Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 72,115 | G→A | *255* (TAG→TAA) | yabI → | DedA family inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 72,115 | 0 | G | A | 100.0% | 233.3 / NA | 72 | *255* (TAG→TAA) | yabI | DedA family inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (38/34); total (38/34) |
ATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATACTAACCCGTAATCCCCAATA > NC_000913/71982‑72248 | attTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGAt > 2:101011/1‑139 (MQ=255) tGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGt > 2:289709/1‑139 (MQ=255) cGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCt > 1:638704/1‑139 (MQ=255) cGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGc < 1:289709/139‑1 (MQ=255) 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gCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCAcgcc < 2:1171939/139‑1 (MQ=255) gCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTACGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCATACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCAcgcc < 1:151080/139‑1 (MQ=255) cGGTGTATATCGCTATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACACAACGCACTACCCGTAGGTCGGATa > 1:53340/1‑124 (MQ=255) cGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATa < 2:53340/124‑1 (MQ=255) gtgtATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCAt > 1:1153600/1‑139 (MQ=255) atCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTtg > 2:265701/1‑45 (MQ=255) atCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTtg < 1:265701/45‑1 (MQ=255) cGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCCCTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGt < 2:953486/139‑1 (MQ=255) atatTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGt > 2:1278225/1‑137 (MQ=255) atatTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGt < 1:1278225/137‑1 (MQ=255) atatTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGc > 1:1131419/1‑139 (MQ=255) atatTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGc > 1:630436/1‑139 (MQ=255) tatTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGcc > 2:576168/1‑51 (MQ=255) tatTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGcc < 1:576168/51‑1 (MQ=255) tatTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCa > 1:146245/1‑139 (MQ=255) atTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTCGc > 1:894361/1‑65 (MQ=39) atTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGATTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGc < 2:894361/65‑1 (MQ=38) ttttGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGcc < 1:204073/65‑1 (MQ=255) ttttGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGcc > 2:204073/1‑65 (MQ=255) ttttGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTAt < 2:562305/74‑1 (MQ=255) ttttGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTAt > 1:562305/1‑74 (MQ=255) ttttGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATa > 2:1284903/1‑139 (MQ=255) ttttGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATa > 1:1136478/1‑139 (MQ=255) ttttGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATa > 2:1067550/1‑139 (MQ=255) tGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCg < 2:276682/95‑1 (MQ=255) tGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCg > 1:276682/1‑95 (MQ=255) cGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAg > 1:1093569/1‑128 (MQ=255) cGTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAg < 2:1093569/128‑1 (MQ=255) gTAAAGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATATTAAcc > 2:1277544/1‑139 (MQ=255) aaaGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATATTAACCCg < 1:1277544/139‑1 (MQ=255) aaaGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATATTAACCCg < 2:1165329/139‑1 (MQ=255) aaaGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATATTAACCCg > 1:539669/1‑139 (MQ=255) aaaGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATATTAACCCg < 2:1118927/139‑1 (MQ=255) aGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATATTAACCCGTa < 1:1067550/139‑1 (MQ=255) aGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATATTAACCCGTa < 2:539669/139‑1 (MQ=255) aGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATATTAACCCGTa < 2:1136478/139‑1 (MQ=255) aGTGGTTGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATATTAACCCGTa < 2:1153600/139‑1 (MQ=255) ttGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGc < 2:411463/49‑1 (MQ=255) ttGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGc > 1:411463/1‑49 (MQ=255) ttGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCcgc > 2:691862/1‑52 (MQ=255) ttGGGGTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCcgc < 1:691862/52‑1 (MQ=255) gTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATATTAACCCGTAATCCCCAATa > 1:254648/1‑139 (MQ=255) gTTTAAGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATATTAACCCGTAATCCCCAATa > 2:718863/1‑139 (MQ=255) | ATTTGTCCCGCGGTCGTTTGTTGTGGCTGACGCCGTTGATTTCTGCCATCGGCGTGGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATACTAACCCGTAATCCCCAATA > NC_000913/71982‑72248 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |