| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_010468 | 261,688 | C→A | D273E (GAC→GAA) | ECOLC_RS01210 → | DUF4049 domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_010468 | 261,688 | 0 | C | A | 99.8% | 1533.9 / ‑5.7 | 397 | D273E (GAC→GAA) | ECOLC_RS01210 | DUF4049 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (201/195); total (201/196) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 397 total aligned reads displayed.
ATAAAACCCCAGTTCGCTGACAGAACCTATTTCTCCAATTGTTCACCTGTTGATCCCACAAGTACCAGGCCGACCTATTTTGGCGATACCGATGGCTCAGTCGGTGCAGTTTTGTACGCGCTTTTTGCAACGGGACATTTGGGAATCATGGCTGAAGGAGAAAATTTCCTTAGCCAGTTGCTTAATATAGAAGATGAAGTTCTCAACGTATTGCTAAGGGAGAACTTTAATGAGCAACTTGACACTAATGTTAATATAATAATCAGTATCCTGAACAGAAGAGACATTGTTTTAGACAGTCTTCAGCCTTATTTGGTTATTAATAAAGACGCAGTCACGCCATGTACGTTTCTGGGCGACCAGACTGGCGATCGATTTAGTAATATCTGTGGCGATAAATTTATCATCGATTTATTAAAACGCATAATGAGTATCAATGAAAACGTTCATGTATTAGCTGGAAATCATGAAACGAATTGCAATGGTAACTATATGCAGAACTTCACGCGCATGAAACCACTTGATGAGGATACCTACTCTGGGATAAAAGATTATCCTGTATGTTTCTATGACCCCAAATACAAAATAATG > NC_010468/261392‑261982 | aCCCCAGTTCGCTGACAGAACCTATTTCTCCAATTGTTCACCTGTTGATCCCACAAGTACCAGGCCGACCTATTTTGGCGATACCGATGGCTCAGTCGGTGCAGTTTTGTACGCGCTTTTTGCAACGGGACATTTGGGAATCATGGCTGAAGGAGAAAATTTCCTTAGCCAGTTGCTTAATATAGAAGATGAAGTTCTCAACGTATTGCTAAGGGAGAACTTTAATGAGCAACTTGACACTAATGTTAATATAATAATCAGTATCCTGAACAGAAGAGACATTGTTTTAGAAAGTCtt > 1:552300/1‑298 (MQ=255) 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gTATCCTGAACAGAAGAGACATTGTTTTAGAAAGTCTTCAGCCTTATTTGGTTATTAATAAAGACGCAGTCACGCCATGTACGTTTCTGGGCGACCAGACTGGCGATCGATTTAGTAATATCTGTGGCGATAAATTTATCATCGATTTATTAAAACGCATAATGAGTATCAATGAAAACGTTCATGTATTAGCTGGAAATCATGAAACGAATTGCAATGGTAACTATATGCAGAACTTCACGCGCATGAAACCACTTGATGAGGATACCTACTCTGGGATAAAAGATTATCCTGTATGt > 2:2218836/1‑299 (MQ=255) cTGAACAGAAGAGACATTGTTTTAGAAAGTCTTCAGCCTTATTTGGTTATTAATAAAGACGCAGTCACGCCATGTACGTTTCTGGGCGACCAGACTGGCGATCGATTTAGTAATATCTGTGGCGATAAATTTATCATCGATTTATTAAAACGCATAATGAGTATCAATGAAAACGTTCATGTATTAGCTGGAAATCATGAAACGAATTGCAATGGTAACTATATGCAGAACTTCACGCGCATGAAACCACTTGATGAGGATACCTACTCTGGGATAAAAGATTATCCTGTATGTTTCTa > 1:857469/1‑299 (MQ=255) aCAGAAGAGACATTGTTTTAGAAAGTCTTCAGCCTTATTTGGTTATTAATAAAGACGCAGTCAGGCCATGTACGTTTCTGGGCGACCAGACTGGCGATCGATTTAGTAATATCTGTGGCGATAAATTTATCATCGATTTATTAAAACGCATAATGAGTATCAATGAAAACGTTCATGTATTAGCTGGAAATCATGAAACGAATTGCAATGGTAACTATATGCAGAACTTCACGCGCATGAAACCACTTGATGAGGATACCTACTCTGGGATAAAAGATTATCCTGTATGTTTCTATGAc > 2:2915770/1‑299 (MQ=255) 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ATAAAACCCCAGTTCGCTGACAGAACCTATTTCTCCAATTGTTCACCTGTTGATCCCACAAGTACCAGGCCGACCTATTTTGGCGATACCGATGGCTCAGTCGGTGCAGTTTTGTACGCGCTTTTTGCAACGGGACATTTGGGAATCATGGCTGAAGGAGAAAATTTCCTTAGCCAGTTGCTTAATATAGAAGATGAAGTTCTCAACGTATTGCTAAGGGAGAACTTTAATGAGCAACTTGACACTAATGTTAATATAATAATCAGTATCCTGAACAGAAGAGACATTGTTTTAGACAGTCTTCAGCCTTATTTGGTTATTAATAAAGACGCAGTCACGCCATGTACGTTTCTGGGCGACCAGACTGGCGATCGATTTAGTAATATCTGTGGCGATAAATTTATCATCGATTTATTAAAACGCATAATGAGTATCAATGAAAACGTTCATGTATTAGCTGGAAATCATGAAACGAATTGCAATGGTAACTATATGCAGAACTTCACGCGCATGAAACCACTTGATGAGGATACCTACTCTGGGATAAAAGATTATCCTGTATGTTTCTATGACCCCAAATACAAAATAATG > NC_010468/261392‑261982 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |