Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,447,891 | G→A | *1260* (TAG→TAA) | tamB → | translocation and assembly module for autotransporter export, inner membrane subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,447,891 | 0 | G | A | 100.0% | 351.5 / NA | 108 | *1260* (TAG→TAA) | tamB | translocation and assembly module for autotransporter export, inner membrane subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (54/54); total (54/54) |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATTTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTATAGCCTGGGCCACTATCCAGGCG > NC_000913/4447754‑4448023 | gAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCg < 2:1748655/139‑1 (MQ=255) tGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCt > 2:843601/1‑139 (MQ=255) gggTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTa < 1:843601/139‑1 (MQ=255) tataGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACgg > 1:411463/1‑127 (MQ=255) 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atCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTgg > 2:1536548/1‑139 (MQ=255) ggAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa < 2:409832/103‑1 (MQ=255) ggAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa < 1:1139023/103‑1 (MQ=255) ggAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa > 2:1139023/1‑103 (MQ=255) ggAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa > 1:409832/1‑103 (MQ=255) ggAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGa > 1:1551212/1‑139 (MQ=255) gAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑TTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGc > 1:1250641/1‑62 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |