| Predicted mutation | ||||||
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| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_010468 | = 922808 | 0 (0.000) | 190 (0.240) | 156/578 | 1.4 | 100% | coding (404/426 nt) | ECOLC_RS04555 | EscJ/YscJ/HrcJ family type III secretion inner membrane ring protein |
| ? | NC_010468 | 923585 = | 0 (0.000) | coding (15/345 nt) | ECOLC_RS04565 | type III secretion system protein PrgK | |||||
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
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NC_010468/922506‑922808‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gataatggCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGCTGTTATGGAAGTATAGGGCCATT > NC_010468/923585‑923882 TGCTGTTTTACAAAGACATAATATTAATGCTGAAAAGAAGGATCAAGGCAAAACTGGATTCTCAATCTATGTTGAACCAACGGATTTTGCTTCTGCGGTGGATTGGCTAAAAATCTACAATCTCCCGGGTAAGCCTGATATTCAAATATCGCAGATGTTCCCTGCAGATGCACTCGTTTCATCTCCACGAGCGGAAAAAGCAAGGCTATATTCTGCTATTGAGCAGTGGTTAGAGCAATCTCTCAAAATTATGGATGGCATTATTTCTTCGAGAGTACATGTTAGTTACGATGTTGAT > 2:1804037/1‑298 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CGAGAGTACATGTTAGTTACGATGTTGATAATGGCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGC < 2:5969364/298‑1 GAGAGTACATGTTAGTTACGATGTTGATAATGGCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGA < 2:6196294/299‑1 TACATGTTAGTTACGATGTTGATAATGGCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGC > 2:5820120/1‑299 TGTTAGTTACGATGTTGATAATGGCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGC < 2:4984701/299‑1 AGTTACGATGTTGATAATGGCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGCTGTT > 1:5725210/1‑299 CGATGTTGATAATGGCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAGATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGCTGTTATGG > 1:3478725/1‑298 GTTGATAATGGCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGCTGTTATGGAAGTA > 2:735685/1‑299 TGATAATGGCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGCTGTTATGGAAGTAT < 1:2876278/298‑1 ATAATGGCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGCTGTTATGGAAGTATAG < 1:5541299/298‑1 TGCTGTTTTACAAAGACATAATATTAATGCTGAAAAGAAGGATCAAGGCAAAACTGGATTCTCAATCTATGTTGAACCAACGGATTTTGCTTCTGCGGTGGATTGGCTAAAAATCTACAATCTCCCGGGTAAGCCTGATATTCAAATATCGCAGATGTTCCCTGCAGATGCACTCGTTTCATCTCCACGAGCGGAAAAAGCAAGGCTATATTCTGCTATTGAGCAGTGGTTAGAGCAATCTCTCAAAATTATGGATGGCATTATTTCTTCGAGAGTACATGTTAGTTACGATGTTGATAATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_010468/922506‑922808‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gataatggCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGCTGTTATGGAAGTATAGGGCCATT > NC_010468/923585‑923882 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |