Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 253,084 | A→G | T126A (ACA→GCA) | yafP → | GNAT family putative N‑acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 253,084 | 0 | A | G | 100.0% | 143.9 / NA | 41 | T126A (ACA→GCA) | yafP | GNAT family putative N‑acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (21/20); total (21/20) |
GTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACA > NC_000913/252955‑253219 | gttgACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAagc > 1:1297712/1‑139 (MQ=255) gACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAagcagc > 1:677890/1‑139 (MQ=255) aCCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAagcagca > 2:954540/1‑139 (MQ=255) aCCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAagcagca > 2:884647/1‑139 (MQ=255) aCCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAagcagca > 1:131014/1‑139 (MQ=255) aCCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAagcagca > 2:30069/1‑139 (MQ=255) aTACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGtt < 1:741767/139‑1 (MQ=255) acacCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGa < 1:30069/139‑1 (MQ=255) acacCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGa < 2:289103/139‑1 (MQ=255) ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCgg > 2:1141897/1‑139 (MQ=255) ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCgg > 1:15530/1‑139 (MQ=255) ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCgg > 2:1208304/1‑139 (MQ=255) ggTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGATTCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCGGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCg < 1:1141897/139‑1 (MQ=255) ggTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCg < 2:1198599/139‑1 (MQ=255) ggTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCg < 1:954540/139‑1 (MQ=255) aGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTa < 2:677890/139‑1 (MQ=255) cgcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGtt > 2:238659/1‑115 (MQ=255) cgcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGtt < 1:238659/115‑1 (MQ=255) tGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGTCGCAAGTATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTATGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAgcg < 2:871680/94‑1 (MQ=255) tGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGTATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAgcg > 1:871680/1‑94 (MQ=255) tGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAagcagca < 2:1329273/93‑1 (MQ=255) tGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAagcagca > 1:1329273/1‑93 (MQ=255) tGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGata > 2:1135928/1‑139 (MQ=255) gTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCg > 2:934436/1‑139 (MQ=255) cTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCa < 2:1297712/139‑1 (MQ=255) aaTCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCa < 1:342107/136‑1 (MQ=255) aaTCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCa > 2:342107/1‑136 (MQ=255) aaCTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTtat < 1:185923/113‑1 (MQ=255) aaCTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTtat > 2:185923/1‑113 (MQ=255) tACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAg > 2:1157502/1‑139 (MQ=255) ggTGGACGCAAACATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCtt > 1:1024720/1‑139 (MQ=255) aCGCAAACATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAAt < 2:1024720/139‑1 (MQ=255) aaCCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg < 2:15530/139‑1 (MQ=255) ccGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGtt < 1:570239/56‑1 (MQ=255) ccGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGtt > 2:570239/1‑56 (MQ=255) ccGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcc < 1:1135928/139‑1 (MQ=255) aaaaCCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTatat < 1:828569/87‑1 (MQ=255) aaaaCCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTatat > 2:828569/1‑87 (MQ=255) aaCCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAAGCCCGCCTg > 2:874239/1‑139 (MQ=255) gTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGAtt < 1:1157502/139‑1 (MQ=255) cAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCcaca < 1:874239/139‑1 (MQ=255) | GTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCC‑‑TTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACA > NC_000913/252955‑253219 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |