 (MQ=255) tattCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGATCGTGCATCACCACCTgcg < 1:1473317/139‑1 (MQ=255) tattCGATAGAGACGTTTTCGAAGTGATGTTTGCCTAATGGATCAACCACATAGCCTTTAACTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGATCGTGCATCACCACCTgcg < 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aCTTCTTTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGATCGTGCATCACCACCTGCGCTTGTTTGTACAGTTCAACGCGTTTATTGTGGTCGTCGGTAGCACGCGCCGGTTGAATCa < 2:1427094/139‑1 (MQ=255) ttcttTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGATCGTGCATCACCACCTGCGCTTGTTTGTACAGTTCAACGCGTTTATTGTGGTCGTCGGTAGCACGCGCCGGTTGAATCAGa < 2:763667/139‑1 (MQ=255) cttTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATc > 2:786018/1‑41 (MQ=255) cttTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATc < 1:786018/41‑1 (MQ=255) cttTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCa < 1:1092844/42‑1 (MQ=255) cttTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCa > 2:1092844/1‑42 (MQ=255) cttTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGATCGTGCATCACCACCTGCGCTTGTTTGTACAGTTCAACGCGTTTATTGTGGTCGTCGGTAGCAcgcg < 2:276488/123‑1 (MQ=255) cttTACGTACCAGTTCAAACACGGTGGAGTGAGCGATGATCAGTGCCGGAGCCTGATCGTGCATCACCACCTGCGCTTGTTTGTACAGTTCAACGCGTTTATTGTGGTCGTCGGTAGCAcgcg > 1:276488/1‑123 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |