New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_010468 | = 3033046 | 125 (0.130) | coding (1062/1422 nt) | ECOLC_RS14830 | phage tail protein |
Only 100 of 579 total aligned reads displayed.
CATCGGTAGAGTGACGATTAACTGAGATTGCGTATGCTTCGTTAGTCGAGCCAGAAACTTTTGTAGCAAACACAGCAAACAGGACACCAAATGACTGGGGCCATTTATAGCCTGACAGCTGATAATTACCATTATTCAGTGTTACAGCTTTGGCTGCTGCACTTGATGGAATCGTCAGCCACTGGAGTATCAACCCTCCTGGCAAAAGTTGTTTTCCGTAATAATCCCTCACCCCACTAAATGAAACCATGTCCGGTATCTGATTTTCCCCTGTGCCCACATCCCGTTTTGCCGCCTCTCCCAAACCAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGT > NC_010468/3032751‑3033343 | aTCGGTAGAGTGACGATTAACTGAGATTGCGTATGCTTCGTTAGTCGAGCCAGAAACTTTTGTAGCAAACACAGCAAACAGGACACCAAATGACTGGGGCCATTTATAGCCTGACAGCTGATAATTACCATTATTCAGTGTTACAGCTTTGGCTGCTGCACTTGATGGAATCGTCAGCCACTGGAGTATCAACCCTCCTGGCAAAAGTTGTTTTCCGTAATAATCACTCACCCCACTAAATGAAACCATGTCCGGTATCTGATTTTCCCCTGTCCCCACATCCCGTTTTGCCGCCtct < 2:6149872‑M2/298‑4 (MQ=255) 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tGCCGCCTCTCCCAAACCAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGa > 2:1787134/1‑297 (MQ=255) cgcctatcccaaaccaacgtttatcgaaatgcagagattacggctaactggcatcatctccggtttttattcagagggatgatcatgcttattggctatgtacgcgtgtcaacaaatgaccagaacaccgatttgcaacgtaatgcactgaactgcgcgggatgtgagcggatttttgaggataaaatcagtggcaccaagtccgacagaccggggctgaaaaagctgctcaggacactatcggcaggtgacacactggttgtctggaagctggacaggttggggcgcagtatgcggc > 2:7163175‑M2/1‑4 (MQ=255) cgccTCTCCCAAACCAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAAc > 2:7987064/1‑298 (MQ=255) | CATCGGTAGAGTGACGATTAACTGAGATTGCGTATGCTTCGTTAGTCGAGCCAGAAACTTTTGTAGCAAACACAGCAAACAGGACACCAAATGACTGGGGCCATTTATAGCCTGACAGCTGATAATTACCATTATTCAGTGTTACAGCTTTGGCTGCTGCACTTGATGGAATCGTCAGCCACTGGAGTATCAACCCTCCTGGCAAAAGTTGTTTTCCGTAATAATCCCTCACCCCACTAAATGAAACCATGTCCGGTATCTGATTTTCCCCTGTGCCCACATCCCGTTTTGCCGCCTCTCCCAAACCAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAGCGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGT > NC_010468/3032751‑3033343 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |