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| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 434 total aligned reads displayed.
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NC_010468/922504‑922808‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gataatggCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGCTGTTATGGAAGTATAGGGCCAT > NC_010468/923585‑923881 CTGTTTTACAAAGACATAATATTAATGCTGAAAAGAAGGATCAAGGCAAAACTGGATTCTCAATCTATGTTGAACCAACGGATTTTGCTTCTGCGGTGGATTGGCTAAAAATCTACAATCTCCCGGGTAAGCCTGATATTCAAATATCGCAGATGTTCCCTGCAGATGCACTCGTTTCATCTCCACGAGCGGAAAAAGCAAGGCTATATTCTGCTATTGAGCAGTGGTTAGAGCAATCTCTCAAAATTATGGATGGCATTATTTCTTCGAGAGTACATGTTAGTTACGATGTTGATAA < 1:5518795/298‑1 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GATGTTGATAATGGCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGCTGTTATGG > 2:1103798/1‑297 ATGTTGATAATGGCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGCTGTTATGGAA < 2:574947/298‑1 TGGCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGCTGTTATGGAAGTATAGGGCC < 1:3805804/298‑1 TGGCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGCTGTTATGGAAGTATAGGGC > 1:6579751/1‑297 TGGCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGCTGTTATGGAAGTATAGGGC > 2:7566890/1‑297 TGGCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGCTGTTATGGAAGTATAGGGC > 1:8115952/1‑297 CTTGCTGTTTTACAAAGACATAATATTAATGCTGAAAAGAAGGATCAAGGCAAAACTGGATTCTCAATCTATGTTGAACCAACGGATTTTGCTTCTGCGGTGGATTGGCTAAAAATCTACAATCTCCCGGGTAAGCCTGATATTCAAATATCGCAGATGTTCCCTGCAGATGCACTCGTTTCATCTCCACGAGCGGAAAAAGCAAGGCTATATTCTGCTATTGAGCAGTGGTTAGAGCAATCTCTCAAAATTATGGATGGCATTATTTCTTCGAGAGTACATGTTAGTTACGATGTTGATAATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_010468/922504‑922808‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gataatggCGATAGTGGTAAAACTGCTTTACCAATTCATATTTCTGTACTTGCAGTATATGAAAAAGATATCAACCCAGAAATAAAAATAAATGACATCAAGAGATTTATTGTTAATAGTTTTGCAAGCGTACAATATGAAAATATTTCTGTTGTATTGTCAAAACGAAGAGACATTATTGAGCAAGCACCAACATATGAAATTAGCGAACTTGTTTTTGCTTATGATAAGGCTATGCCGGTTTCTATCTTACTTGCATTAATATCCGTAGCGACTTGCTGGCTGTTATGGAAGTATAGGGCCAT > NC_010468/923585‑923881 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |