| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 589 total aligned reads displayed.
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ctcccaaaccaaGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGc < 1:6079258‑M2/286‑1 (MQ=255) ccaaaccaaGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGCt < 1:4165838‑M2/287‑1 (MQ=255) caaaccaaGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGCTTTTa < 2:2545293‑M2/291‑1 (MQ=255) aaaccaaGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGCTTTTAg < 1:837726‑M2/292‑1 (MQ=255) aaccaaGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGCTTTTAGt > 1:1306598‑M2/7‑299 (MQ=255) ggTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGCTTTTAGTGCCAgc < 1:2422525/299‑1 (MQ=255) | TGACGATTAACTGAGATTGCGTATGCTTCGTTAGTCGAGCCAGAAACTTTTGTAGCAAACACAGCAAACAGGACACCAAATGACTGGGGCCATTTATAGCCTGACAGCTGATAATTACCATTATTCAGTGTTACAGCTTTGGCTGCTGCACTTGATGGAATCGTCAGCCACTGGAGTATCAACCCTCCTGGCAAAAGTTGTTTTCCGTAATAATCCCTCACCCCACTAAATGAAACCATGTCCGGTATCTGATTTTCCCCTGTGCCCACATCCCGTTTTGCCGCCTCTCCCAAACCAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGCTTTTAGTGCCAGC > NC_010468/3032762‑3033358 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |