| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,841,897 | G→A | *136* (TAG→TAA) T80I (ACT→ATT) |
nudG → ynjH ← |
CTP pyrophosphohydrolase, also hydrolyzes 2‑hydroxy‑dATP, 8‑hydroxy‑dGTP, 5‑hydroxy‑CTP, dCTP and 5‑methyl‑dCTP DUF1496 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,841,897 | 0 | G | A | 100.0% | 167.8 / NA | 53 | *136* (TAG→TAA) T80I (ACT→ATT) | nudG ynjH | CTP pyrophosphohydrolase, also hydrolyzes 2‑hydroxy‑dATP, 8‑hydroxy‑dGTP, 5‑hydroxy‑CTP, dCTP and 5‑methyl‑dCTP DUF1496 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (27/26); total (27/26) | |||||||||||
ACATGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGC > NC_000913/1841774‑1842023 | acaTGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGATCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCAGCTGCCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGt > 2:549275/1‑139 (MQ=255) caTGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGtc > 1:88920/1‑139 (MQ=255) aTGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTa < 2:344444/127‑1 (MQ=255) aTGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTa > 1:344444/1‑127 (MQ=255) cACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgca < 2:460443/128‑1 (MQ=255) cACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgca > 1:460443/1‑128 (MQ=255) cACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCt > 1:280810/1‑139 (MQ=255) ccTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATTCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTc < 1:965555/139‑1 (MQ=255) cgcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAAtt < 2:88920/139‑1 (MQ=255) cAATATCCGCTGGCCCCTTCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACGAGCGGATTAATGCTAAGGATTTTGTCATCATGCTGGCAGTGCAGCAGTATTTCTGCGGCTTTAATTACCGc < 1:549275/139‑1 (MQ=255) gCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCg > 2:1328060/1‑117 (MQ=255) gCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCg < 1:1328060/117‑1 (MQ=255) tGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTgg < 2:1190833/94‑1 (MQ=255) tGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTgg > 1:1190833/1‑94 (MQ=255) tGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGaa > 1:930715/1‑139 (MQ=255) taGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgcag > 1:278089/1‑139 (MQ=255) gagGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGtcat < 1:923532/60‑1 (MQ=255) gagGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGtcat > 2:923532/1‑60 (MQ=255) ggCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACt < 2:278089/139‑1 (MQ=255) cGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTgg > 2:1136954/1‑64 (MQ=255) cGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTgg < 1:1136954/64‑1 (MQ=255) gTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTaa < 2:1345663/43‑1 (MQ=255) gTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTaa > 1:1345663/1‑43 (MQ=255) gTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGc < 2:703549/86‑1 (MQ=255) gTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGc > 1:703549/1‑86 (MQ=255) gTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGc < 1:833151/98‑1 (MQ=255) gTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCGAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGc > 2:833151/1‑98 (MQ=255) cTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGc > 1:47464/1‑139 (MQ=255) ttACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTg > 2:1230659/1‑58 (MQ=255) ttACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTg < 1:1230659/58‑1 (MQ=255) ttACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGTGTACAgtgttg < 1:794067/139‑6 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTgg > 2:801358/1‑52 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTgg < 1:801358/52‑1 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTgg < 1:1304002/52‑1 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTgg > 2:1304002/1‑52 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCtt < 1:1069629/71‑1 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCtt > 2:1069629/1‑71 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCtt < 2:1227600/92‑1 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCtt > 1:1227600/1‑92 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTa > 2:629201/1‑130 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTa < 1:629201/130‑1 (MQ=255) gcgcCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCt < 2:47464/139‑1 (MQ=255) gcgcCGCCAGACCAGCCGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGTGCt < 2:930715/139‑1 (MQ=255) gccgccAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGa > 2:245510/1‑139 (MQ=255) cgccAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCAt < 2:18608/48‑1 (MQ=255) cgccAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCAt > 1:18608/1‑48 (MQ=255) aCCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgcag < 2:1102887/47‑1 (MQ=255) aCCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgcag > 1:1102887/1‑47 (MQ=255) aCCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGc > 1:623931/1‑139 (MQ=255) gCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgcagc > 2:1116017/1‑44 (MQ=255) gCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgcagc < 1:1116017/44‑1 (MQ=255) gCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCtt > 2:9447/1‑54 (MQ=255) gCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCtt < 1:9447/54‑1 (MQ=255) | ACATGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGC > NC_000913/1841774‑1842023 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |