New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_010468 | 1591575 = | 666 (0.660) | 82 (0.100) +CCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGT |
11/492 | 5.4 | 11.1% | intergenic (+136/+581) | mqo/eco | malate dehydrogenase (quinone)/serine protease inhibitor ecotin |
? | NC_010468 | = 1592089 | 917 (0.900) | intergenic (+650/+67) | mqo/eco | malate dehydrogenase (quinone)/serine protease inhibitor ecotin | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
CCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_010468/1591870‑1591575 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAA < NC_010468/1592089‑1591806 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGCCGCTGGCCCGT‑CTTATCAGCACTACCCCGCTTTGAAGTGCTCC > 2:2350655/1‑298 CGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACCCCGCTGTGAAGTGCTTCACCC > 1:261188/1‑298 CGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCCCCACCCCGGAGGTTGGATAAGGCGGCTACGCCGCATCCGCCAT‑CTAACGCTCACGCCGGTTTCCTTATTCGACCCTGCTGCGT‑CTTATCGCGCCTCCACCCCTGTGCAGTGTTCCccgt > 2:4122989/1‑294 GAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTGTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTCACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGGCCGT‑CTTCTCAGGCCTACCCCCCTGCGCGGTGCTCCACCCCtgag > 2:4465785/1‑294 GAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTTCACCCCGTAG > 1:4142005/1‑298 CCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGGTAAGTGCTCCACACCGTAGGTT > 2:1806243/1‑298 CTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGCAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGTTGCCACGCCGGCGCGC‑CTTATCAGGCCGCCACCGCTGTGACCTGCTCCTCCCCGTCGCTTGGcacagg > 2:772682/1‑292 CGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGCAGTGCTCCCCCCCGTATGTCGGAACAGGCGCTTcccc > 2:2793079/1‑294 TCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGCCGCTGGCGCGT‑CTTAGCAGCCCTACCCCGCTGTGAAGTATTTCACCCCGTATGTTGGAGAAGGCTGCTACGCACCACCCGAC > 2:2285023/1‑298 CAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGCAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGCCCTACACCGCTGTCAAGGGCTCCACCCCGTAGGTTGGATCACGCTGTTACGCCGCATCCGCCAgttaa > 2:2861997/1‑293 GGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTCCCCCGCTTGGAAGTGCTTCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCCGTTGCGCCCCATCCGACATCCAACG > 2:5112105/1‑298 GGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGCCCCACCCCGCTGCGCAGTGCTTCACCCCGGAGGTTGGATCTGGCTGCTCCCCCACATCCGCCATCgtatc > 2:5216845/1‑293 GCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGGAGGTTGGATAACGCGGTTACGCCGCATCCGACAA‑CTAACGCCCAAACCGGTTGCCTGATGCGAGGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACCCCGCTGTGCACAACTCCCAGCCGCAGCTGGCACAAGGGCGTTACGCCGCAACCGACATTCAccca > 2:3712191/1‑294 GTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATACGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGACGTACTCCACCCCGTACGTTGGATAAGGCGGGTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCCAGCCAGTTCCCTtt > 2:7999105/1‑296 caAACTCCCAGGCCGGTGGCCGAGTGTGACGCTGGCAGTTCTTTGAGGGCCGAAACCGCGGTGAAGGGCTCCACCCGGTGGGGCGGAGAAGGCGGTTACGCGGCATCCGACAG‑CTGACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGGGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCC < 2:7230311/296‑1 ACGCCCAGGCCGGTGGCCGCATGCGACGCTGGCGCGTCGGAGCTGCCGTACTGCTCCGTGAAGTGATCAACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCGAGCCGGTGGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC < 2:1659346/298‑1 CTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGA < 2:5819042/180‑1 gcgcgtactgtgAGGCCGAAACGGCCGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCAGCATCCGACAG‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAT < 2:5625084/286‑1 CGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGA > 2:759648/1‑165 CGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCG > 2:4215212/1‑156 acgaggtcgACACCGCCGTGAAGGGGGCCACCCGGTAGGTGGGATAAGGCGGTGAGGCCGCGTCCGAGAG‑CTAACCCCCAGGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATC < 2:4839416/288‑1 aggcgcACACCCCTGTGAAGGGCGCCACCCCGTAGGCGGGGTCAGGCGGTTACGCCGCAACCGAGAT‑CTAGCGCCCATGCGGGTTGCCGGATGCGACGCTGGCGCCG‑CGTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAA < 2:545754/291‑1 accctcggtaAAGTGATCCCCCCCTTAGGCTGGATAAGCCGTTTACGCTGCATCCGCCAT‑CTAGCGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTGATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCA < 2:2554621/286‑1 ccaggTAAGGCGTTTATGGCGCATCCGACCT‑CTAACGCCCAAGCCGTTTGCCGGTTGCGACGCTGGCGCTT‑CTTAGCAGGCCTACACCGCTGTGAAGAGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTC < 2:7713989/293‑1 cTGGGTAAGGCGGTGCCGCGGCAT‑CGAGATGCAAACGCCCAGCCCGGTGGCGGAATGCGACGTTGGCGCGG‑CTTATCAGGCCTAAACCGCTTTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATACGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTC < 2:7273769/297‑1 GGATAAGGCGGGCACACCGCAGCGGATAG‑CTAACGCGCAGGCCGGTTGCGGGATGGGAAGCTGGCACGT‑CGTATCAGGCCTAAACCGCCGTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTGGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTT < 2:6155022/298‑1 ggTAAGGCGGTAAGGCCGATGCCGACGT‑CGAACGCCCAGGCGGGTAGCCGAAGGGGACGCTGGAGGGG‑CTTGTAAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTGGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTA < 2:1211725/296‑1 GATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTA < 1:5695484/298‑1 GATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTG > 2:1395369/1‑164 TAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATC < 1:1815834/298‑1 TAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCCACGCTGGCGCGTCTTATC > 1:6929597/1‑298 AAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAC > 2:2657869/1‑212 AAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT > 1:6167967/1‑296 AGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAG < 1:4754486/298‑1 GCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGAC > 1:2430668/1‑133 CGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCC < 1:3208511/298‑1 CGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCAAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGGGGTTCCGCCGCATCCAGACA‑CTAACGCCGAAGCCGGTTGCCTGGACCGACCCTGGCCCGGCTTCACAGGCC > 2:7985877/1‑298 GGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGT < 2:1990737/99‑1 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atccgaagacaAACGCCCACGCCGGTTGCCGGAGGCGACGCTGGCGCGT‑CGTAACATGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TG < 2:916261/287‑1 cggcCAT‑CGAGCGCCGAGGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCAGCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TG < 2:2650517/292‑1 CGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGGGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGTCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATACGACCCTGGCGCGGACTCTCAGGCCTACCGCGCTGgcaag > 2:3518027/1‑293 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CCGACATCCAGCGGCCGAGCAGGTGGCCTGAGGGGAAGATGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAA < 2:4827867/298‑1 CCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTT < 1:50592/204‑1 ACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TGAAGTGCTCCACCCCGT < 1:855515/196‑1 AACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT < 1:3021368/151‑1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAT‑CTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGT‑CTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_010468/1591870‑1591575 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCC‑GACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTG‑TGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAA < NC_010468/1592089‑1591806 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |