| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,649,041 | G→A | *73* (TAG→TAA) | ydfC → | uncharacterized protein, Qin prophage |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,649,041 | 0 | G | A | 100.0% | 101.9 / NA | 32 | *73* (TAG→TAA) | ydfC | uncharacterized protein, Qin prophage |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (18/14); total (18/14) | |||||||||||
AGCGCAGGATCTGAAATGGGCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAGTAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCACGGGTGAGGTGGAGTGCGTGCGCCGGACACGGGTGCGCATCCGGAACTGACAGTTTACTGAAAGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCA > NC_000913/1648906‑1649174 | aGCGCAGGATCTGAAATGGGCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTtaatag < 2:1170858/139‑1 (MQ=255) aaaTGGGCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAg < 1:253909/139‑1 (MQ=255) gggCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATcaaca < 2:1296637/132‑1 (MQ=255) gggCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATcaaca > 1:1296637/1‑132 (MQ=255) gCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCGAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATcaa < 2:697712/128‑1 (MQ=255) gCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATcaa > 1:697712/1‑128 (MQ=255) ggCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGa > 1:361717/1‑139 (MQ=255) gCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCa > 1:103652/1‑137 (MQ=255) gCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCa < 2:103652/137‑1 (MQ=255) gCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCACg > 1:953422/1‑139 (MQ=255) 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tGCCAGAATGATTACATACCGGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAg > 2:927437/1‑65 (MQ=255) tGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACCAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAg < 1:927437/65‑1 (MQ=255) tGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCACGGGTGAGGTGGAGtgcgtgcg < 1:1041401/94‑1 (MQ=255) tGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCACGGGTGAGGTGGAGtgcgtgcg > 2:1041401/1‑94 (MQ=255) tGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCACGGGTGAGGTGGAGTGCGTGCGCCGGACACGGGTGCGCATCCGGAACTGACAGTTTACTGAAAGGat > 1:199131/1‑139 (MQ=255) ccAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAg < 2:654736/63‑1 (MQ=255) ccAGAATGATTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAg > 1:654736/1‑63 (MQ=255) aTTACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCACGGGTGAGGTGGAGTGCGTGCGCCGGACACGGGTGCGCATCCGGAACTGACAGTTTACTGAAAGGATATTTCCCTGa > 2:233815/1‑139 (MQ=255) ttACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCAc > 1:763783/1‑62 (MQ=255) ttACATACCCGCGTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCAc < 2:763783/62‑1 (MQ=255) cgTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCAc < 1:727657/51‑1 (MQ=255) cgTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCAc > 2:727657/1‑51 (MQ=255) cgTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCACGGGTGAGGTGGCGTGCGTGCGCCGGACACGGGTGCGCATCCGGAACTGACAGTTTACTGAAAGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCa > 2:72596/1‑139 (MQ=255) cgTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCACGGGTGAGGTGGAGTGCGTGCGCCGGACACGGGTGCGCATCCGGAACTGACAGTTTACTGaaa < 1:731832/113‑1 (MQ=255) cgTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCACGGGTGAGGTGGAGTGCGTGCGCCGGACACGGGTGCGCATCCGGAACTGACAGTTTACTGaaa > 2:731832/1‑113 (MQ=255) cgTTAATAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCACGGGTGAGGTGGAGTGCGTGCGCCGGACACGGGTGCGCATCCGGAACTGACAGTTTACTGAAAGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCa < 2:953422/139‑1 (MQ=255) | AGCGCAGGATCTGAAATGGGCTAATGAAGCCAGGGCTAAGCAGGCTGAAAATCTGTCCGCTCTGGAGCAGGATATCACCAATCTGGAAAAAGCAGCGGCATTAAGCATTGCCAGAATGATTACATACCCGCGTTAGTAGCTAATCAACAAAGCTAAGGTTAGTAATTAAGGAGTTCTCCACGGGTGAGGTGGAGTGCGTGCGCCGGACACGGGTGCGCATCCGGAACTGACAGTTTACTGAAAGGATATTTCCCTGAAAAGTCAGACCA > NC_000913/1648906‑1649174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |