New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 493 total aligned reads displayed.
ACATCGGTAGAGTGACGATTAACTGAGATTGCGTATGCTTCGTTAGTCGAGCCAGAAACTTTTGTAGCAAACACAGCAAACAGGACACCAAATGACTGGGGCCATTTATAGCCTGACAGCTGATAATTACCATTATTCAGTGTTACAGCTTTGGCTGCTGCACTTGATGGAATCGTCAGCCACTGGAGTATCAACCCTCCTGGCAAAAGTTGTTTTCCGTAATAATCCCTCACCCCACTAAATGAAACCATGTCCGGTATCTGATTTTCCCCTGTGCCCACATCCCGTTTTGCCGCCTCTCCCAAACCAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGT > NC_010468/3032750‑3033343 | cATCGGTAGAGTGACGATTAACTGAGATTGCGTATGCTTCGTTAGTCGAGCCAGAAACTTTTGTAGCAAACACAGCAAACAGGACACCAAATGACTGGGGCCATTTATAGCCTGACAGCTGATAATTACCATTATTCAGTGTTACAGCTTTGGCTGCTGCACTTGATGGAATCGTCAGCCACTGGAGTATCAACCCTCCTGGCAAAAGTTGTTTTCCGTAATAATCCCTCACCCCACTAAATGAAACCATGTCCGGTATCTGATTTTCCCCTGTGCCCACATCCCGTTTTGCCGCCtct > 2:1306728‑M2/1‑296 (MQ=255) 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ttGCCGCCTCTCCCAAACCAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGa > 1:3462872/1‑298 (MQ=255) ttGCCGCCTCTCCCAAACCAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGa > 2:4478358/1‑298 (MQ=255) gccgccTCTCCCAAACCAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACa < 2:2293263/298‑1 (MQ=255) | ACATCGGTAGAGTGACGATTAACTGAGATTGCGTATGCTTCGTTAGTCGAGCCAGAAACTTTTGTAGCAAACACAGCAAACAGGACACCAAATGACTGGGGCCATTTATAGCCTGACAGCTGATAATTACCATTATTCAGTGTTACAGCTTTGGCTGCTGCACTTGATGGAATCGTCAGCCACTGGAGTATCAACCCTCCTGGCAAAAGTTGTTTTCCGTAATAATCCCTCACCCCACTAAATGAAACCATGTCCGGTATCTGATTTTCCCCTGTGCCCACATCCCGTTTTGCCGCCTCTCCCAAACCAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGT > NC_010468/3032750‑3033343 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |